短串聯(lián)重復(fù)序列 （short tandem repeat ， STR） ，也稱微衛(wèi)星 DNA（microsalite DNA） ，由于其能提供大量的遺傳標(biāo)記，因此被認(rèn)為是繼限制性片段長度多態(tài)性 （RFLP） 之后的第二代遺傳標(biāo)記，STR分析已廣泛應(yīng)用于遺傳制圖、連鎖性分析、親子鑒定、疾病基因定位和物種多態(tài)性研究等諸多領(lǐng)域。高度多態(tài)的微衛(wèi)星還可以用來在人群進行個體識別。

微衛(wèi)星（STR）檢測

STR原理

    短串聯(lián)重復(fù)序列（short tandem repeat, STR），也稱微衛(wèi)星 DNA（microsalite DNA） ，是由2 - 6個堿基對作為核心單位，串聯(lián)重復(fù)形成的一類DNA序列，由于核心單位重復(fù)數(shù)目在個體間呈高度變異性并且數(shù)量豐富，構(gòu)成了STR基因座的遺傳多態(tài)性。它分布于人類整個基因組，平均每15 kb就存在一個STR基因座。人類基因組內(nèi)已發(fā)現(xiàn)了七千個以上的STR位點。它具有分布廣泛，易于檢測，信息量大，有高度多態(tài)性并遵循孟德爾共顯性遺傳等優(yōu)點。是繼限制性片段長度多態(tài)性 （RFLP） 之后的第二代遺傳記，目前STR分析已廣泛應(yīng)用于遺傳制圖、連鎖性分析、法醫(yī)學(xué)鑒定、疾病基因定位、物種多態(tài)性和遺傳病的診斷等諸多領(lǐng)域。

微衛(wèi)星（STR）檢測服務(wù)流程

1. 客戶提供

   A.如果提供基因組DNA：至少提供100 ng DNA樣品（針對每個多態(tài)性位點，需樣品3-5 ul，濃度為30 - 50 ng/ul）

   B.如果提供PCR產(chǎn)物：產(chǎn)物要通過預(yù)實驗的電泳檢測，特異性要好

   C.如果需要設(shè)計引物，請?zhí)峁┠康钠涡蛄谢蛘呶⑿l(wèi)星檢測位點，引物設(shè)計好后需要客戶確認(rèn)。

   D.除提供樣品類型，DNA濃度和純度值外，還需要注明可能殘留的抑制劑成分。樣品溶解在ddH2O中，如果不是，請注明溶解液成分。

2. 確定STR位點，設(shè)計實驗方案，包括熒光標(biāo)記的選擇，引物的設(shè)計、合成和標(biāo)記，熒光分子量內(nèi)標(biāo)的選用等。

3. 按照所設(shè)計的實驗方案完成熒光PCR，利用瓊脂糖電泳檢測結(jié)果；若PCR產(chǎn)物特異性不夠，將進行優(yōu)化。

4. PCR產(chǎn)物通過ABI 3730XL 測序儀器進行毛細(xì)管電泳檢測，獲得擴增片段大小的數(shù)據(jù)

5. 用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等軟件對收集到的數(shù)據(jù)進行處理分析，將產(chǎn)物片段大小、數(shù)量多少的信息轉(zhuǎn)化成直觀準(zhǔn)確的波形圖譜，為下一步進行關(guān)聯(lián)分析或連鎖分析等遺傳分析提供可靠的數(shù)據(jù)。

6.發(fā)送準(zhǔn)確的微衛(wèi)星（STR）分型結(jié)果報告及PCR產(chǎn)物。