蛋白質(zhì)工程的核心內(nèi)容之一就是收集大量的蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)的信息，以便建立結(jié)構(gòu)功能之間關(guān)系的數(shù)據(jù)庫(kù)，為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能之間關(guān)系的理論研究奠定基礎(chǔ)。

 

    蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)是指多肽鏈的氨基酸殘基的排列順序。

 

    蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)是指多肽鏈借助于氫鍵沿一維方向排列成具有周期性的結(jié)構(gòu)的構(gòu)象，是多肽鏈局部的空間結(jié)構(gòu)（構(gòu)象），主要有。螺旋、p折疊、p轉(zhuǎn)角和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)等幾種形式。

 

 

    三級(jí)結(jié)構(gòu)是指整條多肽鏈的三維結(jié)構(gòu)，包括骨架和側(cè)鏈在內(nèi)的所有原子的空間排列。如果蛋白質(zhì)分子僅由一條多肽鏈組成，三級(jí)結(jié)構(gòu)就是它的zui高結(jié)構(gòu)層次。

 

    四級(jí)結(jié)構(gòu)是指在亞基和亞基之間通過疏水作用等次級(jí)鍵結(jié)合成為有序排列的特定的空間結(jié)構(gòu)。亞基通常由一條多肽鏈組成，有時(shí)含兩條以上的多肽鏈，單獨(dú)存在時(shí)一般沒有生物活性。

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