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泛素為含76個(gè)氨基酸組成的高度保守的小分子蛋白質(zhì)、大小約為8.6 kDa,在蛋白質(zhì)降解和細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)中起著重要作用。泛素具有7個(gè)賴氨酸殘基(K6,K11,K27,K29,K33,K48,K63)和一個(gè)甲硫氨酸殘基(M1),泛素之間主要通過(guò)賴氨酸殘基和甲硫氨酸殘基進(jìn)行各種連接,由此產(chǎn)生的泛素鏈產(chǎn)生一定的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),可通過(guò)對(duì)蛋白底物進(jìn)行修飾并決定底物的功能。泛素可以通過(guò)其C-末端與靶蛋白上的賴氨酸殘基的胺基團(tuán)結(jié)合。這種結(jié)合被稱為單一泛素化。額外的泛素基團(tuán)可以通過(guò)泛素中的七個(gè)賴氨酸殘基之一與初始泛素結(jié)合。這些泛素鏈的形成被稱為多泛素化。其中最為研究的多泛素化形式是通過(guò)泛素的第48位賴氨酸(K48鏈)形成鏈。單一泛素化已被證明可以改變靶蛋白的定位、活性和/或功能。多泛素化常見的后果是通過(guò)蛋白酶體介導(dǎo)的靶蛋白降解。
將泛素連接到靶蛋白需要三種不同連接酶的協(xié)同作用,即E1(泛素活化酶)、E2(泛素結(jié)合酶)和E3(泛素連接酶),從而在泛素的C-末端和靶蛋白上的賴氨酸殘基的ε-氨基團(tuán)之間形成異肽鍵。泛素E3連接酶充當(dāng)骨架蛋白,為泛素結(jié)合酶(E2)和目標(biāo)底物提供??课稽c(diǎn)。通常,E3連接酶介導(dǎo)將泛素從E2硫酯中間體轉(zhuǎn)移至底物蛋白的酰胺連接(Hershko and Ciechanover, 1998)。除了對(duì)底物的泛素化,E3連接酶還可以對(duì)自身進(jìn)行“自我泛素化"。
LifeSensors的PROTAC體外泛素化檢測(cè)試劑盒旨在通過(guò)監(jiān)測(cè)蛋白質(zhì)固有的泛素化能力,可以準(zhǔn)確預(yù)測(cè)PROTAC的效率。
艾美捷PROTAC體外泛素化檢測(cè)試劑盒檢測(cè)原理:
使用預(yù)涂有專有的TUBE試劑(檢測(cè)板)的微孔板條,用于捕獲PROTAC依賴反應(yīng)中形成的多泛素鏈。在檢測(cè)過(guò)程中,首先將PROTAC加入到檢測(cè)板中,然后加入E3連接酶和待檢測(cè)的目標(biāo)蛋白,以形成三元復(fù)合物。接下來(lái),將含有野生型泛素和ATP的E1-E2酶混合物加入到孔中,以啟動(dòng)PROTAC介導(dǎo)的泛素化反應(yīng)。在反應(yīng)過(guò)程中,E1-E2-E3機(jī)制生成的多泛素鏈被識(shí)別并捕獲在孔中。在反應(yīng)和隨后的洗滌步驟后,將分離的多泛素化產(chǎn)物與目標(biāo)蛋白的抗體(不包含在內(nèi))和與-HRP偶聯(lián)的二抗(包含在內(nèi))一起孵育,以便通過(guò)化學(xué)發(fā)光進(jìn)行檢測(cè)。因此,在這種“三明治"ELISA樣的檢測(cè)方法中,捕獲的多泛素化產(chǎn)物產(chǎn)生的信號(hào)是PROTAC活性的定量指標(biāo)。
PROTAC體外泛素化檢測(cè)試劑盒組分:
注意:將所有材料儲(chǔ)存于-80?C,避免多次凍融循環(huán)。所有組分至少穩(wěn)定保存2個(gè)月。
1:體外泛素化檢測(cè)板:注意不要將檢測(cè)板迅速解凍至室溫。建議最初將檢測(cè)板放置在4°C下30分鐘,然后再轉(zhuǎn)移到室溫下。
2:10倍檢測(cè)緩沖液:規(guī)格:1.2 mL,注意:在1倍檢測(cè)緩沖液中新鮮添加β-巰基乙醇,最終濃度為1mM。
3:E3混合液(2倍濃度):規(guī)格:1 x 250 ul(20倍濃度),注意:將選擇的目標(biāo)蛋白以40-80 nM的濃度加入提供的E3混合液中,以促進(jìn)PROTAC和E3連接酶的三元復(fù)合物形成。
4:E1-E2-泛素混合液(2倍濃度):規(guī)格:1 x 250 ul(20倍濃度)
5:二抗(抗小鼠或抗兔HRP偶聯(lián)):規(guī)格:60uL(100倍濃度)
6:檢測(cè)試劑1和2:規(guī)格:1 mL的檢測(cè)試劑1和1 mL的檢測(cè)試劑2
7:阻斷濃縮液(5倍濃度):規(guī)格:5 mL
8:陽(yáng)性對(duì)照試劑
DMSO中的PROTAC(50倍濃度):10 uL(MZP54,dBET6,A1874)
目標(biāo)蛋白陽(yáng)性對(duì)照BRD3(20倍濃度):20 uL
抗-BRD3抗體(100倍濃度):5 uL
抗小鼠HRP偶聯(lián)物(100倍濃度):5 uL
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