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盤點(diǎn)RNA降解的常見(jiàn)原因
閱讀:2531發(fā)布時(shí)間:2023-11-2
RNA降解是一個(gè)常見(jiàn)的問(wèn)題,特別是在進(jìn)行RNA提取和下游分析時(shí)。以下是導(dǎo)致RNA降解的一些常見(jiàn)原因及其相應(yīng)的解決方案:
新鮮細(xì)胞: 裂解液不足會(huì)導(dǎo)致裂解不充分,從而使部分RNA未被釋放出來(lái)。為了確保RNA釋放出來(lái),應(yīng)在裂解過(guò)程中加入足夠的裂解液。
新鮮組織: 若組織中含有內(nèi)源性核酸酶,則很難避免RNA酶的降解。建議采用的方法是在液氮條件下將組織研磨,并且,在勻漿時(shí)采用更多的裂解液。
冷凍樣品: 如果樣品未經(jīng)液氮速冷直接轉(zhuǎn)移到-70℃冰箱存放,會(huì)使RNA緩慢降解。為了避免這種情況,應(yīng)在樣品取材后迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉(zhuǎn)移到-70℃冰箱存放。
外源RNA酶的污染: 實(shí)驗(yàn)試劑、器械等實(shí)驗(yàn)用品應(yīng)采用DEPC水滅菌處理,以消除外源RNA酶的污染。
內(nèi)源RNA酶的污染: 抑制劑失效或者用量不夠,以及實(shí)驗(yàn)樣品過(guò)多或勻漿溫度過(guò)高都可能導(dǎo)致內(nèi)源RNA酶的污染。為了減少內(nèi)源RNA酶的影響,可適當(dāng)增加抑制劑的濃度,確保樣品處理時(shí)處于適宜的溫度。
長(zhǎng)時(shí)間暴露于高溫或光照環(huán)境下: RNA容易受到紫外線和高溫的影響而發(fā)生降解,因此在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中應(yīng)避免樣品暴露于高溫或光照環(huán)境下。
提取過(guò)程中的反復(fù)冷凍解凍: 這種情況會(huì)破壞RNA結(jié)構(gòu),使其更容易受到酶的作用而降解。因此,在RNA提取過(guò)程中應(yīng)盡量減少冷凍解凍次數(shù),最好一次性完成整個(gè)提取過(guò)程。
產(chǎn)品名稱:PAXgene全血RNA管 樣本采集保存
產(chǎn)品貨號(hào):762165
產(chǎn)品規(guī)格:2.5mL,100支/盒
PAXgene血液RNA管旨在立即穩(wěn)定細(xì)胞內(nèi)RNA,從而產(chǎn)生準(zhǔn)確且可重復(fù)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。PAXgene血液RNA管含有一種專有試劑,可在采集后立即穩(wěn)定細(xì)胞內(nèi)RNA。細(xì)胞內(nèi)RNA在室溫下穩(wěn)定長(zhǎng)達(dá)三天或在2-8°C下穩(wěn)定長(zhǎng)達(dá)五天。PAXgene試管可以在-20°C至-70°C的溫度下冷凍,以便長(zhǎng)期儲(chǔ)存。
產(chǎn)品信息:
管材 塑料
管尺寸16x100 mm
采血量2.5 mL
管蓋 BD Hemogard型閉合器™
封口顏色 紅色
添加劑6.9 mL專有RNA穩(wěn)定添加劑
滅菌輻射 10-6 SAL,ISO11137-1
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