目錄:北京索萊寶科技有限公司>>生化試劑>>胺、酸和鹽>> S8030N-(3-氨基丙基)-1,4-丁二胺
產(chǎn)品編號 | 規(guī) 格 |
S8030-1 | 1g |
N-(3-氨基丙基)-1,4-丁二胺相關(guān)實(shí)驗(yàn):
一氧化氮(nitricoxide,NO)是生物體內(nèi)發(fā)揮重要生理功能的氣體小分子。
1998年, 美國藥理學(xué)家RobertF.Furchgott、LouisJ.Ignarro及FeridMurad因揭示了NO在心血管系統(tǒng)中的信號分子作用而獲得諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)[1],這將人們對NO的相關(guān)研究推向了新的高潮。在生物體內(nèi),NO通過一氧化氮合酶(nitricoxidesynthase,NOS)利用L-精氨酸(L-Arg)和分子氧作為底物,在還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷(nicotinamideadeninedinucleotide2'-phosphate,NADPH)輔酶作為輔助因子提供電子的條件下,由黃素腺嘌呤二核(flavinadeninedinucleotide,F(xiàn)AD)、黃素單核苷酸(flavinmononucleotide,F(xiàn)MN)、四氫葉酸(tetrahydrofolate,THF)傳遞電子,催化L-Arg的兩個(gè)等價(jià)胍基氮之一經(jīng)氧化反應(yīng)生成NO和L-瓜氨酸(L-citrullin)[2](圖1)。
NOS有三種同工酶,包括:主要存在于神經(jīng)系統(tǒng)中的神經(jīng)型一氧化氮合酶(neuronalnitricoxidesynthase,nNOS,是先被發(fā)現(xiàn)的NOS,故又稱NOS-Ⅰ),存在于巨噬細(xì)胞、肝細(xì)胞、神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞中的可誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(induciblenitricoxidesynthase,iNOS,又稱NOS-Ⅱ),以及主要存在于血管內(nèi)皮細(xì)胞中的內(nèi)皮型一氧化氮合酶(endothelialnitricoxidesynthase,eNOS,又稱NOS-Ⅲ)[3,4]。其中,nNOS和eNOS均為構(gòu)成型酶,統(tǒng)稱為構(gòu)成型一氧化氮合酶(constitutivenitricoxidesynthase,cNOS)在神經(jīng)系統(tǒng)中,NO作為一種重要的信使分子,參與了學(xué)習(xí)與記憶等重要的神經(jīng)生理活動(dòng),同時(shí)對腦部血流具有調(diào)節(jié)作用,并參與神經(jīng)系統(tǒng)的免疫防御[5~8]。
而另一方面,過量的NO又與腦缺血損傷、早老性癡呆及帕金森氏癥等神經(jīng)系統(tǒng)疾病的發(fā)生、發(fā)展有著密切的關(guān)系[9,10]。因此,在正常生理?xiàng)l件下,神經(jīng)系統(tǒng)中存在著從時(shí)間和空間上調(diào)控NO產(chǎn)生、釋放、擴(kuò)散與滅活的機(jī)制,而這主要是通過調(diào)控nNOS的活化與去活化實(shí)現(xiàn)的。nNOS除了在神經(jīng)系統(tǒng)中具有重要功能外,在骨骼肌、心肌和平滑肌當(dāng)中也有表達(dá)分布,在這些組織中,NO對血流調(diào)節(jié)和肌肉收縮都具有重要的調(diào)控作用[11~13]。 作為一種構(gòu)成型一氧化氮合酶,nNOS的活性主要依賴于翻譯后水平上鈣離子(Ca2+)/鈣調(diào)蛋白(calmodulin,CaM)的調(diào)控。隨著研究的深入,越來越多的證據(jù)表明,生物體內(nèi)的nNOS調(diào)控有著復(fù)雜的機(jī)制,其酶活性在多個(gè)水平上受到調(diào)節(jié),包括二聚化、多位點(diǎn)的磷酸化與去磷酸化,以及蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用等。本文將著重對nNOS活性的調(diào)控機(jī)制進(jìn)行綜述。 nNOS的二聚化 NOS的活性受到酶構(gòu)型的影響,二聚化對于NOS三種同工酶的活性都是*的。每一種NOS同工酶都具有相同的催化中心結(jié)構(gòu):羧基端為還原酶區(qū)(reductasedomain,NOSred),該區(qū)域與NADPH結(jié)合,還包含F(xiàn)AD和FMN的結(jié)合位點(diǎn);氨基端為氧化酶區(qū)(oxygenasedomain,NOSox),此區(qū)域與底物L(fēng)-Arg結(jié)合,還包含一個(gè)四氫生物蝶呤(BH4)結(jié)合位點(diǎn)和一個(gè)細(xì)胞色素P-450樣亞鐵血紅素輔基的活性位點(diǎn)。NADPH提供的電子通過FAD和FMN,由還原酶區(qū)向氧化酶區(qū)傳遞[14]?;罨膎NOS為二聚體形式,兩個(gè)單體的氧化酶區(qū)之間形成的擴(kuò)大界面為BH4和L-Arg創(chuàng)造了高親和力的結(jié)合位點(diǎn)[15,16],從而促進(jìn)電子的傳遞。一些nNOS的抑制劑,如7-硝基吲唑(7-NI),可以降低BH4和L-Arg與nNOS的親和力,從而抑制nNOS的活性[17]。對iNOS的研究發(fā)現(xiàn),電子是由一個(gè)單體的還原酶區(qū)向另一個(gè)單體的氧化酶區(qū)傳遞的,這也可能是NOS在單體形式下不表現(xiàn)活性的原因[18]。
此外,穩(wěn)定的二聚體形式的nNOS更不易被水解,一些nNOS的底物類似物,如N(G)-硝基-L-精氨酸,可以穩(wěn)定nNOS的二聚化形式,使其不發(fā)生泛素化,同樣,BH4和亞鐵血紅素的結(jié)合也會促使nNOS形成穩(wěn)定的二聚體[19]。 nNOS的磷酸化調(diào)控 nNOS的活性受到多種激酶和磷脂酶的調(diào)控。蛋白激酶C(proteinkinaseC,PKC)、鈣調(diào)蛋白依賴激酶(CaMkinases,CaMk)Ⅰ和Ⅱ,以及蛋白激酶A(proteinkinaseA,PKA),均可通過磷酸化修飾nNOS而調(diào)控其活性。nNOS有多個(gè)可發(fā)生磷酸化的位點(diǎn),不同位點(diǎn)發(fā)生的磷酸化和去磷酸化,對nNOS的酶活性有不同的影響。CaMKⅠ磷酸化nNOS的Ser741殘基,CaMKⅡ磷酸化Ser847殘基,通過抑制與Ca2+/CaM的結(jié)合而降低nNOS的活性[20,21]。相反,蛋白磷酸酶1可以通過降低Ser847位的磷酸化水平使nNOS的活性升高[22]。發(fā)生在Ser1412殘基的磷酸化可增加nNOS的活性,而該位點(diǎn)的去磷酸化則使nNOS的活性降低[23]。 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用對nNOS活性的調(diào)控 近年來的研究發(fā)現(xiàn),nNOS可以與多種蛋白發(fā)生相互作用,這些相互作用的發(fā)生可以影響nNOS在細(xì)胞中的定位或直接影響nNOS的活性。
nNOS基因的外顯子2編碼了一段特殊肽段—— —PDZ結(jié)構(gòu)域(PSD-95/Dlg/ZO-1homologydomain),該結(jié)構(gòu)域不但參與nNOS的二聚化(活化),由該結(jié)構(gòu)域介導(dǎo)的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用也是nNOS與其它蛋白互作的重要方式之一,與nNOS的空間定位及功能有著密切的關(guān)系。鈣調(diào)蛋白 NOS的還原酶區(qū)和氧化酶區(qū)由CaM結(jié)合區(qū)連接起來,只有與CaM結(jié)合之后,NOS才具有催化活性。CaM作為分子開關(guān),能夠促進(jìn)電子從NADPH轉(zhuǎn)移到亞鐵血紅素活性中心的效率[24]。Ca2+/CaM不存在的條件下,電子由FAD向FMN傳遞的速度會降低[25]。iNOS的活性調(diào)控主要發(fā)生在基因轉(zhuǎn)錄水平上,即使在低Ca2+濃度的條件下,CaM與iNOS的結(jié)合也十分緊密,因此,iNOS的活性基本不受Ca2+濃度的影響。cNOS則不同,在靜息態(tài)下,cNOS保持低活性,隨著胞內(nèi)Ca2+濃度的升高,CaM與cNOS結(jié)合而導(dǎo)致酶活性上升,而胞內(nèi)Ca2+濃度降低時(shí),CaM會從cNOS上脫離,使酶活性下調(diào)??梢姡琧NOS的活性受到胞內(nèi)Ca2+濃度的調(diào)控[26,27]。研究表明,熱休克蛋白90能夠促進(jìn)CaM與nNOS的結(jié)合,激活nNOS,進(jìn)而上調(diào)NO的產(chǎn)生[28,29]。N-甲基-D-天冬氨酸受體 膜蛋白N-甲基-D-天冬氨酸受體(N-methyl-D-aspartatereceptor,NMDA-R)在nNOS的活性調(diào)控中起著重要作用。神經(jīng)元中,nNOS的活化依賴于興奮性氨基酸信號偶聯(lián)的Ca2+內(nèi)流信號。在突觸后神經(jīng)元中,谷氨酸等興奮性氨基酸通過NMDA-R引發(fā)Ca2+內(nèi)流,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)Ca2+濃度升高,Ca2+結(jié)合CaM后激活nNOS產(chǎn)生NO,因此,NMDA-R是神經(jīng)系統(tǒng)中重要的nNOS活化因素之一[30]。此外,NMDA-R還可以通過其它方式調(diào)控nNOS的活性。一方面,NMDA-R可以通過CaMKⅡ和鈣調(diào)神經(jīng)磷酸酶(calcineurin)調(diào)節(jié)nNOS的磷
亞精胺對誘導(dǎo)DNA凝聚行為的影響研究
利用原子顯微鏡技術(shù)(AFM)研究了亞精胺加入次數(shù)及不同培養(yǎng)培養(yǎng)時(shí)間對DNA凝聚行為的影響,研究表明,DNA的凝聚次數(shù)由亞精胺的加入次數(shù)跟時(shí)間決定,隨著加入次數(shù)的增加,DNA凝聚減慢,凝聚體尺寸變大,隨著培養(yǎng)時(shí)間的增加,DNA凝聚體減慢,凝聚體尺寸變大,隨著時(shí)間的增加,DNA凝聚體變得越來越緊湊。
有哪些潛在原因可導(dǎo)致用T4 DNA連接酶連接后轉(zhuǎn)化失敗?
反應(yīng)體系內(nèi)無ATP或Mg2+可導(dǎo)致連接失?。菏褂秒S酶提供的buffer或向其它兼容的buffer中加ATP。含ATP的Buffer保存超過1年,其內(nèi)ATP可能會降解,導(dǎo)致連接失敗。當(dāng)補(bǔ)加ATP時(shí),確定補(bǔ)加的是核糖核酸ATP,而不是脫氧核糖核酸ATP,因?yàn)楹笳卟黄鹱饔谩?/span>
反應(yīng)體系中鹽濃度過高或EDTA含量高都可導(dǎo)致連接失?。杭兓疍NA。 去磷酸化步驟完成后,CIP、BAP或SAP失活不*:根據(jù)廠家推薦的方法去除去磷酸化酶DNA濃度過高導(dǎo)致連接后產(chǎn)生的均是線性DNA:保持總DNA濃度在1-10μg/ml之間。連接末端為單堿基突出末端:使用高5μl高濃度連接酶16°C連接。插入片段和質(zhì)粒沒有磷酸化。注意:如果載體已經(jīng)去磷酸化了,而引物又沒有磷酸化會導(dǎo)致連接失敗,訂購磷酸化的引物或?qū)σ镞M(jìn)行磷酸化。
加入過多的連接混合物感受態(tài)細(xì)胞:50μl感受態(tài)細(xì)胞應(yīng)加入1-5μl連接混合物。
插入片段太大,不能進(jìn)行環(huán)化:降低插入片段的濃度,并使用高濃度連接酶16°C連接。
連接酶失活:用lambda HindIII或其它可行的底物進(jìn)行檢測。
連接混合物含有PEG且連接反應(yīng):長時(shí)間地在含有PEG的條件下連接可導(dǎo)致轉(zhuǎn)化效率降低,這可能是由于逐漸產(chǎn)生的大片段線性DNA抑制了轉(zhuǎn)化效率。快速連接試劑盒(NEB# M2200)的buffer含有PEG。
電轉(zhuǎn)化前沒有提純連接混合物:電轉(zhuǎn)化必須去除buffer,否則鹽會導(dǎo)致瞬間放電,擊穿細(xì)胞。可用透析或柱純化的方法純化連接混合物。雖然快速連接試劑盒(NEB# M2200)buffer
中含有的PEG不會導(dǎo)致?lián)舸┘?xì)胞,但是會抑制電轉(zhuǎn)化,所以必須去除,可用柱純化方法去除PEG。 Q2:解決轉(zhuǎn)化問題時(shí),還有什么因素需要考慮?
感受態(tài)細(xì)胞出了問題:設(shè)置下面列出的實(shí)驗(yàn)對照,必要時(shí)更換新鮮感受態(tài)細(xì)胞。
細(xì)胞不是感受態(tài):設(shè)置下面列出的實(shí)驗(yàn)對照,必要時(shí)更換新鮮感受態(tài)細(xì)胞。
大腸桿菌不能很好的接受重組蛋白:試用pMAL系統(tǒng)(NEB#E8000S)表達(dá)MBP(麥芽糖結(jié)合蛋白)
融合蛋白,或者試用其它不需要大腸桿菌的表達(dá)系統(tǒng)。
連接的DNA片段含有反向重復(fù)的序列,不能用大腸桿菌篩選:如果可能去除重復(fù)序列,或試用其它不需要大腸桿菌的表達(dá)系統(tǒng)。
插入序列來自哺乳動(dòng)物、植物或者含有甲基化的胞嘧啶,會被很多大腸桿菌菌株降解:使用mcrA、mcrBC 和mrr缺失菌株。
重組子太大(>10,000 bp)不能進(jìn)行化學(xué)轉(zhuǎn)化:用電轉(zhuǎn)化。
Q3:內(nèi)切酶酶切反應(yīng)后,有什么因素可以導(dǎo)致T4 DNA連接酶連接和后續(xù)的轉(zhuǎn)化失敗?
內(nèi)切酶酶切不充分:如果酶切位點(diǎn)位于PCR產(chǎn)物的末端,識別位點(diǎn)末端側(cè)需要加少6個(gè)保護(hù)堿基。用對照底物檢測內(nèi)切酶的活性。
內(nèi)切酶沒有*失活:如果內(nèi)切酶不能熱失活,用酚/氯仿抽提純化DNA。
內(nèi)切酶的星號活性消化了載體或插入片段:跑膠檢測DNA,如果存在多余的條帶,減少內(nèi)切酶使用量或減短反應(yīng)時(shí)間。
DNA或內(nèi)切酶有外切酶或磷酸酶的污染,
破壞了DNA末端:酚/氯仿抽提純化DNA。檢查內(nèi)切酶的質(zhì)量檢測資料和注意事項(xiàng),如果連接QC不佳或外切酶活性高,減少內(nèi)切酶量或縮短反應(yīng)時(shí)間。
使用T4 DNA連接酶,需要設(shè)置什么對照來檢測細(xì)胞和DNA。
注意:每個(gè)對照組都使用相同濃度的DNA,一般為0.1-1.0ng/轉(zhuǎn)化。
轉(zhuǎn)化空載體(未切割的)感受態(tài)細(xì)胞,目的:檢測感受態(tài)細(xì)胞的質(zhì)量以及質(zhì)粒的抗性。分別涂布于含有和不含有抗生素的平皿上。
轉(zhuǎn)化線性化后的載體,目的:檢測未切開質(zhì)粒的量,克隆數(shù)應(yīng)該小于步驟1的1%。
酶切再連接質(zhì)粒,目的:檢測連接酶的活性以及DNA末端的完整性??寺?shù)應(yīng)該與步驟1相近。
酶切后去磷酸化再連接質(zhì)粒,目的:檢測未*去磷酸化的背景。克隆數(shù)應(yīng)該小于步驟1
的1%。
Q5:什么情況下選用T4 DNA連接酶?
T4 DNA連接酶應(yīng)該被用來連接粘性末端(室溫10分鐘)或平末端(室溫2小時(shí)),或者連接反應(yīng)需要。如果需要熱失活連接酶,選用用T4 DNA連接酶。高濃度T4 DNA連接酶被用來連接單堿基突出末端,或連接需要長時(shí)間孵育來環(huán)化的大片段,比如BAC(細(xì)菌人造染色體)結(jié)構(gòu)。
T4 DNA連接酶能與快速連接buffer兼用嗎?
可以,高濃度T4 DNA連接酶可以直接取代,如果是普通濃度的T4 DNA連接酶,將孵育時(shí)間從5分鐘延長到15分鐘。不要進(jìn)行熱失活,因?yàn)榧訜釙宐uffer內(nèi)的PEG抑制轉(zhuǎn)化。反應(yīng)時(shí)間延長也會降低轉(zhuǎn)化效率。
T4 DNA連接酶連接應(yīng)該加多少DNA?
單位定義用的是0.12 μM (300 μg/ml) lambda HindIII。高濃度的DNA用于linker的連接。為了促進(jìn)環(huán)化(有利于轉(zhuǎn)化),應(yīng)該控制總DNA濃度于較低水平。載體+片段總濃度應(yīng)為:1-10 μg/ml。插入片段和載體的摩爾濃度比介于2-6之間,比例低于2:1會降低連接效率,高于6:1會促進(jìn)形成多個(gè)插入。如果對DNA的濃度不確定,可以做不同比例的多個(gè)連接反應(yīng)。
N-(3-氨基丙基)-1,4-丁二胺產(chǎn)品訂購說明:
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2、部分非常用產(chǎn)品,需提前1-2日預(yù)訂,海外期貨則需要提前3-6周預(yù)訂。
3、部分產(chǎn)品價(jià)格會因貨期、批次等因素發(fā)生變化,若有變動(dòng)以訂貨當(dāng)日新價(jià)格為準(zhǔn)。
4、每日訂單截止時(shí)間為16點(diǎn)整,部分城市可到17點(diǎn)整,因超過截止時(shí)間造成當(dāng)日不能發(fā)貨的將于次日安排發(fā)貨。
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1、極低溫產(chǎn)品:極低溫產(chǎn)品運(yùn)輸過程中加裝干冰運(yùn)輸。用干冰把產(chǎn)品包裹起來,再用泡沫盒密封,膠帶層層粘住泡沫盒,放入索萊寶的箱子,然后交付給合作快遞,安全快速高效放心的送客戶的手中,保證產(chǎn)品的性質(zhì)穩(wěn)定如一,為您的實(shí)驗(yàn)保駕護(hù)航。
2、低溫產(chǎn)品:低溫產(chǎn)品運(yùn)輸過程中加裝索萊寶冰袋運(yùn)輸。事先用冰袋把產(chǎn)品包裹起來,再使用泡沫盒密封,用膠帶嚴(yán)實(shí)密封泡沫盒,再放入索萊寶的箱子(保溫效果少可以持續(xù)一周),然后交付給合作快遞,安全快速高效放心的送客戶的手中,保證產(chǎn)品的性質(zhì)穩(wěn)定如一,為您的實(shí)驗(yàn)保駕護(hù)航。
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