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同濟(jì)大學(xué)Cell發(fā)布干細(xì)胞重要研究成果
閱讀:804 發(fā)布時(shí)間:2015-5-25來(lái)自同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院、加州大學(xué)洛杉磯分校、南昌大學(xué)等處的研究人員報(bào)告稱,他們利用單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù),同時(shí)運(yùn)用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA),揭示出了激活休眠神經(jīng)干細(xì)胞的信號(hào)。這一重要的研究結(jié)果發(fā)布在5月21日的《細(xì)胞》(Cell)雜志上。
同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院的李思光(Siguang Li)教授以及孫毅(Yi Eve Sun)教授是這篇論文的共同工作。李思光教授主要從事細(xì)胞分化過(guò)程中的表觀遺傳調(diào)控機(jī)理研究,著重研究干細(xì)胞定向分化過(guò)程中的非編碼RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和RNA介導(dǎo)的DNA甲基化調(diào)控機(jī)制。孫毅教授的主要研究方向是神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育和疾病的表觀遺傳學(xué)及分子機(jī)制研究(延伸閱讀:中國(guó)學(xué)者Cell stem cell基因編輯突破性成果 )。
成體哺乳動(dòng)物大腦中的神經(jīng)發(fā)生貫穿整個(gè)生命周期。神經(jīng)干細(xì)胞的分化及自我更新是這一過(guò)程的基礎(chǔ)并對(duì)神經(jīng)組織的修復(fù)和維持起著重要作用。許多神經(jīng)退行性疾病也與其功能的失調(diào)相關(guān)。深入研究成體神經(jīng)干細(xì)胞zui終將有助于干細(xì)胞治療方案的確定。然而由于成體神經(jīng)干細(xì)胞相對(duì)稀缺以及它們周圍環(huán)境的復(fù)雜性,使得確定這些細(xì)胞的分子生物學(xué)性狀尤其具有挑戰(zhàn)性。
單細(xì)胞RNA測(cè)序(single-cell RNA-sequencing, SCRS)是分析單個(gè)細(xì)胞或微量RNA中基因組表達(dá)的一個(gè)強(qiáng)有力的技術(shù)。與微陣列技術(shù)相比, SCRS能檢測(cè)出更多的轉(zhuǎn)錄組, 靈敏度更高; 既能分析同一基因的多個(gè)轉(zhuǎn)錄本及其對(duì)應(yīng)的蛋白類型, 也能檢測(cè)已知基因中新的剪接點(diǎn); 還具有準(zhǔn)確度高、噪音低等優(yōu)點(diǎn)。近年來(lái)研究人員開(kāi)始利用這一技術(shù)來(lái)克服研究中起始樣本量少的瓶頸。
在這篇Cell文章中作者們報(bào)告稱通過(guò)采用單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù),同時(shí)運(yùn)用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA),揭示出了成年小鼠前腦神經(jīng)發(fā)生區(qū)域CD133+/GFAP?室管膜(E)細(xì)胞的分子特征。令人驚訝的是,他們發(fā)現(xiàn)室管膜CD133+/GFAP?休眠細(xì)胞*基因網(wǎng)絡(luò)中的重要樞紐基因,包含較多的免疫應(yīng)答基因以及血管生成因子受體編碼基因。給予血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(VEGF)可激活側(cè)腦室以及第四腦室CD133+室管膜神經(jīng)干細(xì)胞(NSCs),加上堿性成纖維生長(zhǎng)因子(bFGF)則誘導(dǎo)了隨后的神經(jīng)譜系分化和遷移。