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基因組測序被簡化
2013-2-20 閱讀(1043)
基因組測序被簡化
近日，英國研究人員將基因組測序的標準流程簡化，無需進行文庫制備且只要很少量的DNA就能獲得序列數(shù)據(jù)，完成DNA（脫氧核糖核酸）單分子測序，用量可低至不到1納克（10億分之一克），僅為常規(guī)測序方法的500分之一到600分之一。
論文作者、英國威康信托基金會桑格研究所的保羅·庫普蘭說：“我們用這種方法對病毒和細菌的基因組測序后發(fā)現(xiàn)，即使在相對較低的水平，我們也能夠確定所檢測的是何種有機物，不論樣本中是否存在特定的基因或質(zhì)粒，或者其他信息，如對特定DNA堿基的修改等。”
威康信托基金會桑格研究所的哈羅德·斯維爾德洛說：“我們的技術(shù)可以在對所測序列沒有任何先驗知識、沒有特定微生物試劑的條件下，在很短的時間內(nèi)操作，這是一種很有前途的替代手段，可應(yīng)用于控制感染等臨床需要。”
通過利用第三代單分子測序系統(tǒng)PacBio RS演示了這種簡化的直接測序方法，事實證明，僅僅用800皮克（千分之一納克）DNA來分析一個生物體的基因組，盡管測序儀只讀取了基因組的70個序列片段，相對于常規(guī)測序方法獲得的數(shù)據(jù)來說不過是很小的一部分，但這些信息足以讓研究人員確定生物體的品種。
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