液相色譜柱的選擇直接影響了分離效果的好壞，選擇合適的色譜柱可以縮短法開發(fā)所需的時間，并且使方法更具穩(wěn)定性。
液譜相色柱選擇方法和液相色譜柱選擇的簡單思路如下：
1.確定分離目的確定你的應(yīng)用是否要求高分離度、短分析時間、高靈敏度、長柱壽命，低的操縱本錢等等。
2.評估分析物的化學(xué)性質(zhì)評估分析物的化學(xué)性質(zhì)..諸如化學(xué)結(jié)構(gòu)、溶解性、穩(wěn)定性等等。
3.選擇合適的色譜柱了解色譜填料的物理和化學(xué)性質(zhì)。
  液相色譜柱由檢測器、高壓液體泵及液相色譜柱等三部分組成，其中液相色譜柱的正確安裝和使用，是液相色譜工作的關(guān)鍵;同時也是液相色譜工作者獲得正確且可靠的實驗數(shù)據(jù)的必經(jīng)之路。
  液相色譜柱在使用前，進(jìn)行柱的性能測試，并將結(jié)果保存起來，作為今后評價柱性能變化的參考。在做柱性能測試時要按照色譜柱出廠報告中的條件進(jìn)行（出廠測試所使用的條件是正常條件），只有這樣，測得的結(jié)果才有可比性。液相色譜柱的分離作用是在填料與流動相之間進(jìn)行的，柱子的分類是依據(jù)填料類型而定。但要注意：柱性能可能由于所使用的樣品、流動相、柱溫等條件的差異而有所不同。色譜柱在使用一段時間后,常遇到柱子受污染,柱效下降的問題,采用適當(dāng)?shù)姆椒▽ιV加以保護和再生,能夠延長色譜柱的使用壽命。