實驗介紹：
Label free是一種不依賴于同位素標記的非標記蛋白組定量技術，通過液質聯(lián)用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)標，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質時所產(chǎn)生的質譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應肽段的信號強度，從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。
實驗流程：
應用方向：生物領域各個研究方面，如：
1. 農(nóng)林領域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等
2. 畜牧業(yè)：肉類及乳品質研究，致病機理研究等
3. 基礎醫(yī)學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治療等
4. 生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等
5. 微生物領域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等
6. 海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
7. 生物能源、環(huán)境科學領域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危定風險評估研究等
8. 食品營養(yǎng)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等
數(shù)據(jù)分析
標準數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
蛋白質總鑒定數(shù)量分析 | 蛋定與定量結果統(tǒng)計、差異結果統(tǒng)計、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質功能分析 | 亞細胞定位、結構域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網(wǎng)絡分析 |
質量控制分析 | 肽段離子質量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質豐度比分布 |
高級數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
WGCNA共表達分析 | 獲得與表型強關聯(lián)的核心蛋白質 |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質的表達趨勢模式 |
技術優(yōu)勢
? 無需昂貴的同位素標記試劑，實驗周期短
? 可用于不同物種間的“有無差異蛋白”比較
? 克服標記定量技術在樣本數(shù)量的上限制，靈活方便
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