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千種單基因病計劃”再獲新進展 外顯子測序揭示NCSTN基因的突變可導(dǎo)致逆向性痤瘡的發(fā)生
閱讀:762 發(fā)布時間:2011-4-92011年3月24日,由華大基因和安徽醫(yī)科大學(xué)*附屬醫(yī)院張學(xué)軍教授科研團隊合作研究的成果《利用外顯子測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)并驗證了NCSTN基因的突變可導(dǎo)致逆向性痤瘡的發(fā)生》在雜志Journal of Investigative Dermatology 上在線發(fā)表,這是我國科學(xué)家將外顯子測序技術(shù)應(yīng)用于單基因病致病基因?qū)ふ业挠忠豁椫匾晒?,?em>NCSTN基因突變的檢測和逆向性痤瘡及其相關(guān)疾病的診斷、治療具有十分重要的意義。
逆向性痤瘡(Inversa acne, AI)又名化膿性汗腺炎,是一種少見的常染色體顯性遺傳病,以反復(fù)發(fā)生皮膚膿腫、竇道及瘢痕形成為特征性表現(xiàn)。本病多發(fā)生于女性,由于大汗腺導(dǎo)管閉塞繼發(fā)細菌感染所致。除皮損外,AI還可伴發(fā)關(guān)節(jié)炎或者繼發(fā)鱗狀上皮細胞癌,不僅對患者的健康和美觀均有極大影響,而且可造成患者嚴(yán)重的身心負擔(dān)。
本研究選取了一個中國漢族人四代家系,該家系在2006年由張學(xué)軍教授領(lǐng)導(dǎo)的科研團隊利用全基因組掃描結(jié)合連鎖分析的方法,將疾病的致病基因定位于1p21.1-1q25.3區(qū)域,這項成果在同一雜志(Journal of Investigative Dermatology)發(fā)表。由于連鎖區(qū)域范圍較大,包含大約900個基因,若要進行精細定位,則需要尋找大的家系,這將是一個耗時費力的過程,而外顯子測序技術(shù)解決了這一難題。
本研究采用Agilent全外顯子組捕獲芯片并結(jié)合高通量測序,對該家系中的兩名患者進行外顯子測序,平均每個個體發(fā)現(xiàn)遺傳變異42,678個,其中包括34,570個非同義突變,通過與公共數(shù)據(jù)庫比對過濾分析并結(jié)合連鎖定位的結(jié)果,推測出NCSTN基因的第11個內(nèi)含子供體位置的突變可能和AI的發(fā)病相關(guān)。后期驗證階段,在另一AI家系中發(fā)現(xiàn)該基因的第3號外顯子存在一個2bp核苷酸的缺失;同時,在這兩個家系的所有正常對照和90名正常人中均未發(fā)現(xiàn)這兩個突變,從而證實NCSTN基因與逆向性痤瘡的發(fā)生相關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn)了NCSTN基因的2個新的突變位點,NCSTN基因編碼的蛋白是γ分泌酶復(fù)合體的四個亞單位之一,而γ分泌酶與AI及阿爾采默氏病的發(fā)病密切相關(guān),因此,該基因突變的檢測對AI及其相關(guān)疾病的診斷、治療具有十分重要和深遠的意義。
新一代測序技術(shù)的產(chǎn)生和發(fā)展為疾病研究帶來了新的機遇。作為一種、快速和高性價比的研究方法,外顯子測序技術(shù)廣泛應(yīng)用于遺傳病的研究。自2009年以來,*雜志上相繼發(fā)表了多篇將外顯子測序技術(shù)應(yīng)用于單基因病的研究成果,并已經(jīng)獲得單基因病領(lǐng)域科學(xué)家的廣泛認(rèn)可。目前,應(yīng)用外顯子測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)并統(tǒng)計稀有突變在不同人群中的分布頻率,并結(jié)合疾病臨床表型等背景知識在基因?qū)用娼庾x疾病,已經(jīng)成為疾病研究的趨勢。
華大基因于2010年5月啟動“中華千種單基因病計劃”至今,已與國內(nèi)外50多家科研醫(yī)療單位合作,啟動了約150種疾病致病基因的研究,有50多個項目處于后期的驗證階段。2011年,我們期望挖掘更多的科學(xué)發(fā)現(xiàn),華大基因期待與您的合作!