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關(guān)鍵詞:細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)
簡介:世界*品牌細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)原裝,質(zhì)量保證,*。
細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定技術(shù)服務(wù)|實驗技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達(dá)體系。
我們具備豐富的蛋白表達(dá)設(shè)計經(jīng)驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。我們所有的實驗數(shù)據(jù)真實可信,我們提供原始的表達(dá)菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實驗報告重復(fù)我們的實驗結(jié)果。
產(chǎn)品品牌: http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
測序?qū)嶒灹鞒蹋?br>細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定
16S rDAN是編碼原核生物核糖體小亞基rRNA(16S rRNA)的基因。 長度約為1500pb,是細(xì)菌分類學(xué)研究中zui常用、zui有用的"分子鐘16S rRNA其大小在1,500 bp左右,所代表的信息量適中,因此是進(jìn)行分類研究的理想材料。利用16S rDNA兩端的引物PCR擴(kuò)增未知菌株的16S rRNA基因,并進(jìn)行DNA測序,與GenBank中的已知序列進(jìn)行同源性比較后,判定細(xì)菌種類,將細(xì)菌劃分到屬或種。
提供擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA的全長序列,約1,500 bp,進(jìn)行進(jìn)行全序列測序,BLAST,以得到較為全面的種屬特異性信息,確定樣品的種類。
服務(wù)要求
1. 請?zhí)峁┗蚪MDNA、經(jīng)菌種分離后帶有單菌落的新鮮平板或斜面。
2. 基因組DNA的濃度≥10 ng/μl,總體積≥20 μl,且無明顯降解;平板或斜面應(yīng)長有分離的單菌落。
3. 由于革蘭氏陽性細(xì)菌或厭氧菌、放線菌等特殊菌株,請在服務(wù)委托書中加以說明。
4. 如果測序結(jié)果出現(xiàn)如下套峰,視為樣品不純,本公司將收取全額實驗費用。并建議克隆多個測序鑒定。
服務(wù)基本流程
1. 信諾金達(dá)進(jìn)行引物設(shè)計合成;
2. PCR擴(kuò)增16S rDNA;
3. PCR產(chǎn)物純化;
4. 測序,序列比對分析。
服務(wù)報告內(nèi)容
實驗報告包括PCR產(chǎn)物照片、NCBI序列比對鑒定結(jié)果、測序報告、序列堿基圖、以及剩余模板;
服務(wù)編號 服務(wù)項目 內(nèi)容說明 價格 周期
SGSBD01 細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定 16S rDNA全序列比對分析 ¥400/樣品 1-2周*
SGSBD02 細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定 16S rDNA全序列擴(kuò)增,克隆測序,比對分析 ¥1000/樣品 2周
*價格不含DNA提取費用,如果樣品多或者特殊,時間協(xié)商。
技術(shù)特點
高通量:一次測序得到別以上條數(shù)的序列信息
高準(zhǔn)確性:從幾個到幾十萬個拷貝的計數(shù)
高分辨率:可以檢測至單堿基差異
重復(fù)性好:深度測序保證了檢測的隨機(jī)性,可不需技術(shù)重復(fù)
成本低耗時短:相比于Sanger測序,價格及成本要低很多
生物信息學(xué)分析內(nèi)容
標(biāo)準(zhǔn)信息分析
1. Reads拼接,獲取Unique tags
2. OTU生成及統(tǒng)計分析
3. 物種注釋及豐度統(tǒng)計
4. 樣品OTU及物種豐度Heatmap圖
5. Alpha多樣性分析
6. Beta多樣性分析
定制化信息分析
1. 樣品差異主要因子分析
2. 樣品間主坐標(biāo)分析(PCoA)
3. 樣品非加權(quán)配對平均法聚類分析(UPGMA)
4. 組間顯著性差異分析
5. 系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
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