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新的基因測試方法一天內(nèi)檢測出肺結(jié)核

2017-3-23  閱讀(181)

在一項新的研究中,研究人員證實一種用于檢測病人痰液中肺結(jié)核細菌的不到24小時基因測試方法(sub-24 hour genetic test)能夠替換標(biāo)準(zhǔn)的肺結(jié)核(TB)診斷方法。

當(dāng)前要獲得一名肺結(jié)核患者的全部診斷信息需要長達兩個月的時間,這是因為肺結(jié)核菌在實驗室中非常緩慢地生長。多年來,科學(xué)家們一直尋求通過直接檢測痰液樣品中的肺結(jié)核菌DNA來繞過這個耗費時間的步驟。然而,鑒于痰液中的大多數(shù)細胞是人細胞,很難在干擾信號(人細胞和其他的細菌)中發(fā)現(xiàn)靶信號(即肺結(jié)核菌DNA),而且更難發(fā)現(xiàn)一種可能在*既實惠又實用的方法。

在來自英國牛津大學(xué)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)下,這種新的基因測試方法利用簡單且又相對實惠的材料快速地處理痰液,從而偏好地分離肺結(jié)核菌,隨后對這種細菌DNA進行測序和分析。這些牛津大學(xué)研究人員是與來自英國諾丁漢大學(xué)、孟買醫(yī)學(xué)研究基金會和英格蘭公共衛(wèi)生部門的研究人員合作開展這項研究的。

在此之前,DNA測序需要大量的儀器和一個設(shè)備完善的實驗室,這就限制了它在這個領(lǐng)域的潛在應(yīng)用。在這項新的研究中,這些研究人員也證實利用一種新的實時手持式測序設(shè)備(牛津納米孔技術(shù)公司開發(fā)出的MInION),他們利用一種可能在世界上任何地方使用的過程,也能夠獲得相同的結(jié)果。在一個例子中,他們獲得測試結(jié)果所需的周轉(zhuǎn)時間是12.5小時。

利用DNA測序,這種方法不僅能夠檢測耐藥性的肺結(jié)核菌(對病人而言是至關(guān)重要的信息),而且它也能夠追蹤肺結(jié)核菌菌株在地理上的擴散。這種擴散信息對公共健康工作者而言是非常有價值的。

肺結(jié)核是世界上傳染病死亡的主要原因之一。2015年,*有1.04千萬肺結(jié)核病例,其中110萬死亡病例直接由肺結(jié)核引起。

牛津大學(xué)惠康基金會人類遺傳學(xué)中心研究員Zamin Iqbal博士說,“控制肺結(jié)核的一個重大挑戰(zhàn)之一是在不需要高科技實驗室的情形下,開展快速的和全面的測試。我們證實在提取病人痰液樣品24小時內(nèi),獲得用于臨床管理和追蹤疾病擴散所需的所有信息是可行的。再者,通過利用一種手持式設(shè)備實現(xiàn)這一點,我們?yōu)樵谝巴鈱Ψ谓Y(jié)核菌進行診斷測試打開大門。”

論文共同作者Antonina Votintseva博士說,“盡管基因組測序日益增加地用于分析肺結(jié)核菌,但是限制因素仍然是需要在實驗室中花費數(shù)周時間培養(yǎng)肺結(jié)核菌。通過開發(fā)一種簡單且又實惠的方法來提取痰液中的肺結(jié)核菌DNA,因而將周轉(zhuǎn)時間降低到24小時以下,我們在開發(fā)全面的現(xiàn)場即時診斷方法的目標(biāo)上邁出了一大步。”

“當(dāng)然還要開展更多的研究---我們的目標(biāo)是在病人離開診所之前給出測試結(jié)果,這就有巨大的潛力降低肺結(jié)核傳播和耐藥性。”

惠康基金會創(chuàng)新主任Stephen Caddick博士說,“常規(guī)的肺結(jié)核測試方法需要數(shù)周的時間提供結(jié)果。Iqbal博士和他的團隊通過開發(fā)一種低成本的DNA提取方法而取得重大突破:這種方法能夠直接對病人樣品中的肺結(jié)核菌進行全基因組測試,從而在不到一天的時間里提供測試結(jié)果。利用這種技術(shù)鑒定出可能對抗生素治療產(chǎn)生耐藥性的肺結(jié)核菌菌株的能力可能在抵抗耐藥性感染中是非常有價值的,特別是中低收入國家。”



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