菌核分離：茯苓、豬苓、雷丸等菌的子實(shí)體不易采集。而常見的是它貯藏營(yíng)養(yǎng)的菌核。用菌核分離，同樣可以獲得菌種。方法是將菌核表面洗凈，用酒精消毒后，切開菌核，取中間組織一小塊，約黃豆大小，接種在PDA 培養(yǎng)基斜面上，保溫培養(yǎng)。應(yīng)注意的是，菌核是貯藏器官，大部分是多糖類物質(zhì)，只含有少量的菌絲，因此挑取的組織塊要大一些，如果組織塊過小，則不易分出菌種。

雞白痢沙門氏菌    Salmonella pullorum
膠質(zhì)芽孢桿菌    BacillusmucilaginosusKrassilnikov
羊肚菌屬    Morchella sp.
嗜酸乳桿菌    Lactobacillus acidophilus
植物乳桿菌    Lactobacillusphantarum(Orla-Jehsen)Holland
藍(lán)色犁頭霉    Absidia coerulea
串珠鐮孢    Fusarium moniliforme
巴氏醋桿菌    Acetobacterpasteurianus
火針層孔菌    Phellinus igniarius (L.) Quél.
蟬花1-13    Isaria cicadae Miq.
茯苓    Poriacocos(Fr.)Wolf
白地霉    GeotrichumcandidumLink
蛹蟲草(北冬蟲夏草，北蟲草)    Cordyceps militaris
蛹蟲草（北冬蟲夏草，北蟲草）    Cordyceps militaris
嗜熱乳酸鏈球菌    StreptococusthermophilusOrla-Jensen
白僵菌    Aspergillus awamori
構(gòu)巢曲霉    Aspergillus nidulans
產(chǎn)氨棒桿菌    Corynebacterium ammoniagenes
金黃色葡萄球菌    Staphylococcus aureus
糞腸球菌    Enterococcus faecalis
致瀉大腸埃希氏菌    Escherichia coli EPEC O86：K61
沼澤紅假單胞菌    Rhodopseudomonas palustris (Molisch) van Niel
具核梭桿菌多形亞種    Fusobacterium,nucleatum subsp. polymorphum
大腸埃希氏菌(大腸桿菌)    Escherichiacoli
東方伊薩酵母    Issatchenkiaorientalis
黑曲霉    Aspergillus niger
黑曲霉    Aspergillus,niger
熒光假單胞菌    PseudomonasfluorescensMigula
大腸埃希氏菌    Escherichia coli
大腸埃希氏菌    Escherichia coli
黑曲霉    AspergillusnigervanTieghem
茄鏈格孢（番茄早疫病菌）    Alternaria solani
茄鏈格孢（番茄早疫病菌）    Alternaria solani
辣椒疫霉    Phytophthora capsici
辣椒疫霉    Phytophthora capsici
尖鐮孢黃瓜專化型（黃瓜枯萎病菌）    Fusarium oxysporum f. sp. cucumerinum
痢疾志賀氏菌    Shigella dysenteriae
支氣管炎博德特氏菌    Bordela bronchissptica
扭脫甲基桿菌    Methylobacterium extorquens
桃色擬青霉    Paecilomyces persicinus