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樣本制備,如何回收高質(zhì)量核酸?
DNA測序在生物學(xué)研究應(yīng)用中日益增長,NGS是其重要技術(shù)手段之一,可提供快速可靠的數(shù)據(jù)結(jié)果。良好的數(shù)據(jù)很大程度上取決于測序的核酸質(zhì)量,制備的DNA樣本質(zhì)量差或效率低下可能導(dǎo)致測序片段過短、背景信號過高、數(shù)據(jù)質(zhì)量下降甚至錯(cuò)誤,因而核酸的制備純化成為NGS流程的關(guān)鍵一環(huán)。
Agencourt AMPure XP是一款運(yùn)用SPRI磁珠技術(shù),純化獲得高質(zhì)量DNA的核酸純化系統(tǒng),目前已被廣泛應(yīng)用于基因測序、SNP基因分型、擴(kuò)增反應(yīng)純化、片段分析等。通過簡易操作就能獲得目標(biāo)產(chǎn)物,為下游實(shí)驗(yàn)提供高質(zhì)量樣本;同時(shí)去除反應(yīng)體系中的雜質(zhì),有效避免對下游實(shí)驗(yàn)的影響。
圖1 Agencourt AMPure XP進(jìn)行產(chǎn)物純化操作流程
可信賴的核酸純化性能
Agencourt AMPure XP試劑盒用于純化回收dsDNA和ssDNA,可有效去除dNTP、引物、鹽離子和其他雜質(zhì)。支持純化100bp-40kb之間的擴(kuò)增產(chǎn)物。對于200bp以上大小的擴(kuò)增產(chǎn)物得率高達(dá)90%以上,小于200bp的擴(kuò)增產(chǎn)物純化得率在85%以上。
圖2 Agencourt AMPure XP高效回收200 bp、800 bp、10 kb的dsDNA和ssDNA
穩(wěn)定的片段回收和產(chǎn)率
DNA的片段大小、均一性和質(zhì)量是下游實(shí)驗(yàn)獲取良好數(shù)據(jù)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),因此選擇合適比例、質(zhì)量穩(wěn)定、高效的磁珠進(jìn)行核酸回收尤為重要。對比實(shí)驗(yàn)(圖3)表明,與同類純化產(chǎn)品相比,Agencourt AMPure XP可在不同磁珠比例下,回收獲得片段大小穩(wěn)定、高得率、高純度的核酸。
圖3 Agencourt AMPure XP與不同純化產(chǎn)品的片段篩選及回收效率對比
靈活、省時(shí)
Agencourt AMPure XP核酸純化系統(tǒng)無需離心或過濾,實(shí)驗(yàn)過程操作簡單,且非常容易在自動(dòng)化平臺上用96或384板的形式進(jìn)行。核酸純化流程可在30min內(nèi)完成,更好保留核酸完整性,縮短流程時(shí)間。
Agencourt AMPure XP高通量廣泛應(yīng)用
Agencourt AMPure XP產(chǎn)品不僅保證了高質(zhì)量核酸獲取和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的*重復(fù)性,且操作簡易,結(jié)合自動(dòng)化工作站,可實(shí)現(xiàn)高通量樣本純化。為生物技術(shù)公司、制藥公司、政府部門和科研機(jī)構(gòu)等客戶提供友好高效的核酸回收途徑,幫助用戶得到優(yōu)良的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
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