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北京易科泰生態(tài)技術(shù)有限公...

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高通量藻類表型成像技術(shù)應(yīng)用-定量反演條斑紫菜的重要光合色素含量

閱讀:991      發(fā)布時間:2023-2-13
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AlgaTech®高通量藻類表型分析平臺是易科泰生態(tài)技術(shù)公司自主設(shè)計研發(fā)的科研級一體化表型成像分析系統(tǒng)。該平臺采用PTS(Plant-to-Sensor)技術(shù),集雙軌式同步升降控制、多傳感器成像、高精度移動掃描平臺、一鍵式光源控制、多源數(shù)據(jù)采集等功能于一體,同時配備高光譜成像、葉綠素熒光成像、多光譜熒光成像、RGB成像單元,樣品可以放置在掃描平臺上自動運送至成像單元進行成像分析,是目前功能完備的高通量表型成像分析系統(tǒng),可為植物表型、生理生態(tài)、藻類及海洋植物、海水養(yǎng)殖、生物量評估、種質(zhì)資源等研究領(lǐng)域提供一站式解決方案。

 

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中國海洋大學(xué)藻類遺傳學(xué)與育種研究團隊使用此平臺的VNIR高光譜成像模塊對條斑紫菜的重要光合色素含量進行了預(yù)測模型的構(gòu)建,展現(xiàn)了AlgaTech®高通量藻類表型分析平臺在藻類表型研究中的巨大潛力。

條斑紫菜是一種具有重要經(jīng)濟價值的紅色巨藻,藻紅蛋白(PE)、藻藍蛋白(PC)、別藻藍蛋白(APC)和葉綠素a(Chla)是重要的光合色素,其含量和比例不僅影響光合生理,同時影響著藻體的蛋白質(zhì)含量和色澤等經(jīng)濟性狀。傳統(tǒng)的測定方法費時費力、成本較高且對操作者的經(jīng)驗依賴性強,無法滿足大規(guī)模、高通量的研究。本研究利用高光譜成像技術(shù)對條斑紫菜的3種主要藻膽蛋白PE、PC、APC和Chla的含量進行了高通量、無損的定量分析。

 

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本研究使用高光譜成像模塊采集了400-1000nm的光譜信息,結(jié)合兩種機器學(xué)習(xí)方法——偏最小二乘回歸(PLSR)和支持向量機回歸(SVR,成功建立了PE、PC、APC和Chla含量的最佳預(yù)測模型。利用野生樣本對模型的精確性進行了驗證,確證了模型具有較高的預(yù)測精度,表明模型具有良好的適用性。

 

研究表明,基于高光譜成像技術(shù)可以快速、準確、無創(chuàng)地對條斑紫菜的PE、PC、APC和Chla含量四種重要光合色素進行定性/定量分析,性狀獲取效率較傳統(tǒng)方法提升約50倍,為后續(xù)條斑紫菜的表型組學(xué)和遺傳育種研究提供了一種有效、可靠的方法。

 

參考文獻:Quantification of Photosynthetic Pigments in Neopyropia yezoensis Using Hyperspectral Imagery

 

易科泰生態(tài)技術(shù)公司提供藻類生物質(zhì)能源研究及高通量表型研究技術(shù)全面解決方案,包括藻類葉綠素熒光與光合作用測量藻類葉綠素熒光成像分析、藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測AlgaTech高通量藻類表型分析等。

 

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