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噬菌粒文庫的保險性儲存
閱讀:1005 發(fā)布時間:2010-8-6制備好DNA文庫后,用標準方法將DNA電轉人大腸桿菌中,得到轉化株并保存,然后制備噬菌體用于分析和篩選。在液體培養(yǎng)基中將轉化后的細胞進一步培養(yǎng)到對數(shù)生長期。經(jīng)過在液體培養(yǎng)基中的增殖,一些菌液用于甘油保種,剩下的用于制備噬菌體。或者可以通過將整個轉化體系鋪在含有選擇性抗生素的瓊脂平板上,而直接從固體培養(yǎng)基上得到轉化株。相信這個方法可以在保險性儲存的過程中,阻止一些特殊克隆的優(yōu)勢生長。
電轉化和噬菌粒文庫的儲存,甘油保種的制備以及篩選所需的噬菌體的制備
[器材和試劑]
● 2TY/Carb/Tet瓊脂平板 (31g/L2TY,15g/L瓊脂,100/lg/m1羧芐青霉素和10ug/ml四環(huán)素):取31g 2TY、15g瓊脂,加水至1L,然后高壓滅菌。待溶液冷卻至40℃,然后加入lml羧芐青霉素(100mg/m1)和1ml四環(huán)素(10mg/m1),充分混勻后鋪于皮氏培養(yǎng)皿中。
● 大腸桿菌電感受態(tài)細胞;如XLl—Blue的電感受態(tài)細胞(Stratagene)
● 將DNA電轉進大腸桿菌的試劑和設備
● 2TY和2TY/G1u培養(yǎng)基(含有或不含2%葡萄糖的31 g/L的2TY培養(yǎng)基):將31g 2TY加入1 L水中,攪拌溶液讓2TY溶解后滅菌,待溶液冷卻,取100m1分裝入一個無菌的錐形瓶中,并加入10m1 20%(w/v)的葡萄糖(過濾滅菌)。
● 10mg/m1的四環(huán)素:溶于超純水后過濾滅菌
● 100mg/m1的羧芐青霉素:溶于超純水后過濾滅菌
● 100mg/m1的卡那霉素:溶于超純水后過濾滅菌
● 無菌的-50%的甘油水溶液
● 卡那霉素抗性的VCS—M13輔助噬菌體儲液(1010pfu/m1)(Stratagene)
● PEG-NaCl溶液:20%PEG,2.5mol/l NaCl
● 磷酸鹽緩沖液(PBS) (2 mm01/L NaH2P04,16mmol/L Na2HP04,150mm01/L NaCl,pH 7.4~7.6):將8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g NaH2PO4溶于800m1去離子水中,用鹽酸調節(jié)pH至7.4,然后加水至1L。
● DNA文庫
● Oakridge 型 40m1 離,乙,管 (Nalge Nuno)
● Sorvall RC 5Cplus型離心機及SS—34型轉子,或其替代物
[方法]
1,取10/Il得自實驗方案8.2中步驟6的混合物, 電轉入大腸桿菌的dut+ung+型菌株 (如XLl—B1ue) 中。大文庫容量的文庫可能需要多次電轉化。在我們對泛素系統(tǒng)的研究工作中,我們將文庫電轉入購自Strat agene的XLl—Blue電感受態(tài)細胞。可以替換的菌株包括SS320或TGl。
2.將電轉后細胞的適當稀釋液鋪于2TY/Carb/Tet0瓊脂平板中, 以測定轉化株的數(shù)量。隨后可以使用平板上的菌落,通過PCR、限制性酶酶切及測序,來檢驗文庫。
3.在250ml的錐形瓶內,將電轉后的菌液(得自步驟1)加入到40m1含有12ul 100mg/ml的羧芐青霉素和20/A1 10mg/ml的四環(huán)素的2TY/Glu培養(yǎng)基中。
4.將菌液在37℃振蕩培養(yǎng)至對數(shù)生長期,直到OD600=0.5,這通常需要4—5個小時。l小時后將12ul 100mg/ml的羧芐青霉素20ul 10mg/ml的四環(huán)素①加入到錐形瓶中。
5.取出4m1菌液,加入1.5ml 50%的甘油,每管1m1分裝后于-80℃儲存。
6.將4ml VCSMl3輔助噬菌體(約1010pfu/ml)加入到剩余的菌液中,以使噬菌體與大腸桿菌之比達到10倍左右。將錐形瓶子37℃靜置15~30分鐘。
7.將l/4的菌液(約10ml),分別加入到4個含有100ml 2TY/Glu培養(yǎng)基、75ul 1100mg/ml的羧芐青霉素和100ul 10mg/ml的四環(huán)素的250m1錐形瓶中。將錐形瓶于37℃振蕩培養(yǎng),直到菌液開始輕微變渾(約2小時)。
8.加入70ul 100mg/ml的卡那霉素,并于37℃振蕩培養(yǎng)過夜。
9.第二天上午,將每份過夜培養(yǎng)的菌液各自分裝入3只Oakridge離心管中,在Sorvall RC 5C plis型離心機中使用SS—34轉子, 于4℃12000 r/min離心15分鐘。
10.從每只離心管中取出30ml上清液,并與7.5ml PEG—NaCl溶液混合,以沉淀噬菌體顆粒。將這些離心管于冰上放置1小時,偶爾混勻液體。
11.如步驟9中所述,于12000r/min離心15分鐘,吸出并棄去上清液。
12.將噬菌體沉淀重懸于PBS中,每管1ml。將重懸后的噬菌體轉移至新的小離心管中,開用小型離心機于10000r/min離心,除去不溶性的殘渣。將干凈的上清液轉移至新的小離心管中并于4℃保存。