之前的幾期課堂講座給大家分享了ELISA實驗的原理,操作步驟以及實驗中的常見問題(感興趣的小伙伴可以去視頻專區(qū)收看),近期又收到部分小伙伴的反饋問題,主要集中在數(shù)據(jù)處理上。小編看了也覺得比較可惜,整個ELISA實驗做得不錯,可惜在后的數(shù)據(jù)處理上犯了錯誤,直接導致實驗結果出了大問題,可謂功虧一簣。接下跟著小編進行一次實戰(zhàn)案例的分析,詳細了解一下愛必信ELISA試劑盒的數(shù)據(jù)處理過程吧~
話不多說,先上圖:
圖一. 客戶提供原始OD值圖(涉及未發(fā)表數(shù)據(jù),部分隱去,部分略作處理)
圖二. 客戶處理的標準曲線圖
客戶反饋,部分數(shù)據(jù)OD出現(xiàn)負值,無法處理,覺得試劑盒有問題。小編接到這個case之后,簡單的看了一下客戶的數(shù)據(jù),就發(fā)現(xiàn)幾個明顯的數(shù)據(jù)處理問題,而根據(jù)客戶的原始OD數(shù)據(jù),初步判斷,試劑盒是正常的,并且實驗數(shù)據(jù)還比較可靠。不知道是否有聰明的小伙伴已經從這個數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了問題呢?沒關系,跟著小編一起來抽絲剝繭的詳細分析一下吧~
1. OD值出現(xiàn)負值
大量樣品孔的讀值為負數(shù),但接近零點,小編看了一下客戶標曲的0點OD值接近0,初步判斷客戶是用空白孔進行校準,但空白孔由于操作污染等原因,OD值偏高,進而導致樣品孔OD值為負。跟客戶溝通之后,確實是進行了空白孔校準。
溝通之后,確認原始空白孔讀值為0.0962,明顯偏高,正常OD450的空白孔讀值應為0.06左右。
在這里,小編建議有條件的小伙伴,盡量要用我們推薦的雙波長校正法,使用570或630nm波長進行校正,OD450 - OD570/630即為校正后的OD值,可直接用于計算,也可根據(jù)數(shù)據(jù)質量,再進行空白校正。如沒有雙波長的酶標儀,讀取OD450數(shù)據(jù)后,應先判斷數(shù)據(jù)質量,再進行空白校正。
小編將空白校正進行補回,得到的OD450原始數(shù)據(jù)如下:至此,樣品孔數(shù)據(jù)出現(xiàn)負值這一問題解決。
圖三. 經還原處理的OD450原始數(shù)據(jù)圖
2. 標曲擬合問題
處理完了負值問題,還有一個很明顯的問題就是,客戶的標曲擬合問題。我們這款試劑盒(Mouse TNF alpha ELISA Kit,abs520010)標曲高點是2000 pg/ml,客戶給我的截圖(圖二)只到250 pg/ml,再仔細研究一下,發(fā)現(xiàn)客戶的擬合方式用的竟然是直線擬合。跟客戶溝通之后,確認原因,客戶選擇直線擬合,高點不符合擬合方式,R2值過低,所以客戶自己把上面高濃度的點去掉了,只選取到250 pg/ml,進行直線擬合。在這里,小編強調一下, 愛必信ELISA試劑盒推薦擬合方式為四參數(shù)擬合,四參數(shù)擬合,四參數(shù)擬合,重要的事情說三遍。不要再用其他稀奇古怪的擬合方式進行擬合啦。就像這個客戶犯的錯誤,雖然看似250 pg/ml以下的點可以用直線擬合,但是表達含量較高的樣品,OD值高時,就不符合他擬合的這條直線了,會導致結果出現(xiàn)嚴重偏差。由于0孔出現(xiàn)問題,小編在擬合標曲時,將OD值低的孔作為空白孔,TNF-α在正常樣品中表達含量極低,可視為0,擬合曲線如下:
圖四. 四參數(shù)擬合的曲線圖及方程
回歸計算之后得到樣品濃度,部分無法計算出的樣品孔,表達含量低于0點,按0計算即可。
本期ELISA實戰(zhàn)案例解析就到這里了,希望對各位小伙伴們有所幫助。大家在平時的實驗中遇到什么問題也可以聯(lián)系我們,小編匯總之后,盡力為大家解答~
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