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m6A三大研究領域:m6A RNA的定量; m6A 甲基轉移酶和去甲基化酶活性分析;m6A RNA富集、RNA特異性甲基化分析和文庫建立。前面已經分析過病毒m6A RNA的定量,接下來看看后面這兩塊領域吧。
一、m6A 甲基轉移酶和去甲基化酶活性分析
如果你計劃研究RNA甲基化酶或去甲基化酶的活性/抑制,可以使用核提取試劑盒,它速度快,確保分離后酶活性保持不變。一旦收集到核提取液,就可以進入有助于測量甲基化酶或去甲基化酶活性/抑制的檢測。比如比色ELISA試劑盒,cat# P-9013,它允許對提取的核樣品進行高通量或手動通量分析,并進行了優(yōu)化,以確保背景信號保持在較低水平,因此測量是準確和可靠的。
一旦工作流程中的其他步驟完成,一項研究可能會尋求富集基因組中存在m6A的部分,并通過構建文庫為下一代測序準備這些片段。EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq試劑盒,cat# P-9018,允許富集m6A RNA,同時也為構建文庫提供了額外的功能。
二、m6A RNA抗體
m6A是豐富的mRNA修飾,因此,通常是研究表觀遺傳RNA修飾的研究人員感興趣的主題。此類研究通常包含單克隆抗體和多克隆抗體,以驗證結果并幫助了解一旦宿主感染后這種特定修飾如何影響病毒的發(fā)展和疾病的影響。
N6-甲基腺苷(m6A)多克隆抗體,cat# A-1801,經過驗證的應用。DB、ELISA、ICC、IP、MeRIP、核苷酸陣列。
另外,很多朋友想知道這個抗體是否可以做WB?這個可以有,比如Synaptic Systems(SySy)可做WB的m6A抗體(m6A - 202 003、m6A - 202 011、m6A - 202 111),這三種抗體被諸多高分文章引用,可以說是非常專業(yè)了。
總結一下,病毒RNA m6A研究流程與普通的組織和細胞樣本的區(qū)別:
試劑盒一樣,方法一樣,區(qū)別就在于,病毒RNA的量和純度問題,這個會影響整個實驗流程,所以為了更好地完成實驗課題,前提是需要制備好病毒RNA樣本。
來源:艾美捷科技
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