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技術(shù)文章

怎樣開始腫瘤細(xì)胞重編程

閱讀:397          發(fā)布時(shí)間:2017-8-31

腫瘤細(xì)胞環(huán)境有著超越基因組的影響,正因如此,大規(guī)模“組學(xué)"數(shù)據(jù)將是未來細(xì)胞重編程的一個(gè)重要方面。雖然我們認(rèn)為iPSC和ESC在功能上是相同的,但轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和表觀基因組水平的深入研究將有助于闡明環(huán)境對(duì)重編程的影響。另外,在單個(gè)細(xì)胞中同時(shí)檢測(cè)多個(gè)“組學(xué)",將能鑒定那些造成iPSC多能性差異的基礎(chǔ)元件。
目前,細(xì)胞重編程領(lǐng)域普遍缺乏定量數(shù)據(jù)。實(shí)際上,文獻(xiàn)中的重編程效率差異,可能更多的是由體細(xì)胞內(nèi)部異質(zhì)性造成的,而不是方法學(xué)上的問題。定量理解這樣的異質(zhì)性,可以幫助我們從細(xì)胞群體中區(qū)分出想要的細(xì)胞。
上海滬宇等人通過細(xì)胞重編程的兩個(gè)狀態(tài),描述了異質(zhì)性產(chǎn)生的基礎(chǔ)。首先,OSKM轉(zhuǎn)基因激活一系列隨機(jī)事件,當(dāng)這些事件達(dá)到“適當(dāng)"條件時(shí),細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)榈诙€(gè)狀態(tài)。這個(gè)狀態(tài)會(huì)出現(xiàn)決定性的基因表達(dá),此時(shí)轉(zhuǎn)基因被沉默,細(xì)胞被重塑為多能性狀態(tài)。在Buganim這個(gè)模型中,轉(zhuǎn)基因激活與沉默之間的平衡,是細(xì)胞重編程效率低的重要原因。我們可以換一種途徑進(jìn)行重編程,激活或沉默非基因組的因子,將有望顯著提高重編程效率。“組學(xué)"數(shù)據(jù)無疑能加深我們對(duì)這些因子的認(rèn)識(shí),幫助我們理解細(xì)胞重編程的必要條件和非必要條件。
在這些信息的基礎(chǔ)上,我們可以同步細(xì)胞動(dòng)態(tài),在引入轉(zhuǎn)基因時(shí)讓大多數(shù)細(xì)胞處于*狀態(tài)。已經(jīng)有前期工作表明,重編程動(dòng)態(tài)受到一些限速步驟的調(diào)控。比如,去除組蛋白乙?;囊粋€(gè)抑制子,可以使體外重編程的效率達(dá)到幾乎100%。此外,引入OSKM也會(huì)刺激甲基化等細(xì)胞過程,以維持內(nèi)穩(wěn)態(tài)。對(duì)于研究這些過程的動(dòng)態(tài)而言,定量技術(shù)將特別有優(yōu)勢(shì)。FACS和拉曼光譜才剛開始用于細(xì)胞重編程的定量研究,就已經(jīng)表現(xiàn)出了很大的潛力。
腫瘤細(xì)胞重編程受到公眾關(guān)注,主要是因?yàn)樗诩膊∧M和醫(yī)療保健中的應(yīng)用。神經(jīng)退行性疾病的患者特別能從這一技術(shù)中獲益,因?yàn)樯缮窠?jīng)元的iPS方案要優(yōu)于其他細(xì)胞類型,而且患者神經(jīng)元通常很難獲取。目前,細(xì)胞重編程技術(shù)研究特定基因組突變引起的疾病,因?yàn)橹鼐幊虝?huì)重設(shè)表觀基因組。盡管有證據(jù)表明,iPS技術(shù)也能用來研究復(fù)雜基因組改變引起的疾病,但目前的模型一般不足以研究異常細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)或動(dòng)態(tài)引發(fā)的疾病。
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