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基因組測(cè)序的顛覆性發(fā)現(xiàn)
2015-4-11 閱讀(209)
山地大猩猩是一種廣泛近親繁殖而且瀕臨滅絕的動(dòng)物。日前,科學(xué)家們完成了山地大猩猩的全基因組測(cè)序,并將結(jié)果發(fā)表在四月九日的Science雜志上。這項(xiàng)研究不僅有助于理解種群衰退對(duì)動(dòng)物產(chǎn)生的影響,還顛覆了人們對(duì)近親繁殖的認(rèn)識(shí)。
“山地大猩猩是野外研究得zui多的靈長(zhǎng)動(dòng)物之一,而我們進(jìn)行了深度的全基因組分析,"文章的通訊作者,Wellcome Trust Sanger研究所的Chris Tyler-Smith說(shuō)。“我們對(duì)不同種類的大猩猩進(jìn)行了比較,還研究了近親繁殖的遺傳學(xué)影響。"
由于棲息地破壞和人類捕獵,1981年生活在非洲維龍加山區(qū)的山地大猩猩只有253只。后來(lái)在人們的多方保護(hù)之下,這一地區(qū)的山地大猩猩增加到了約480只。研究人員希望了解,這么小的基因庫(kù)會(huì)對(duì)山地大猩猩產(chǎn)生怎樣的影響。他們驚訝的發(fā)現(xiàn),許多有害的遺傳變異通過(guò)近親繁殖從群體中去除,而且山地大猩猩相當(dāng)適應(yīng)這樣的小群體。
“我們的數(shù)據(jù)展示了小群體從基因組中清除嚴(yán)重有害突變的過(guò)程,"文章的通訊作者,劍橋大學(xué)的Dr Aylwyn Scally說(shuō)。
研究人員使用多年收集的血樣,測(cè)序了七只山地大猩猩的完整基因組。他們將山地大猩猩與它們的近親進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)它們的遺傳學(xué)多樣性明顯較低。(延伸閱讀:近期zui熱門(mén)的基因組測(cè)序成果)
一般來(lái)說(shuō),長(zhǎng)期近親繁殖會(huì)降低遺傳多樣性,讓種群對(duì)環(huán)境改變和疾病敏感。然而這項(xiàng)研究表明,山地大猩猩的近親繁殖其實(shí)是有利的。與其他數(shù)量較多的猩猩相比,山地大猩猩的有害功能缺失突變更少。這樣的突變會(huì)阻止基因行使功能,引起嚴(yán)重的健康問(wèn)題甚至致命。
研究人員還通過(guò)基因組分析發(fā)現(xiàn),山地大猩猩以小群體的形式已經(jīng)生存了數(shù)千年。他們分析了山地大猩猩種群大小在漫長(zhǎng)歲月中發(fā)生的改變。根據(jù)估算,數(shù)千年以來(lái)山地大猩猩的平均群體數(shù)量就在幾百只左右。
“上世紀(jì)八十年代山地大猩猩的數(shù)量急劇減少,我們?cè)?jīng)擔(dān)心這會(huì)產(chǎn)生災(zāi)難性的影響。但遺傳學(xué)分析指出,這些大猩猩已經(jīng)應(yīng)對(duì)這個(gè)問(wèn)題數(shù)千年了,"文章的*作者,Sanger研究所的Dr Yali Xue說(shuō)?!皬V泛的近親繁殖曾經(jīng)讓尼安德特人滅絕,但山地大猩猩卻能夠持續(xù)至今。我們有理由認(rèn)為這些大猩猩還能夠繁衍數(shù)千年。"
研究人員還希望,山地大猩猩的全基因組序列能夠?yàn)閯?dòng)物保護(hù)提供幫助。舉例來(lái)說(shuō),現(xiàn)在人們可以根據(jù)遺傳學(xué)差異鑒定大猩猩的來(lái)源,將更多大猩猩放回野外,或者更好的起訴那些偷獵者。