1、用預柱。(但要注意，若有時出峰異常，要先看看是不是它有問題了)
2、每次做完分析，都要進行沖洗，
A、分析用流動相中若無酸、堿、鹽類物質，建議用90%甲醇沖洗30～60min;
B、若分析用流動相中含以上物質，要先用10%甲醇(或用與分析用流動相同比例，把含酸、堿、鹽溶液換成水)沖洗1小時左右，再C梯度走到90%甲醇沖洗30～60min(若用多元泵)。有必要時再循環(huán)幾次，可以適當縮短時間。
c、若長時間不用該色譜柱，要沖洗好后，用純甲醇或乙腈封存。
3、若流動相中用到離子對試劑，更應該好好沖洗，且該色譜柱作為，不能再做其它物質分析用。因色譜柱填料性質已與原來所不同，在該柱上所摸索的色譜條件，可能在其它同類柱子上得不到重現。
4、盡量避免反沖，除非該色譜柱廠家明確說明允許。
5、普通C18柱盡量避免在40℃以上的溫度下分析
6、定期測柱效，有下降，可以用10%異丙醇甲醇沖洗色譜柱。若柱效還沒有改善，可以再生，甲醇-二氯甲烷-甲醇。
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