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PCR常見問題分析及對策
最近更新時間:2016-1-13
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問題1:無擴增產(chǎn)物
現(xiàn)象:正對照有條帶,而樣品則無
原因:
1.模板:含有抑制物,含量低
2.Buffer對樣品不合適
3.引物設計不當或者發(fā)生降解
4.反應條件:退火溫度太高,延伸時間太短
對策:
1.純化模板或者使用試劑盒提取模板DNA或加大模板的用量
2.更換Buffer或調(diào)整濃度
3.重新設計引物(避免鏈間二聚體和鏈內(nèi)二級結構)或者換一管新引物
4.降低退火溫度、延長延伸時間
PCR常見問題分析及對策(無擴增產(chǎn)物、非特異性擴增、拖尾、假陽
問題2:非特異性擴增
PCR常見問題分析及對策(無擴增產(chǎn)物、非特異性擴增、拖尾、假陽現(xiàn)象:條帶與預計的大小不一致或者非特異性擴增帶
原因:
1.引物特異性差
2.模板或引物濃度過高
3.酶量過多
4.Mg2+濃度偏高
5.退火溫度偏低
6.循環(huán)次數(shù)過多
對策:
1.重新設計引物或者使用巢式PCR
2.適當降低模板或引物濃度
3.適當減少酶量
4.降低鎂離子濃度
5.適當提高退火溫度或使用二階段溫度法
6.減少循環(huán)次數(shù)
問題3:拖尾
PCR常見問題分析及對策(無擴增產(chǎn)物、非特異性擴增、拖尾、假陽現(xiàn)象:產(chǎn)物在凝膠上呈Smear狀態(tài)。
原因:
1.模板不純
2.Buffer不合適
3.退火溫度偏低
4.酶量過多
5.dNTP、Mg 2+濃度偏高
6.循環(huán)次數(shù)過多
對策:
1.純化模板
2.更換Buffer
3.適當提高退火溫度
4.適量用酶
5.適當降低dNTP和鎂離子的濃度
6.減少循環(huán)次數(shù)
問題4:假陽性
現(xiàn)象:空白對照出現(xiàn)目的擴增產(chǎn)物
原因:
靶序列或擴增產(chǎn)物
的交*污染
對策:
1.操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或濺出離心管外;
2.除酶及不能耐高溫的物質(zhì)外,所有試劑或器材均應高壓消毒。所用離心管
及加樣槍頭等均應一次性使用。
3.各種試劑先進行分裝,然后低溫貯存