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初級(jí)會(huì)員 | 第6年

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miRNA qRT-PCR 系列試劑盒,快速、準(zhǔn)確定量!

時(shí)間:2020/5/19閱讀:869
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從1993年發(fā)現(xiàn)miRNA開始,有關(guān)miRNA的探索與發(fā)現(xiàn)就沒有停止過。miRNA雖只有很短的一段核苷酸,卻通過調(diào)控大量的靶基因,在基因表達(dá)中扮演了重要角色。小身體,大能量,說(shuō)的就是它——microRNA(簡(jiǎn)稱miRNA)。

miRNAs是一類長(zhǎng)約20nt~24nt長(zhǎng)度的單鏈小RNA,由細(xì)胞內(nèi)源產(chǎn)生的發(fā)卡(hairpin)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄本加工而來(lái)。miRNAs的加工成熟是一個(gè)經(jīng)歷了細(xì)胞核到細(xì)胞質(zhì)空間轉(zhuǎn)變、多種酶和輔助蛋白協(xié)調(diào)完成的受到多層次調(diào)節(jié)的多步驟精密反應(yīng):1)DNA經(jīng)過轉(zhuǎn)錄形成初級(jí)產(chǎn)物pri-miRNA;2)pri-miRNA在核內(nèi)經(jīng)Drosha酶剪切形成miRNA前體pre-miRNA;3)pre-miRNA轉(zhuǎn)運(yùn)至胞漿,經(jīng)Dicer酶剪切形成成熟的miRNA。miRNA的功能主要是沉默靶基因表達(dá):在RISC沉默復(fù)合體協(xié)助下,miRNA與其靶基因mRNA的3'-UTR(3'端的非翻譯區(qū))結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄或誘導(dǎo)mRNA降解,從而抑制蛋白翻譯。

因?yàn)閙iRNA的長(zhǎng)度比較短,因此用常規(guī)的qPCR法很難對(duì)其直接定量。所以,在針對(duì)miRNA的PCR技術(shù)中,必須要延長(zhǎng)待測(cè)miRNA的長(zhǎng)度,構(gòu)建出一個(gè)足夠長(zhǎng)的PCR模板,才能進(jìn)一步應(yīng)用PCR技術(shù)來(lái)定量分析?,F(xiàn)在常用的對(duì)miRNA的定量方法主要有兩種,分別為莖環(huán)引物法、加尾法。

頸環(huán)引物法

需要自己設(shè)計(jì)一種特殊的莖環(huán)結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄引物,一般長(zhǎng)度約為45bp。整個(gè)莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄引物由兩個(gè)部分組成:①通用的莖環(huán)結(jié)構(gòu),自身形成的莖環(huán)結(jié)構(gòu)不僅能夠有效地延長(zhǎng)miRNA的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度,同時(shí)它自身互補(bǔ)的構(gòu)象可以避免與其他同源基因結(jié)合,減少了非特異性擴(kuò)增的幾率。② 5~8個(gè)與目的miRNA的3’端反向互補(bǔ)的堿基。莖環(huán)結(jié)構(gòu)的逆轉(zhuǎn)錄引物與miRNA 分子的3’端結(jié)合,并在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下進(jìn)行反應(yīng),獲得人為加長(zhǎng)的miRNA第1鏈cDNA。

莖環(huán)反轉(zhuǎn)錄法利用可以正確折疊為莖環(huán)結(jié)構(gòu)的引物對(duì)miRNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,以獲得人為加長(zhǎng)后的miRNA cDNA第1鏈,然后利用合適的退火溫度將反轉(zhuǎn)錄引物的莖環(huán)結(jié)構(gòu)打開并與PCR擴(kuò)增的正反向引物結(jié)合,再通過染料法或探針法進(jìn)行熒光定量PCR檢測(cè)。這種方法的特異性較高,但是對(duì)引物的要求也很高,需要引物在反轉(zhuǎn)錄階段形成莖環(huán)式的正確構(gòu)型,因此設(shè)計(jì)起來(lái)較為繁瑣和困難。而且針對(duì)同一樣本中不同的目的miRNA,就需要配制不同的逆轉(zhuǎn)錄體系。所以這種方法比較適合對(duì)樣本中少量幾個(gè)miRNA的精確定量檢測(cè)。

加尾法

加尾反轉(zhuǎn)錄法利用poly(A)聚合酶為成熟的miRNA加上poly(A)尾巴,然后用5’端帶通用標(biāo)簽的Oligo-dT作為反轉(zhuǎn)錄引物,獲得人為加長(zhǎng)的miRNA cDNA第1鏈,后用與通用標(biāo)簽序列互補(bǔ)的反向引物進(jìn)行染料法或者探針法的熒光定量PCR檢測(cè)。這種方法可以批量地將所有成熟miRNA加上poly(A)尾巴,然后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和檢測(cè),無(wú)需繁瑣的引物設(shè)計(jì),因此被很多實(shí)驗(yàn)室采用。

Genecopoeia基于加尾法的All-in-One™ miRNA qRT-PCR 系列試劑盒和驗(yàn)證引物,用于miRNA表達(dá)量的高效檢測(cè)。

All-in-One™ miRNA qRT-PCR 系列試劑盒包括All-in-One™ miRNA qRT-PCR Detection Kit(miRNA檢測(cè)試劑盒)、All-in-One™ miRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit(miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒)和All-in-One™ miRNA qPCR Kit(miRNA定量試劑盒)。其中All-in-One™ qRT-PCR Detection Kit包括RT(逆轉(zhuǎn)錄)和qPCR(定量檢測(cè))兩部分試劑,利用基于SYBR® Green的qPCR技術(shù),可對(duì)低至20 pg的Total RNA(或者低至10 pg的small RNA)進(jìn)行快速、準(zhǔn)確定量。

miRNA qPCR定量檢測(cè)試劑盒

多合一miRNA第1鏈cDNA合成試劑盒2.0,貨號(hào):QP113;

多合一miRNA qRT-PCR檢測(cè)試劑盒2.0,貨號(hào):QP115

All-in-One™ miRNA系列試劑靈敏度高、特異性強(qiáng)、性價(jià)比高

  • 可對(duì)檢測(cè)低至20 pg的Total RNA(或者低至10 pg的small RNA)
  • 僅檢測(cè)成熟miRNA

驗(yàn)證引物

HsnRNA U6 primer,貨號(hào):HmiRQP9001;

M丨snRNA U6 primer,貨號(hào):MmiRQP9002

All-in-One™ miRNA 驗(yàn)證引物

  • 每條All-in-One™ miRNA 特異驗(yàn)證引物均使用磚利算法設(shè)計(jì)并經(jīng)過實(shí)驗(yàn)確證。
  • 在miRNA定量PCR試驗(yàn)中,該系列驗(yàn)證引物與基于SYBR® Green I 的All-in-One™ miRNA qRT-PCR Kit配套使用,性能可靠,重復(fù)性好。

引物驗(yàn)證結(jié)果

All-in-One™ miRNA qPCR pimer經(jīng)驗(yàn)證產(chǎn)生單一擴(kuò)增產(chǎn)物,融解曲線均呈單一銳鋒,電泳條帶均呈單一條帶,且與目標(biāo)miRNA相符。由10種人組織混合樣本的總RNA經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄形成的cDNA作為引物驗(yàn)證的模板。qPCR反應(yīng)由終濃度0.2 µM的引物和All-in-One™ qPCR Mix配合完成。(A)驗(yàn)證結(jié)果的擴(kuò)增曲線,(B)驗(yàn)證結(jié)果的熔解曲線。

 

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