為什么要進行單細胞測序?
傳統(tǒng)的測序是以組織為單位進行的測序,所得的測序結果是多個細胞的平均值,無法精確到單個細胞的遺傳信息;而實際上,細胞與細胞之間由于存在異質性,即便在腫瘤組織中,腫瘤組織中心的細胞、周圍的細胞、以及出現(xiàn)遠端轉移的細胞,在基因組和轉錄組水平上的遺傳信息也是有差異的。而單細胞測序是在單個細胞水平上對DNA或RNA進行測序,分析單個細胞的基因結構和基因表達情況,實現(xiàn)更高分辨率的基因表達分析。
單細胞測序目前主要包括單細胞基因組測序、單細胞轉錄組測序、單細胞表觀組測序。
早期單細胞測序流程首先是通過稀釋、流式分選、顯微切割等方式分選出單細胞,然后進行微量建庫,該流程操作復雜、通量低、成本高;目前主流的高通量單細胞捕獲測序是通過Barcode標記單個細胞,將多個細胞混合建庫測序,后續(xù)數(shù)據分析的時候,將同一Barcode標記的分子信息視為來自同一個細胞。
單細胞轉錄組測序流程
以下流程以尋因生物為代表的微流控數(shù)字液滴+Barcoded Beads技術的高通量單細胞轉錄組建庫試劑盒流程,結合??芕itae 120 NGS-SA建庫儀,實現(xiàn)8個樣本的高效細胞轉錄組的測序文庫構建。
在單細胞轉錄組測序流程中,文庫構建環(huán)節(jié)可搭載??芕itae 120 NGS-SA建庫儀自動化完成文庫構建流程。
Vitae 120 NGS-SA建庫儀可以完成的建庫流程
Vitae 120 NGS-SA建庫儀
包含建庫所需要的所有功能模塊(PCR板冷槽、PCR 板加熱模塊、PCR 板振蕩模塊、PCR板磁力架、PCR儀),滿足不同建庫流程的需要;
軟件功能模塊化,無需編寫腳本,通過拖拽式編輯即可適配不同的實驗流程;
積累多個廠家建庫流程的測試(諾唯贊、華大、KAPA、illumina、Pacbio、Nanopore),建庫結果穩(wěn)定有保證。
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