會(huì)員.png)
QQ交談
您所在位置：請(qǐng)輸入產(chǎn)品關(guān)鍵字：
郵編：200431
聯(lián)系人：王小姐
電話：021-56640936
傳真：021-33250231
手機(jī)：13122441390 15900755943
留言：發(fā)送留言
個(gè)性化：www.shifengsj.com
網(wǎng)址：www.shfeng-edu.com
商鋪：http://true-witness.com/st236594/
聯(lián)合作圖和單倍體型
最近更新時(shí)間：2017-3-6
提 供 商：上海士鋒生物科技有限公司資料大?。?/span>40KB
文件類(lèi)型：JPG 圖片下載次數(shù)：186次
資料類(lèi)型：未知文件瀏覽次數(shù)：1080次
由于常規(guī)的連鎖分析（linkage analysis）是利用單分離群體，只用兩個(gè)親本，所以在一次研究中只能檢測(cè)兩個(gè)或四個(gè)等位基因。而且選擇要在性狀上盡可能差別明顯的親本，以提高檢測(cè)到主效基因位點(diǎn)分離的機(jī)率。這種方法不能檢查整個(gè)種質(zhì)群體中的全部遺傳變異，不能在一次測(cè)驗(yàn)中研究多個(gè)不同的性狀。聯(lián)合作圖（association mapping）也稱連鎖不平衡作圖（linkage disequilibrium mapping，LD mapping），是鑒定數(shù)量性狀位點(diǎn)的有用工具。在聯(lián)合作圖方法中，不管潛在的家族關(guān)系，而是在一個(gè)大的種質(zhì)池中查找基因型和表現(xiàn)型之間的統(tǒng)計(jì)學(xué)聯(lián)合關(guān)系?；谠诨蛭稽c(diǎn)在的兩個(gè)相鄰的等位基因間的歷史關(guān)系來(lái)鑒定影響某個(gè)性狀表達(dá)的基因位點(diǎn)。
由于減數(shù)分裂過(guò)程中會(huì)發(fā)生基因重組，zui初兩個(gè)相鄰等位基因的發(fā)生的共重組在群體中會(huì)逐步衰退。因此，未知基因和鄰近的標(biāo)記之間的相對(duì)等位基因分布將是非隨機(jī)的，換言之，它們的分布是不平衡的。與連鎖作圖不同，聯(lián)合作圖研究可用現(xiàn)有的所有植物種系進(jìn)行，但又不用雜交和檢測(cè)后代。利用這種方法，可在一次研究中觀察到所有性狀zui大程度的基因型變異性。理論上，聯(lián)合作圖的優(yōu)勢(shì)在于，利用具有減數(shù)分裂歷史的大的種質(zhì)池（或群體）來(lái)測(cè)定基因的連鎖關(guān)系，可以較高精度定位基因，而這是在連鎖作圖中無(wú)法做到的。但是，目前所觀察到的等位基因，其不可見(jiàn)的連鎖歷史可能并不是單一的，這對(duì)作圖統(tǒng)計(jì)學(xué)是一種限制，也不像在傳統(tǒng)的連鎖作圖中那樣嚴(yán)格。因此，其優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)與連鎖作圖是互補(bǔ)的。
利用雙等位基因標(biāo)記（bi-allelic markers）如單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）和擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性（amplified fragment length polymorphisms，AFLPs）進(jìn)行數(shù)量性狀（而不是質(zhì)量性狀）聯(lián)合作圖時(shí)，因?yàn)橹挥蠥（純合等位基因1）、B（純合等位基因2）或H（雜合體）兩種或三種基因型，在尋找數(shù)量性狀值之間的相關(guān)關(guān)系時(shí)會(huì)產(chǎn)生問(wèn)題。
微衛(wèi)星標(biāo)記（Microsalite markers，SSRs）是一種復(fù)等位基因的可選系統(tǒng)，但這種標(biāo)記于自然產(chǎn)生重復(fù)序列的基因位點(diǎn)，與具有潛在高圖密度的snps不能相比，而這是成功地進(jìn)行聯(lián)合作圖所必需的。雙等位基因標(biāo)記資料相對(duì)信息含量較少，但用標(biāo)記單倍體型（haplotype）而不是用單個(gè)標(biāo)記分?jǐn)?shù)，可以使雙等位基因標(biāo)記資料的信息含量得到提高。單倍體型可定義為處于連鎖相的通常的等位基因組，一般位于相鄰的基因座（即從單個(gè)親本遺傳到的等位基因）。可以得到自交系的植物物種，單倍體型可直接從基因型來(lái)確定，而雜合體則需進(jìn)行連鎖相檢測(cè)。
在聯(lián)合作圖研究中利用單倍體型時(shí)，若干連鎖的雙等位基因信息結(jié)合起來(lái)作為單個(gè)復(fù)等位基因標(biāo)記。這樣的單倍體型標(biāo)記既可顯示許多等位基因（當(dāng)平均局部LD較低時(shí)），也可顯示少數(shù)等位基因（當(dāng)局部LD值較高時(shí)）。單倍體型可從物理圖譜、再測(cè)序基因座（序列單倍體型）或遺傳圖譜（標(biāo)記單倍體型）產(chǎn)生。利用單倍體型能否從總體上提高聯(lián)合檢測(cè)的能力目前仍無(wú)定論：