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流式細胞術(shù)在植物學(xué)領(lǐng)域的新興應(yīng)用

時間:2014-9-2閱讀:2056
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流式細胞儀檢測植物倍性

實驗材料:植物葉片

1.實驗步驟
一、 取材料(約1g ,根據(jù)具體情況而定),放入冰鎮(zhèn)的培養(yǎng)皿里,加入解離液(約1~2mL),用鋒利分刀片一次性快速切碎,整個過程,材料必須浸沒在解離液里。
二、 吸取培養(yǎng)皿內(nèi)的解離液,用400目的濾布過濾到冰鎮(zhèn)的離心管中,放置4℃的冰箱中孵育10分鐘。
三、 離心。轉(zhuǎn)速:1000轉(zhuǎn)/分,溫度:4℃,時間:8分鐘。
四、去上清,使用BD cycletest plus DNA reagent kit中的B液作用10min,C液染色10min。
五、上機檢測。

1.解離液:
  Chopping Buffer(LB01)
   成分 濃度 用量
   Tris 15mM 363mg
   Na2EDTA 2mM 148.9mg
   精胺 0.5mM 20.2mg
   KCl 80mM 1.193g
   NaCl 20mM 233.8mg
   Triton X-100 0.1% 200ul
   二巰基乙醇 15mM 220ul  
   加去離子水 至200ml
   PH7.5,0.22um濾膜過濾,-20?C凍存。

結(jié)果:
   1.樣本:桉樹幼苗的幼嫩葉片(正常體細胞)
   染液:BD cycletest plus DNA reagent kit
        
                File analyzed: Data.002.fcs
                Date analyzed: 31-Mar-2011
                Model: 1DA0n_DSD
                Analysis type: Automatic analysis

                Ploidy Mode: First cycle is diploid

                Diploid: 100.00 %
                Dip G1: 71.49 % at 63.58
                Dip G2: 11.61 % at 127.15
                Dip S: 16.90 %   G2/G1: 2.00
                %CV: 5.23

                Total S-Phase: 16.90 %
                Total B.A.D.: 19.34 %  

                Debris: 42.60 %
                Aggregates: 2.76 %
                Modeled events: 6646
                All cycle events: 3631
                Cycle events per channel: 56
                RCS: 2.674

2.樣本:蝴蝶蘭葉片(嵌合體)
   染液:BD cycletest plus DNA reagent kit
                                                               
分析與總結(jié):
1. 實驗材料的選擇:以選取植物葉片為實驗材料*。若實驗材料取自野外,為避免運輸過程中材料受到高溫的影響,采摘后應(yīng)立即用濕濾紙包裹置于冰盒中。若不立即進行實驗,可將材料儲存于-70℃冰箱中保存數(shù)日。
2. 細胞核的獲取數(shù)量:建議獲取20,000—30,000個,因為用modfit分析時,擬合的細胞數(shù)至少是10,000個,分析結(jié)果*,而植物葉片制備細胞核懸浮液時會產(chǎn)生大量的碎片,會顯著降低擬合細胞的比例,故需提高獲取數(shù)量。
3. 獲取模板的優(yōu)化:FSC Vs SSC 選取log放大,以FL2為閾值,有利于排除部分碎片,同時較小的細胞核也不會漏檢,另外,再設(shè)置一個FL2 Vs SSC點圖,有利于排除一些帶有色素的細胞器的干擾。

流式分選植物原生質(zhì)體

1.研究背景
1.1原生質(zhì)體的概念

    植物原生質(zhì)體是指去除細胞壁被質(zhì)膜所包圍的、具有活力的細胞,其結(jié)構(gòu)包括細胞膜、細胞質(zhì)(包括各種細胞器、細胞骨架系統(tǒng)及胞基質(zhì))和細胞核等部分。原生質(zhì)體培養(yǎng)和植株再生技術(shù)具有使用范圍廣、可行性強等優(yōu)點,是植物生物工程的基礎(chǔ)。對植物原生質(zhì)體的研究,可追溯到20世紀60年代,英國植物學(xué)家Cocking用酶解方法降解細胞壁,獲得了番茄根尖原生質(zhì)體,自此原生質(zhì)體的研究得到迅速發(fā)展。近年來,由于原生質(zhì)體具有結(jié)構(gòu)簡單、發(fā)育同步性好、群體數(shù)量大、DNA分子易于進入細胞,易獲得純合性轉(zhuǎn)化子的特點,及其培養(yǎng)技術(shù)與有關(guān)的細胞、分子和遺傳等學(xué)科的交叉滲透,使植物原生質(zhì)體的研究越來越受到重視。研究領(lǐng)域也從分離原生質(zhì)體進行的生理生化和利用不同材料的原生質(zhì)體得到再生植株的階段轉(zhuǎn)到原生質(zhì)體的應(yīng)用(尤其是遺傳性狀改良)方面。

1.2原生質(zhì)體的制備
     原生質(zhì)體的分離方法有兩種:機械分離法和酶解分離法。機械分離法由于產(chǎn)量低、方法繁瑣費力;以及對分生組織和液泡化程度不高的細胞不適用的特點,現(xiàn)在已很少有人使用。                        酶解分離法為目前普遍采用的原生質(zhì)體分離方法。酶解是在25~28 ℃的恒溫、黑暗或弱光下進行;酶解后經(jīng)過0.038 mm孔徑左右的鎳絲網(wǎng)過濾,濾去消解不*的組織碎塊(導(dǎo)管、篩管等)和細胞團。然后將濾液離心,棄去上清液,將離心下來的原生質(zhì)體重新懸浮在洗液(CPW)中,再次離心,去上清液,重復(fù)3 次。在倒置顯微鏡下檢查純化效果,效果好,用原生質(zhì)體培養(yǎng)基離心,效果不好,用質(zhì)量分數(shù)為20%的蔗糖離心,使完整的原生質(zhì)體浮于液面。             

1.3原生質(zhì)體的轉(zhuǎn)化
     1)生物介質(zhì)介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化。目前應(yīng)用的生物介質(zhì)主要是根癌農(nóng)桿菌和發(fā)根農(nóng)桿菌。它們轉(zhuǎn)化的原理分別是通過活化Ti 和Ri 質(zhì)粒的Vir 區(qū)基因,達到對T-DNA 轉(zhuǎn)移的目的。2)細胞融合法。PEG介導(dǎo)法由Davey 等首先建立,主要原理是借助細胞融合劑誘導(dǎo)原生質(zhì)體攝取外源DNA。PEG法的融合率可達10%~15%,無種屬特異性,幾乎可誘導(dǎo)任何原生質(zhì)體的融合。細胞電融合法利用細胞在相對電極之間的介電電泳,誘導(dǎo)細胞按特定方向排列,通過電極間產(chǎn)生的較高場強的電脈沖使相互接觸的細胞發(fā)生電穿孔,進而發(fā)生電融合。3)激光微束穿刺法。激光微束穿刺法就是利用直徑很小、能量很高的激光微束引起細胞膜可逆性穿孔,從而使處于細胞周圍的外源DNA 隨之進入細胞的轉(zhuǎn)基因方法。激光微束穿刺法操作簡便,對細胞的損傷小,可以準確定位于被照射的細胞,實驗重復(fù)性好。4)電擊法是利用高壓電脈沖作用,在原生質(zhì)體膜上“電擊穿孔”,形成可逆的瞬間通道,從而促進外源DNA的攝入。                            

1.4原生質(zhì)體的應(yīng)用
    由于原生質(zhì)體失去了細胞壁這一屏障,因而使其具有特殊的優(yōu)點。原生質(zhì)體不僅可作為一個單細胞系統(tǒng)來研究細胞壁再生、細胞分裂與分化、攝入細胞器、病毒侵染機理、膜透性及離子轉(zhuǎn)運等基礎(chǔ)理論研究的理想材料;同時還是原生質(zhì)體培養(yǎng)和原生質(zhì)體融合的基礎(chǔ)。而且,近年來以原生質(zhì)體為材料利用膜片鉗技術(shù)研究離子通道及原生質(zhì)體在受光、脅迫和激素作用后的調(diào)節(jié)機制已成為研究的熱點。此外,原生質(zhì)體也被用來作為研究植物細胞鈣信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及其調(diào)節(jié)機制的理想材料。

2.實驗用品
   熒光顯微鏡:觀察轉(zhuǎn)基因效率,觀察流式分選效率。 
   低速離心機和細胞計數(shù)儀:收集細胞及原生質(zhì)體
   流式細胞儀(BD FACSAriaIII):分選原生質(zhì)體
  細胞培養(yǎng)箱:細胞培養(yǎng)

   試劑和緩沖液:
   Protoplast enzyme solution (pH 5.6)
   1% cellulase      
   0.25% macerozyme  
   0.4 M Mannitol (0.5M for Tobacco)
   8 mM CaCl2
   5 mM Mes-KOH  
   BSA 0.1%

   W5 solution ( pH 5.6)
   154 mM NaCl
   125 mM CaCl2
   5 mM KCl
   5 mM Glucose
   1.5 mM Mes-KOH

   MaMg solution (pH 5.6)
   400 mM Mannitol
   15 mM MgCl2
   5 mM Mes-KOH

   PEG solution (can be stored for up to 1 week)
   400 mM Mannitol
   100 mM Ca(NO3)2
   40% PEG (Mw=8000)

   21% sucrose, 1 M Mannitol, 1 M Ca(NO3)2

3.實驗方法
3.1 分離原生質(zhì)體

   前一天晚上
   1. 使用約15 mL protoplast enzyme solution消化細胞壁。
   A. 選用生長1-3 周的植株 (請根據(jù)需要自行優(yōu)化條件) 。
   B. 23oC,孵育7-12小時,溫和震蕩混勻。 
   *天,上午
   2. 用100 ?m濾網(wǎng)過濾收集細胞至標記好的培養(yǎng)皿中。
   3. 在50 ml 管中加入等體積的21% 蔗糖溶液。
   4. 將第二步的細胞溶液加入第三步的蔗糖溶液中。
   5. 梯度離心10 min,750 rmp。
   6. 用藍槍頭從上層中吸取健康的完整的細胞。
   7. 用等體積的W5溶液重懸細胞。
   8. 離心,500 rmp,5min。
   9. 用W5溶液重懸細胞沉淀。
   10. 將細胞置于4 oC 保存直至使用。

3.2 PEG-介導(dǎo)轉(zhuǎn)化
    *天,下午
    1. 準備用于PEG轉(zhuǎn)化的原生質(zhì)體
    A. 預(yù)冷新鮮制備的PEG溶液。
    B. 500 rpm,1 min,離心原生質(zhì)體。
    C. 用MaMg 溶液重懸細胞至合適濃度: 106數(shù)量級, 至少300 ?l體積。
    D. 加DNA至一個新的14ml圓底管中– 所加DNA的量取決于表達水平。
    E. 加300 ?l 細胞溶液至管中,溫和混勻。
    2. PEG轉(zhuǎn)化
    A. 用等體積的PEG(300 ?l + DNA volume)和原生質(zhì)體 & DNA溶液(step E)混勻,注意要非常溫和。
    B. 室溫孵育30 min。
    3. 用W5溶液逐漸稀釋去除PEG
    A. 700 ?l, 5 min -用剪掉末端的槍頭上下溫和吹打。
    B. 1 ml, 3 min; 2 ml – 每一步溫和的轉(zhuǎn)動管子。
    C. 離心,500 rpm,5min,棄上清。
    4. 用1 ml W5 溶液重懸細胞沉淀。 
    5. (可選) 從未轉(zhuǎn)化的對照組中分離蛋白進行Western檢測。
    6. 將細胞置23oC孵育 1-3 天。

3.3 流式分選Protoplast
   1. 對原生質(zhì)體進行計數(shù),調(diào)整原生質(zhì)體濃度為5*10^6/mL。
   2. 使用BD FACSAriaIII流式細胞儀進行分選,收集GFP+原生質(zhì)體。
      A.打開準備好的流式細胞分選儀,本實驗使用的是BD FACSAriaIII。
     B.儀器設(shè)置為:100µm噴嘴,20 psi鞘液壓力。
      C.細胞密度和樣本上樣速度可以根據(jù)特定需要加以調(diào)整——要高得率還是高速度。
      D.使用樣本混勻功能,防止在分選過程中原生質(zhì)體發(fā)生沉降。
      E.畫一張FSC/SSC散點圖,調(diào)節(jié)電壓使細胞群體出現(xiàn)在散點圖的*。
      F.再畫一張GFP/PE-Texas Red散點圖,調(diào)節(jié)電壓,使野生型對照原生質(zhì)體群體(non-GFP)   
        出現(xiàn)在散點圖的*,GFP陽性原生質(zhì)體群體會在GFP熒光通道信號更強的位置現(xiàn)(在野生型對照樣本中沒有這個群體)。
      G.如有必要,調(diào)節(jié)補償,使GFP陰性和陽性原生質(zhì)體群體分得更開。
      H.設(shè)置門,圈住GFP陽性群體。需要準備一個non-GFP原生質(zhì)體陰性對照(Figure 1.)用以確定門的界限。
      I.根據(jù)實驗需要以及目的細胞的百分比,選擇合適的分選模式——高得率或者高純度。
      注:初始條件可選取100µm噴嘴,20 psi鞘液壓力。后期根據(jù)樣本狀態(tài)的不同,可以進一步優(yōu)化分選條件,包括:選擇更大的噴嘴尺寸,更低的鞘液壓力,用戶自定義分選模式,優(yōu)化原生質(zhì)體培養(yǎng)緩沖液,使用原生質(zhì)體培養(yǎng)緩沖液替代鞘液,直接分選原生質(zhì)體到培養(yǎng)皿中等,都有助于保護分選后原生質(zhì)體的活性。
      3. 對分選后得到的GFP+原生質(zhì)體進行離心,棄上清。
      4. 分選原生質(zhì)體后續(xù)實驗,分析原生質(zhì)體基因組DNA,蛋白或代謝產(chǎn)物表達水平。

4.實驗結(jié)果
                               
                               Figure 1. Negative Control

                               
                               Figure 2. GFP Positive Protoplast

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