PCR儀也叫基因擴(kuò)增儀，它是利用PCR技術(shù)對特定基因做試管內(nèi)的大量合成，也就是利用DNA聚合酶進(jìn)行專一性的連鎖復(fù)制?；驍U(kuò)增儀一般分為四種：普通基礎(chǔ)PCR儀，梯度PCR儀，實時熒光定量PCR儀，原位PCR儀。

（1）普通基礎(chǔ)PCR儀 

一次PCR擴(kuò)增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀，叫做普通基礎(chǔ)PCR儀。普通基礎(chǔ)PCR儀由主機(jī)，加熱模塊，PCR管，熱蓋，控制軟件組成。

基礎(chǔ)PCR儀主要適用于分子生物學(xué)、醫(yī)學(xué)臨床診斷、食品工業(yè)、司法科學(xué)、生物技術(shù)、環(huán)境科學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)、基因芯片、基因檢測、基因克隆、基因表達(dá)等領(lǐng)域以聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（Picymerase Chain Reaction , PCR）為特征的、以檢測DNA/RNA為目的的各種及基因分析。

（2）梯度PCR儀

在一次性PCR擴(kuò)增中可以設(shè)置一系列不同的退火溫度條件（溫度梯度），通常12種溫度梯度，這樣的儀器就叫梯度PCR儀。因為被擴(kuò)增的不同DNA片段，其適退火溫度不同，通過設(shè)置一系列的梯度退火溫度進(jìn)行擴(kuò)增，從而一次性PCR擴(kuò)增，就可以篩選出擴(kuò)增量高的適退火溫度，進(jìn)行有效的擴(kuò)增。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴(kuò)增，這樣節(jié)約成本的同時也節(jié)約了時間。

梯度PCR儀，在不設(shè)置梯度的情況下也可以做普通PCR擴(kuò)增。和普通基礎(chǔ)PCR儀一樣，梯度PCR儀可用于醫(yī)學(xué)，食品，司法，科研，教學(xué)等領(lǐng)域。

（3）實時熒光定量PCR儀

在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因，利用熒光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程，后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法，叫做實時熒光定量PCR技術(shù)，也稱real-time Q-PCR。

其PCR擴(kuò)增原理和普通PCR儀擴(kuò)增原理相同，只是PCR擴(kuò)增時加入的引物是利用同位素、熒光素等進(jìn)行標(biāo)記，使用引物和熒光探針同時與模板特異性結(jié)合擴(kuò)增。擴(kuò)增的結(jié)果通過熒光信號采集系統(tǒng)實時采集信號連接輸送到計算機(jī)分析處理系統(tǒng)得出量化的實時結(jié)果輸出。

熒光定量PCR儀是在普通PCR儀的基礎(chǔ)上增加一個熒光信號采集系統(tǒng)和計算機(jī)分析處理系統(tǒng)，與普通PCR儀，梯度PCR儀相比，無需做電泳分析，實驗一步檢測完成。熒光檢測系統(tǒng)主要包括激發(fā)光源和檢測器。激發(fā)光源有鹵鎢燈光源、氬離子激光器、發(fā)光二極管LED光源，前者可配多色濾光鏡實現(xiàn)不同激發(fā)波長，而單色發(fā)光二極管LED價格低、能耗少、壽命長，不過因為是單色，需要不同的LED才能更好地實現(xiàn)不同激發(fā)波長。監(jiān)測系統(tǒng)有超低溫CCD成像系統(tǒng)和PMT光電倍增管，前者可以一次對多點成像，后者靈敏度高但一次只能掃描一個樣品，需要通過逐個掃描實現(xiàn)多樣品檢測，對于大量樣品來說需要較長的時間。

熒光定量PCR儀有單通道，雙通道，和多通道。當(dāng)只用一種熒光探針標(biāo)記的時候，選用單通道，有多熒光標(biāo)記的時候用多通道。單通道也可以檢測多熒光的標(biāo)記的目的基因表達(dá)產(chǎn)物，因為一次只能檢測一種目的基因的擴(kuò)增量，需多次擴(kuò)增才能檢測完不同的目的基因片段的量。

（4）原位PCR儀

原位PCR儀是在組織細(xì)胞里進(jìn)行PCR反應(yīng)的一種基因擴(kuò)增儀。它結(jié)合了具有細(xì)胞定位能力的原位雜交和高度特異敏感的PCR技術(shù)的優(yōu)點，可以對細(xì)胞或組織內(nèi)的DNA片段進(jìn)行原位擴(kuò)增分析—即定位分析。原位PCR儀由主機(jī)，加熱模塊，玻片，熱蓋，控制軟件組成。

普通的PCR雖然能擴(kuò)增包括福爾馬林固定、石蠟包埋組織的各種標(biāo)本的DNA，但擴(kuò)增的DNA或RNA產(chǎn)物不能在組織細(xì)胞中定位，因而不能直接與特定的組織細(xì)胞特征相，這是該技術(shù)一個局限性。原位雜交雖具有良好的定位能力，但由于其敏感性問題，尤其是在石蠟切片中，尚不能檢測出低含量的DNA或RNA序列。而原位PCR可使擴(kuò)增的特定DNA片段在分離細(xì)胞和組織切片中定位，從而彌補(bǔ)了PCR和原位雜交的不足。

原位PCR反應(yīng)是在載玻片的平面上進(jìn)行，保持水平可以使反應(yīng)各組分均勻地分布在組織切片上，所以須在原位PCR儀上進(jìn)行，該儀器不但可以使載玻片保持水平，而且還可以給載玻片進(jìn)行均勻地加熱，保證擴(kuò)增反應(yīng)的順利進(jìn)行。

原位PCR儀是細(xì)胞學(xué)科研與臨床診斷領(lǐng)域里的一項有較大潛力的新技術(shù)，目前應(yīng)用還不太廣泛。原位PCR既能分辨鑒定帶有靶序列的細(xì)胞，又能標(biāo)出靶序列在細(xì)胞內(nèi)的位置，于分子和細(xì)胞水平上研究疾病的發(fā)病機(jī)理和臨床過程及病理的轉(zhuǎn)變有重大的實用價值。