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中科院Nature發(fā)表微生物研究新成果
閱讀:870 發(fā)布時間:2014-6-20來自中科院生物物理研究所的研究人員在新研究中揭示出了,細(xì)胞壁成分脂多糖被傳遞并插入到細(xì)菌外膜中的分子結(jié)構(gòu)機制,相關(guān)論文“Structural basis for lipopolysaccharide insertion in the bacterial outer membrane”發(fā)表在6月18日的《自然》(Nature)雜志上。
論文的通訊作者是中科院生物物理研究所的黃億華(Yihua Huang)研究員,其主要從事膜蛋白結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究,研究方向包括膜蛋白的生成與蛋白質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)運機理;及生物膜的生成。
在革蘭氏陰性菌的表層,有由肽葡聚糖形成的細(xì)胞壁,在壁的外面,又有由蛋白質(zhì)、磷脂質(zhì)、脂多糖形成的膜層,與里面的細(xì)胞質(zhì)膜相對應(yīng),特稱此層為細(xì)菌外膜。作為革蘭氏陰性菌的*結(jié)構(gòu),外膜像一個雙軌道結(jié)構(gòu),為兩個電子致密層夾一個透明層,狀似細(xì)胞膜,但在生化上又不同于細(xì)胞膜。
脂多糖(LPS)是革蘭氏陰性菌細(xì)胞壁外膜的*組成成分,結(jié)構(gòu)較復(fù)雜,由類脂A、核心多糖和O-特異側(cè)鏈3部分組成。類脂A是革蘭氏陰性菌致病性內(nèi)毒素的物質(zhì)基礎(chǔ)。LPS的結(jié)構(gòu)變化決定了革蘭氏陰性菌細(xì)胞表面抗原決定簇的多樣性。與磷壁酸相似,LPS具有吸附Mg,Ca等陽離子提高這些離子在細(xì)胞表面濃度的作用。
此外,細(xì)菌外膜的LPS層賦予了革蘭氏陰性菌強有力的屏障對抗抗生素一類的有毒化合物進(jìn)入細(xì)胞,使得細(xì)菌能夠在惡劣的環(huán)境中生存。LPS還是先天免疫反應(yīng)的強有力的激活劑,作為保守性的病原體相關(guān)分子模式(PAMP)為先天免疫受體所識別。鑒于這些重要的功能,LPS無疑多于大多數(shù)革蘭氏陰性菌至關(guān)重要,能夠干擾它的生物信號通路將為開發(fā)出對抗致病菌的新型抗生素提供*的機會(延伸閱讀:Nature揪出超級耐藥菌的軟肋)。
在細(xì)菌中,是借助于7個*的脂多糖轉(zhuǎn)運(Lpt)蛋白來將LPS從內(nèi)膜通過胞質(zhì)送至表面。在7個Lpt蛋白中,LptD-LptE復(fù)合物負(fù)責(zé)將LPS插入到外膜的外部小葉(external leaflet)中。然而,目前對于LPS插入外膜及裝配的機制仍不是很清楚。
在這篇文章中,研究人員報告稱獲得了來自福氏志賀氏菌(Shigella flexneri),分辨率為2.4埃的110KD LptD–LptE膜蛋白復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)。這一結(jié)構(gòu)揭示出了一個的兩蛋白“插頭與桶”( plug-and-barrel)的結(jié)構(gòu),LptE嵌入到了LptD形成的由26股β折疊圍成的β桶狀(β-barrel)結(jié)構(gòu)中。重要的是,兩個脯氨酸殘基使得頭兩個β折疊的二級結(jié)構(gòu)扭曲,減弱了它們與鄰近β折疊的相互作用,在桶壁上生成了一個潛在的入口,使得LPS能夠側(cè)向擴散到外膜。