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蛋白質(zhì)的折疊速率
蛋白質(zhì)的折疊是指一個蛋白質(zhì)從它的變性狀態(tài)轉(zhuǎn)變到它的特定生物學天然構(gòu)象的過程?,F(xiàn)在人們已經(jīng)普遍接受了共翻譯折疊的理論,認為mRNA在核糖體上翻譯的過程,蛋白質(zhì)折疊就開始了,這一過程遵循自由能減少規(guī)律,即蛋白質(zhì)在一定時間內(nèi)沿著某一或某些特定的路徑(過渡態(tài)系統(tǒng))達到其自由能小(極?。┑奶烊粯?gòu)象。各種光譜技術,質(zhì)譜和核磁共振等試驗方法都可用來研究蛋白質(zhì)的折疊,為研究蛋白質(zhì)折疊速率預測累積了許多試驗數(shù)據(jù)。為了理解蛋白質(zhì)的折疊機理,其重要任務之一便是確定蛋白質(zhì)折疊速率的決定因素。許多對小的二態(tài)蛋白質(zhì)的理論研究表明,蛋白質(zhì)的大小 形態(tài)以及結(jié)構(gòu)特征等都對其折疊速率產(chǎn)生影響,但在揭示它們的相互關系過程中受到種種限制。經(jīng)過多年的努力,到現(xiàn)在已經(jīng)產(chǎn)生了許多較好的方法,能夠比較地預測出一些小型蛋白質(zhì)的折疊速率。有的蛋白質(zhì)折疊需要幾毫秒,而有的蛋白質(zhì)折疊需要幾個小時,所以不同蛋白質(zhì)的折疊速率(蛋白質(zhì)折疊所用時間的倒數(shù))差別很大,為了便于不同蛋白質(zhì)折疊速率的比較,人們常用In來表示蛋白質(zhì)的折疊速率。蛋白質(zhì)折疊速率的預測方法大致分為基于蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的預測方法,基于蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預測方法和基于蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的預測方法。
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