凝膠柱層層析又稱凝膠過濾，是一種按分子量大小分離物質(zhì)的層析方法。該方法是把樣品加到充滿著凝膠顆粒的層析柱中，然后用緩沖液洗脫。大分子不能進入凝膠顆粒中的靜止相中，只留在凝膠顆粒之間的流動相中，因此以較快的速度首先流出層析柱，而小分子則能自由出入凝膠顆粒中，并很快在流動相和靜止相之間形成動態(tài)平衡，因此就要花費較長的時間流經(jīng)柱床，從而使不同大小的分子得以分離。

凝膠柱又可叫離子交換柱,色譜層析柱,可根據(jù)樣品容量大小選擇合適的尺寸的層析柱.