VIRA-PORE COVID類似病毒空氣采樣技術驗證摘要
VIRA-PORE空氣病毒采樣盒
空氣采樣盒,用于收集病毒顆粒
具有ZePore™過濾器的Vira-Pore病毒采樣盒經(jīng)過專門設計和驗證,可用于收集空氣傳播中的冠狀病毒,并且它可用于采樣其他類似的病毒。
目標
為了確定冠狀病毒空氣采樣的合適參數(shù),本驗證采用直徑37mm孔徑1 µm的PTFE層壓“ ZePore” 空氣病毒過濾器對冠狀病毒的替代物--人類冠狀病毒OC43(HCoV OC43)進行空氣采樣。 人冠狀病毒OC43和COVID病毒均為正向單鏈RNA(+ ssRNA)β包裹的冠狀病毒,因此OC43是合適的COVID病毒模擬物。 通常以往在過濾器上進行病毒采樣的研究沒有包括基本的驗證數(shù)據(jù),例如確定從過濾器上洗脫病毒的合適技術,在采樣過程中或在運輸及存儲過程中病毒在過濾器上的穩(wěn)定性等數(shù)據(jù)。
方法
標準化病毒空氣采樣的持續(xù)時間,提取洗脫的病毒RNA,然后用超微量核酸蛋白分析儀進行RNA定量(ng / µL為單位),采用熒光定量PCR儀對現(xiàn)場樣品進行測試,所有實驗均重復三次(除非另有說明)。實驗結果采用病毒相對回收質(zhì)量(relative recovery)來表示。病毒相對回收質(zhì)量(RRmass)是從過濾器洗脫的病毒質(zhì)量濃度(ng / ml)相對于初始霧化器懸浮液中病毒質(zhì)量濃度(ng / ml)的比率。過濾器安裝在“開口式”的37mm三層導電聚丙烯盒中。導電盒優(yōu)選用于空氣微粒采樣,以防止靜電吸附到盒壁。空氣流量初步設置為10 L / min,方便在短時間內(nèi)較大程度地收集病毒。帶有過濾器和支撐墊的壓降為17英寸水壓,與某些個人采樣泵(例如Gilian 12或GSA SG10或SG10-2)兼容??諝鈽悠芬?span style="font-family:helvetica">10 L / min的流量進行病毒顆??諝獠蓸?span style="font-family:helvetica neue">10分鐘,同時另一個樣品采用對過濾器加標病毒顆粒懸浮液,兩個樣品均使用兩種不同的方法對病毒RNA進行洗脫。兩種情況下回收率均較高的洗脫方法都是將濾膜向內(nèi)卷起來,然后將其放入裝有1 mL MTM培養(yǎng)基(Longhorn Vaccines and Diagnostics™,Inc。)的2 mL微量離心管中,并渦旋三次,每次渦旋10秒。霧化病毒懸浮液是使用Collison霧化器在II級生物安全柜中產(chǎn)生的。此過程產(chǎn)生的平均空氣傳播顆粒濃度為~1 x 10^8/ L。進行空氣采樣,采樣10分鐘,60分鐘后,立即將濾膜中的病毒洗脫下來, 或采樣10分鐘將其暴露在清潔的氣流中60分鐘再洗脫病毒。
結果
對于采樣10分鐘的樣品,RNA質(zhì)量濃度和RRmass(圖1中的紫色條)分別為2.0 x 10^6 ng / mL(±1.06 x 10^6)和0.55(±0.18)。對于采樣60分鐘的樣品,平均RNA質(zhì)量濃度為5.98 x 10^6 ng / mL(±1.79 x 10^6),調(diào)整采樣時間后的RRmass(圖1中的藍色條)為0.32(±0.10)。在采樣10分鐘的樣品中,然后將其暴露在清潔的氣流中60分鐘,RNA質(zhì)量濃度和RRmass(圖1中的橙色條)分別為2.17 x 10^6 ng / mL(±6.97 x 105)和0.50(±0.16)。這些結果表明,在分別采樣10分鐘,60分鐘和10分鐘,然后暴露于清潔氣流60分鐘后,霧化病毒的回收率是相似的,差異無統(tǒng)計學意義(p = 0.31)。在另一個實驗中,空氣樣本分別在4°C和25°C下存儲7天。在4°C下,RNA質(zhì)量濃度為4.41 x 106 ng / mL(±2.51 x 10^6),在25°C下存儲時為1.34 x 10^6 ng / mL(±8.23 x 105)。因此,房間存放條件下的平均濃度比冰箱存放條件下的平均濃度低3.3倍。由于實驗的可變性,差異沒有顯著差異(p = 0.11)。如圖1所示,4°C存儲(綠色條)和25°C存儲(黃色條)的RRmass分別為0.55(±0.31)和0.17(±0.10)。通過qRT-PCR進一步分析了上述每組實驗中的一個洗脫樣品,以顯示總RNA分析方法未產(chǎn)生誤導性結果。 對于這兩個樣品,檢測到的RNA濃度相似:每毫升4.01 x 10^6 RNA拷貝(用于4°C儲存)和每毫升4.18 x 10^6 RNA拷貝(用于25°C儲存)。對于這兩個樣品,qRT-PCR的CT值均高于30,是接近檢測下限的Ct值。 這可以解釋兩個微量樣品之間值的相似性,以及為什么與總RNA分析不同,兩個樣品之間的差異不明顯。 在進行進一步工作之前,建議在分析之前將樣品冷藏保存。
結論
•COVID病毒的替代物人類冠狀病毒OC43(HCoV OC43)被成功霧化,收集并回收用于分析。
•與搖床方法相比,渦旋洗脫產(chǎn)生更高的RNA濃度。
•在三種不同的采樣場景(10分鐘,60分鐘和10分鐘后暴露于60分鐘的清潔氣流)后,從過濾器中回收霧化病毒的差異沒有顯著差異。
•比較在4°C和25°C儲存后病毒的回收率,與在25°C儲存后相比,病毒在4°C儲存后的回收率高約3倍; 但是,由于實驗的可變性,差異沒有統(tǒng)計學意義。
注意:VIRA-PORE病毒采樣盒已經(jīng)過測試可從COVID替代病毒中回收RNA病毒,但尚未測試過從COVID病毒中收集RNA病毒。 請參閱技術摘要說明的測試方法和測試結果。 客戶應自己負責遵守(i)產(chǎn)品使用說明和(ii)收集空氣傳播的病毒后,與產(chǎn)品的使用和安全處理以及包裝,標簽和運輸有關的所有適用的政府法律,規(guī)則,法規(guī)和行業(yè)標準。生產(chǎn)商建議您在進行任何空氣采樣之前,先向具有病毒專業(yè)知識的合格環(huán)境微生物實驗室尋求指導。 尋求指導,安全的處理和運輸程序,因為COVID病毒是高度傳染性的病原體,如果暴露則具有重大健康隱患。