多重?zé)晒饷庖呓M化Q&A——第三彈
Q:我該如何得到wan美的多色結(jié)果呢?
A:首先,您需要有質(zhì)量不錯(cuò)的樣本和抗體,這就已經(jīng)是成功的一半(樣本、抗體選擇攻略),對(duì)于樣本來(lái)說(shuō),脫片是我們需要預(yù)防的“頭號(hào)公敵",多色實(shí)驗(yàn)需要重復(fù)熱修復(fù)洗脫抗體多次,假如片子脫片,輕則成像模糊,重則組織脫落前功盡棄,可以在開(kāi)始實(shí)驗(yàn)之前先模擬幾輪熱修復(fù),不加抗體和其他試劑,看看組織是否有脫落的跡象,如果脫落比較嚴(yán)重,則需要重新制備切片,如果有輕微脫片,則可以考慮購(gòu)買抗體洗脫液(abs994),替代熱修復(fù)的過(guò)程;然后,就可以開(kāi)始做實(shí)驗(yàn)了,我們建議您*行抗體和染料工作條件摸索,再上多染(參考下圖流程),這樣多染的成功率可以達(dá)到90%以上哦?。ㄐ?ài)經(jīng)驗(yàn)之談,即便是染了千百遍的常見(jiàn)指標(biāo),換個(gè)樣本,染色效果就可能天差地別,有條件還是建議要做預(yù)實(shí)驗(yàn))
最后的10%,就需要調(diào)整指標(biāo)與染料搭配以及染色的順序了。
Q:有沒(méi)有推薦的染料搭配和染色順序呢?
A:染料搭配一般遵循“寡靶配強(qiáng)光,眾靶配弱光"的原則,意思是表達(dá)比較弱的指標(biāo)搭配熒光信號(hào)比較強(qiáng)的染料,表達(dá)相對(duì)強(qiáng)的指標(biāo)搭配信號(hào)比較弱的染料,Absin的TSA染料波長(zhǎng)越短熒光強(qiáng)度越強(qiáng),比如說(shuō)需要染PD-1,CD8和CD3,我們手里有一個(gè)四色試劑盒(TSA520/TSA570/TSA650),通過(guò)IHC發(fā)現(xiàn)樣本中PD-1的信號(hào)很少,CD3信號(hào)非常多,其次是CD8,于是選擇TSA520搭配PD-1,TSA650搭配CD3,TSA570搭配CD8,比較合理。
接下來(lái)就是怎么安排染色先后順序:①劃分細(xì)胞定位,先外后內(nèi):確定每個(gè)指標(biāo)的細(xì)胞定位,膜表達(dá)先染,胞漿或者胞核的后染(如果是指標(biāo)比較多的情況下,胞內(nèi)指標(biāo)排在比較后面,經(jīng)過(guò)前期多輪洗脫,可以不做細(xì)胞通透;如果指標(biāo)很少,染胞內(nèi)指標(biāo)之前還是需要打孔,多個(gè)胞內(nèi)指標(biāo)也只需要打一次孔);②確定抗原修復(fù)方式,先酸后堿:堿修復(fù)比酸修復(fù)的力度會(huì)更強(qiáng),個(gè)別抗體在用堿修復(fù)以后會(huì)染出來(lái)很多非特異性,所以如果是相同的細(xì)胞定位,就先染酸修復(fù),再染堿修復(fù)的抗體;③根據(jù)IHC結(jié)果判別,先弱后強(qiáng):組化結(jié)果顯示指標(biāo)比較少,比較弱的,排在前面染,理論上來(lái)說(shuō)越靠前染的指標(biāo)效果會(huì)越接近單標(biāo)染色。
以上就是一些通用規(guī)則,但不同的指標(biāo)還是可能出現(xiàn)變化,要想得到wan美的結(jié)果,就需要不同的排列組合一個(gè)一個(gè)嘗試(如下表,“X"代表有信號(hào)),這樣會(huì)比較耗費(fèi)時(shí)間和試劑,您可以根據(jù)通用規(guī)則先行一次多染,然后各通道跟熒光單染做對(duì)比,如果效果差別很大,那就再調(diào)整染色順序,如果單染的結(jié)果跟組化差別比較大(出現(xiàn)高背景,非特異性明顯),就要考慮更換染料搭配。
Q:我成像完了以后想要做數(shù)據(jù)分析,你們有什么軟件推薦嗎?
A:目前市面上數(shù)據(jù)分析軟件還是比較多的,像免費(fèi)的您可以下載imageJ、Qupath,缺點(diǎn)就是用法都需要您自行摸索;我們公司安裝的是HALO和StrataQuest兩款軟件,HALO是付費(fèi)的,StrataQuest是我們TG的掃描儀平臺(tái)自帶的,從功能、分析的精準(zhǔn)度和可操作性來(lái)說(shuō),肯定是大大優(yōu)于開(kāi)源軟件的,且有軟件專業(yè)的技術(shù)支持團(tuán)隊(duì)能夠答疑解惑。您可以根據(jù)您的實(shí)際情況選擇合適的分析軟件,如果您實(shí)在無(wú)從下手,也可以找Absin,我們可以提供數(shù)據(jù)分析的服務(wù)~
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Absin病理抗體指標(biāo)大全:
CD相關(guān)抗體:CD3、CD8a、CD4、CD68、CD206、CD163、CD20、CD19、CD45、CD56、CD10、CD117、CD138、CD14、CD146、CD15、CD1a、CD2、CD21、CD23、CD25、CD30、CD31、CD34、CD35、CD38、CD3G、CD44、CD5、CD7、CD79a、CD79B、CD99
角蛋白(CK)相關(guān)抗體:panCK、CK-4、CK HMW、CK-1、CK-10、CK-14、CK-17、CK-18、CK-19、CK-20、CK-5、CK-5&6、CK-6、CK-7、CK-8、CK-8&18
癌癥腫瘤相關(guān):p120、p16、p21、p40、p53、p63、AFP、ALK、AMACR、ANXA1、Aurora-B、Bcl-6、CTNNB1、CA125、CDK4、CDX2、CEA、CCND1、c-MET、c-Myc、DOG1、CDH1、EGFR、EpCAM、ERG、EZH2、FABP3、FGFR2、FOXP1、GATA-3、GCDFP-15、GPC3、GZMB、HER-2、IDH1 R132H、Ki-67、LDLR、MCM7、MCM3、MGMT、MSH2、MSH6、MUC1、MUC2、MUC4、MUM1、MyoD1、Myogenin、Myosin (Smooth Muscle)、Napsin-A、N-Cadherin、Olig2、PAX-2、PAX-5、PAX-8、PCT、PD-1、PHH3、PLAP、PMEL-17、PDPN、PR、PSA、PSAP、S100A1、S100P、SALL4、SATB1、SF-1、SOX10、SOX11、SOX2、STAT6、Stathmin、TCL1、TFE3、TG、TLE1、TOP2A、TPO、TRPS1、TTF-1、Type I Cytokeratins、Type II Cytokeratins、Uroplakin III、Villin、WT1、ZAP-70
神經(jīng)相關(guān):ATRX、p75 NGF Receptor、CgA、DDX4、GFAP、λLight Chains、MBP、NeuN、Neurofilament、NSE、Olig2、p75 NGF Receptor、S100、SYP
血管:ACE2、VEGF、VWF
鈣蛋白:CALB1、Caldesmon、Calponin、Calcitonin、Calprotectin
其他:MPO、AR、Arg-1、AR-V7、B2M、CLDN1、Collagen Type Ⅳ、COL4A5、ERα、GH、HBSAg、hCG、hCG-beta、hPL、IgD、IgG、IgM、IGFBP3、Insulin、Oct3/4、SCGN、Somatostatin、TDT、Actin、Desmin
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