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蘋果酸脫氫酶的活性位點(diǎn)由一個(gè)高度憎水泡組成,它包括底物結(jié)合位點(diǎn)和結(jié)合輔酶的尼克酰胺環(huán)。在酶、輔酶、底物三元復(fù)合體上,構(gòu)象變化形成一個(gè)外部的活動(dòng)環(huán)。此環(huán)靠近活性位點(diǎn)泡,可以有助于將底物及其他重要的催化殘基從溶液中篩出。X-射線衍射實(shí)驗(yàn)表明,蘋果酸脫氫酶和乳酸脫氫酶在存在或不存在底物類似物時(shí),均有兩個(gè)具外部環(huán)的構(gòu)象形式,而環(huán)的位置要么在活性位點(diǎn)之上,要么在其之下。在蘋果酸脫氫酶中,該環(huán)結(jié)構(gòu)高度保守,反映了它在催化功能上的重要性。用熒光底物類似物實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)線粒體蘋果酸脫氫酶與NAD*結(jié)合時(shí),其底物結(jié)合位點(diǎn)有兩個(gè)不同的構(gòu)象。同樣的,用熒光輔酶類似物則發(fā)現(xiàn)與底物的結(jié)合可以引起尼克酰胺結(jié)合位點(diǎn)的區(qū)域性構(gòu)象變化。
圖1大腸桿菌蘋果酸脫氫酶陰離子結(jié)合腔
eMDH活性位點(diǎn)結(jié)構(gòu)的理論模型(1cme)示于圖1-,可以看出eMDH的活性催化位點(diǎn)是由Arg-81、Arg-87、Asn-119、Asp-150及His-177組成的(圖1-3中用氨基酸簡碼示出),構(gòu)成了一個(gè)大的陰離子結(jié)合腔,Arg-81、Arg-87在結(jié)合腔的內(nèi)部提供陽離子結(jié)合二羧酸底物,Arg153與a-OH結(jié)合,這一步?jīng)Q定了結(jié)合底物的專一性。His-177~Asp-150構(gòu)成的質(zhì)子傳遞系統(tǒng)將α-OH的氫離子轉(zhuǎn)移至輔酶NAD+,從而完成催化過程。這幾個(gè)關(guān)鍵氨基酸哪怕只有一個(gè)發(fā)生變化都會(huì)嚴(yán)重影響蘋果酸脫氫酶的酶活性。
西安齊岳生物科技可以提供酶化學(xué)產(chǎn)品包括有β-半乳糖氧化酶,彈性蛋白酶,脫氧核糖核酸酶I,膠原酶,梭菌蛋白酶,酯酶等
齊岳生物供應(yīng)部分產(chǎn)品列表
HRP-SH Thiol 炔基 |
HRP-Biotin |
HRP-CHO aldehyde 醛基 乙醛 |
HRP-OPSS 鄰吡啶二硫 巰基吡啶 |
HRP-OH hydroxyl 羥基 |
HRP-Hydrazide, HZ 酰基 |
HRP-Silane 硅烷 |
HRP-DBCO 二苯基環(huán)辛炔 |
HRP-TCO |
HRP-TZ Tetrazine, 四嗪 |
HRP-Folate ,F(xiàn)A, folic acid |
HRP-TPP 磷酸三苯酯 |
HRP-Dopamine 多巴胺 |
HRP-Ferrocene 二茂鐵 |
HRP-DOTA 四氮雜環(huán)十二烷四乙酸 |
HRP-NOTA |
HRP-Dansyl 丹磺酰氯 |
HRP-NBD |
HRP-Cyanur氰尿酸 |
HRP-TRITC 四甲基羅丹明 |
HRP-6-FAM 6-羧甲基熒光素 |
HRP-FITC 異硫氰基熒光素 |
HRP-CY3 菁染料CY3 |
HRP-CY5 |
HRP-CY5.5 |
HRP-CY7 |
HRP-CY7.5 |
HRP-Rhodamine B 羅丹明B |
HRP-ICG 吲哚菁綠 |
HRP-Comarin |
HRP-NIR-II dyes 近紅外二區(qū)染料 |
HRP-NIR-dyes 近紅外染料 |
HRP-Bodipy(BDP) 氟化硼二吡咯 |
HRP-IR825 |
HRP-HMME血卟啉單甲醚 |
HRP-Ce6 二氫卟吩 |
HRP-PLGA |
HRP-PCL 聚已內(nèi)酯 |
HRP-PLA 聚乳酸 |
HRP-PAA 聚丙烯酸 |
HRP-PS 聚丙乙烯 |
HRP-PEI 聚乙烯亞胺 |
zl 02.24
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