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中國科學家Science完成大型基因組項目
2014-12-12 閱讀(285)
由深圳華大基因,哥本哈根大學,武漢大學生科院,中科院等多國科研機構參與的一項大型基因組研究項目12月在*期刊Science雜志上公布了成果。
這一項目歷時四年多,完成了45種鳥類的基因組測序,并由此構建了迄今為止zui完備的鳥類進化樹,相關研究共發(fā)布了23篇文章,其中8篇將在Science雜志同期刊發(fā),另外15項成果將在Genome Biology以及GigaScience等雜志上發(fā)表。
這項研究涉及20個不同國家的約80個機構的數百名科學家參與,分析了每種主要鳥類種系中至少一種主要品種,由此揭示出了現代鳥類是如何在一個物種大滅絕事件(大約6600萬年前,消滅了所有的恐龍)之后快速出現的。
鳥綱是地球上品種zui豐富的有四肢的脊椎動物,此次構建的進化樹揭示了一些zui早的鳥類是如何歧化的,回答了許多長期存在的、有關鳥類、鱷魚類和恐龍的問題,并闡釋了鳥類性染色體的演化、鳥類與人類的發(fā)聲學習以及導致鳥類失去其牙齒的過程。
而且由于近年來禽流感疫情的盛行,這項研究成果也將有助于分析鳥類攜帶病毒,以及傳播路線等問題。
在其中“Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation”這篇旗艦論文中,華大基因的王俊,張建國(Guojie Zhang,音譯)等人比較分析了48個鳥類基因組,其中包括研究人員完成的基因組序列:烏鴉、鴨、鴿子、隼、啄木鳥、鷹和鴕鳥等,還有之前已經完成是3個基因組序列:雞、火雞和斑馬雀。
這一發(fā)現將有助于揭示為什么鳥類基因組總體上比哺乳動物基因組要小約70%,而且研究人員還指出了保留達1億年以上的鳥類基因組的特別區(qū)域,以及在這一過程中,某些鳥類特征的趨同演化。
文章作者之一,霍華德休斯醫(yī)學研究所的Erich D. Jarvis表示,“過去,人們一直在用1到2個(zui多10或20個基因),來嘗試分析在過去1億年左右,鳥類物種間的相互關系。而我們的理論是:如果你采用整個基因組,那么你會獲得比只有1或2個基因所能提供的譜系相比,更為的物種譜系。”
他們發(fā)現鳥類的W染色體與人類的Y染色體不同,前者還存在許多活躍的基因,不同鳥類物種的性染色體目前正處于不同的演化階段。
除此之外,在一篇綜述類文章中,中科院的徐星等人介紹了近期追蹤鳥類足跡的新成果,尤其是中國東北部地區(qū)羽毛恐龍化石的發(fā)現,徐星等人將目前發(fā)育生物學,功能解剖學,以及古生物學記錄整合在一起,提出了一些新觀點。