數(shù)碼顯微鏡的主要好處在于：傳統(tǒng)的光學顯微鏡只能供一人使用，要分享顯微鏡的影像很困難，而要拍攝顯微鏡內(nèi)的影像，亦往往需要用到特別的儀器幫助。然而，數(shù)碼顯微鏡由于可以與電腦接駁，使顯微鏡內(nèi)的視像可以透過連接到課室的投影機播放，使課室內(nèi)的學生可以一同觀看影像，對課堂秩序的管理亦有幫助。

     數(shù)碼顯微鏡與普通顯微鏡之間的不同，有下面的六大區(qū)別：

1．具有顯微攝像功能，把觀察到的顯微效果保存下來，形成圖文文件，可給相關(guān)部門互相傳閱；普通顯微鏡只能通過目鏡觀察，不能進行顯微攝像。

2．與電腦相接，可以實現(xiàn)多人同時觀察；普通顯微鏡只能一人觀察。

3．通過電腦屏幕預(yù)覽，可以減少眼睛疲勞；普通顯微鏡則需要每時每刻通過目鏡觀察，容易造成眼睛過度疲勞。

4．數(shù)碼顯微鏡的成像裝置可以有測量，打印圖文報告，錄像等功能；普通顯微鏡只能單純的進行顯微觀察。

5．數(shù)碼顯微鏡是現(xiàn)代科學儀器儀表發(fā)展的一個新時代，具有很多普通顯微鏡沒有的功能。它在科學研究、產(chǎn)品檢測、教學演示、考古等方面都有迅速的發(fā)展。