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生物樣本庫∣核酸樣本質(zhì)控∣這些你都知道嗎?

閱讀:531        發(fā)布時間:2023-8-22

生物樣本庫(Biobank),又被成為生物銀行。根據(jù)經(jīng)濟合作與發(fā)展組織(OECD)的定義,"生物樣本庫(Biobank)是一種集中保存各種人類生物材料(Human biological material),用于疾病的臨床治療和生命科學(xué)研究的生物應(yīng)用系統(tǒng)"。根據(jù)GB/T 37864-2019《生物樣本庫質(zhì)量和能力通用要求》等指導(dǎo)文件,生物樣本庫必須做好核酸質(zhì)控,包括對DNA,RNA樣本的純度,濃度以及完整性做好檢測。

 

 

核酸樣本質(zhì)控方法推薦

根據(jù)GB/T40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評價方法》,分別對DNA和RNA樣本的濃度、純度、完整性提出了推薦的質(zhì)控方法。

  • 濃度:分光廣度法、熒光染料檢測法 熒光定量 PCR法和數(shù)字 PCR法

  • 純度:分光光度法和 瓊脂糖凝膠電泳法

  • 完整性:凝膠電泳法, 毛細(xì)管凝膠電泳法(安捷倫Tapestaion分析儀) 和微流控分析法(安捷倫2100生物分析儀)

 

核酸樣本質(zhì)控

1、安捷倫2100生物分析儀

2100生物分析儀是核酸質(zhì)控屆的常青樹,是國際生物和環(huán)境樣本庫協(xié)會(ISBER)《生物樣本庫最佳實踐》,GB/T 40664-2021《用于高通量測序的核酸類樣本質(zhì)量控制通用要求》,GB/T 40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評價方案》等指導(dǎo)文件中推薦的生物樣本庫核酸質(zhì)控方法。

2100生物分析儀采用微流控芯片技術(shù),樣本進入芯片后,進行電泳分離。使用數(shù)字化評價體系,評估樣本質(zhì)量,其中RNA完整性指標(biāo)RIN值是業(yè)內(nèi)gong認(rèn)的金標(biāo)準(zhǔn)。

 

圖 1 微流控芯片示意圖

 

2、安捷倫Tapestation 分析儀

Tapestation 是安捷倫旗下推出一款du創(chuàng)的膠條式自動化電泳分析儀,也是國內(nèi)外眾多生物樣本庫核酸質(zhì)控的選擇。這款儀器自動化程度非常高,用預(yù)制膠條取代傳統(tǒng)繁瑣的制膠過程,膠條采用獨立泳道,有效避免污染。

 

圖 2 Tapestation 預(yù)制膠條

 

Tapestation 共有兩款型號,提供靈活通量,減少單次上機成本。

 

  • 4150 TapeStation

– 從兩個 8 聯(lián)管上樣

– 完整的可擴展性:可分析 1–16 范圍內(nèi)任意數(shù)量的樣品

– 16 個樣品在 20 分鐘內(nèi)即可獲得可靠且可重現(xiàn)的結(jié)果

– 占地面積小,節(jié)省寶貴的實驗室臺面空間

 

  • 4200 TapeStation

– 可對多達(dá) 96 個樣品進行全自動樣品處理

– 從兩個 8 聯(lián)管或一個 96 孔板上樣

– 完整的可擴展性:可分析 1–96 范圍內(nèi)任意數(shù)量的樣品

– 1–2 分鐘內(nèi)即可獲得一個樣品的可靠重現(xiàn)結(jié)果,90 分鐘內(nèi)可獲得 96 個樣品的結(jié)果

 

圖 3 Tapestation 分析儀 ,型號4150(左),型號4200(右)

 

Reference:

1、GB/T 37864-2019《生物樣本庫質(zhì)量和能力通用要求》

2、GB/T 40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評價方案》

3、安捷倫5991-3143ZHCN

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