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RNAi相關(guān)的術(shù)語
點(diǎn)擊次數(shù)：561 發(fā)布時(shí)間：2016-7-25
1.RNAi ：(RNA interference)RNA干擾
一些小的雙鏈RNA可以、特異的阻斷體內(nèi)特定基因表達(dá)，促使mRNA降解，誘使細(xì)胞表現(xiàn)出特定基因缺失的表型，稱為RNA干擾(RNA interference，RNAi ，也譯作RNA干預(yù)或者干涉)。它也是體內(nèi)抵御外在感染的一種重要保護(hù)機(jī)制。
2.sirna：(small interfering RNAs)小干擾RNA
一種短片斷雙鏈RNA分子，能夠以同源互補(bǔ)序列的mRNA為靶目標(biāo)降解特定的mRNA，這個(gè)過程就是RNA干擾途徑(RNA interference pathway)。
3.shrnasRNA-Short hairpin RNAs)短發(fā)夾RNA
是設(shè)計(jì)為能夠形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)的非編碼小rna分子，短發(fā)夾RNA能夠通過RNA干擾來抑制基因的表達(dá)。Thomas Rosenquist's group和Greg Hannon's group聯(lián)合研究了在哺乳動(dòng)物種系細(xì)胞中shRNAs的轉(zhuǎn)移導(dǎo)致基因長(zhǎng)時(shí)間穩(wěn)定沉默的機(jī)制。
4.bpBase Pair)堿基對(duì)
兩個(gè)堿基(A和T，或者C和G)之間靠氫鍵結(jié)合在一起，形成一個(gè)堿基對(duì)。DNA的兩條鏈就是靠堿基對(duì)之間的氫鍵連接在一起，形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。
5.Base sequence:堿基序列
DNA分子中堿基的排列順序。
6.Base Sequence Analysis:堿基序列分析
分析出DNA分子中堿基序列的方法(這種方法有時(shí)能夠全自動(dòng)化)
cDNA：參見互補(bǔ)DNA。
7.cDNA：互補(bǔ)DNA
以信使RNA為模板合成的DNA，常常采用互補(bǔ)DNA的一條鏈作為繪制物理圖譜時(shí)的探針。
8.Complementary sequence：互補(bǔ)序列
以一條核苷酸鏈為模板，根據(jù)堿基互補(bǔ)規(guī)則形成的互補(bǔ)鏈，稱為該模板的互補(bǔ)序列。
9.Genomic Library：基因組文庫
對(duì)某個(gè)染色體，制備隨機(jī)產(chǎn)生的、相互之間有重疊部分的片段的克隆。
10.RISC：(RNA-induced silencing complex)RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物
在RNAi 效應(yīng)階段，siRNA雙鏈結(jié)合一個(gè)核酶復(fù)合物從而形成所謂RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物。激活RISC需要一個(gè)ATP依賴的將siRNA解雙鏈的過程。激活的RISC通過堿基配對(duì)定位到同源mRNA轉(zhuǎn)錄本上，并在距離siRNA3'端12個(gè)堿基的位置切割mRNA(3, 18, 27, 29)。盡管切割的機(jī)制現(xiàn)在還是未知，研究表明每個(gè)RISC都包含一個(gè)siRNA和一個(gè)不同于Dicer的RNA酶。
11.Dicer：Dicer酶
RNaseIII家族中特異識(shí)別雙鏈RNA的一員，能以一種ATP依賴的方式逐步(processive)切割由外源導(dǎo)入或者由轉(zhuǎn)基因、毒感染等各種方式引入的雙鏈RNA，切割將RNA降解為19—21bp的雙鏈RNAs(siRNAs)，每個(gè)片斷的3'端都有2個(gè)堿基突出(27, 28)。
12.PTGS：(Post-transcriptional Gene Silencing ,PTGS)轉(zhuǎn)錄后基因沉默
部分的植物中的基因沉默是在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生的。它是相對(duì)于部分植物中發(fā)生的轉(zhuǎn)錄階段的基因沉默(TGS)而言的。
13. TGS：(transcriptional gene silencing)轉(zhuǎn)錄階段基因沉默
14.gene silence:基因沉默
研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)有大量的轉(zhuǎn)基因植株不能正常表達(dá)，通常這并不是由于轉(zhuǎn)基因的缺失或突變引起的，而是基因失活的結(jié)果.這種失活的現(xiàn)象稱為基因沉默。
15.RNA transfection：RNA轉(zhuǎn)染。
16.Sense RNA：正義鏈RNA
17.Antisense RNA：反義鏈RNA。
18.19 2 2 nt siRNA：
在細(xì)胞中雙鏈RNA一般都被切割成21-23小片段，這樣的RNA片段能達(dá)到更好的RNAi 作用。人工合成的siRNA也是依據(jù)這個(gè)原理，所合成的RNA就是19nt的堿基序列再加上兩端的識(shí)別序列如-GG，-TT等。
19.SECssiRNA expression cassettes)siRNA表達(dá)框架
一種由PCR得到的siRNA表達(dá)模版，能夠直接導(dǎo)入細(xì)胞進(jìn)行表達(dá)而無需事前克隆到載體中。
20.Homologies：同源性
指同種類不同個(gè)體或者不同種類個(gè)體之間的，染色體或者蛋白質(zhì)序列的相似性
21.Homologous Chromosome：同源染色體
一對(duì)染色體，分別來自父本和母本，染色體上有著相同的線性基因序列。
22.Recombinant Clone：重組克隆