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隨著多種組學(xué)研究技術(shù)的不斷發(fā)展,APExBIO向全球范圍內(nèi)的科研院所、醫(yī)療機(jī)構(gòu)等單位提供基于質(zhì)譜分析的蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)服務(wù);基于高通量測(cè)序的各種組學(xué)服務(wù);基于計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)服務(wù);以及各種生物信息學(xué)分析服務(wù)。
艾美捷APExBIO多組學(xué)服務(wù)解決方案:
1、基因組重測(cè)序
基因組重測(cè)序是通過(guò)高通量測(cè)序?qū)σ延袇⒖蓟蚪M物種的基因組核酸序列進(jìn)行測(cè)定的技術(shù), 通過(guò)重測(cè)序可以分析個(gè)體或群體的遺傳差異性、群體進(jìn)化等。具體策略方面,可以對(duì)全基因組序列進(jìn)行測(cè)序, 即全基因組重測(cè)序;也可以只捕獲外顯子區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,即外顯子組測(cè)序。
2、ATAC-seq
ATAC-seq研究染色質(zhì)可及性,測(cè)定特定時(shí)空下基因組中所有處于開(kāi)放狀態(tài)的序列,分析調(diào)控元件, 揭示轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)以及核小體位置,從而研究精細(xì)化基因表達(dá)的調(diào)控DNA印記等。 該方法細(xì)胞用量低至50000個(gè),組織50mg。其信噪比與靈敏性優(yōu)于其他染色質(zhì)可及性研究方法, 可以在全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)染色質(zhì)的開(kāi)放狀態(tài)。
3、KAS-seq
研究單鏈DNA相關(guān)生物活性,如正在進(jìn)行轉(zhuǎn)錄活動(dòng)或參與調(diào)控轉(zhuǎn)錄活動(dòng)的單鏈DNA, 可快速準(zhǔn) 確地分析轉(zhuǎn)錄活性和增強(qiáng)子活性。該方法可測(cè)的多種生物學(xué)活性類(lèi)型的單鏈,如轉(zhuǎn)錄,增強(qiáng)子等。 該方法細(xì)胞用量低至100000個(gè),可測(cè)得多類(lèi)型數(shù)據(jù),對(duì)比相應(yīng)ChIP-seq,ATAC數(shù)據(jù)或數(shù)據(jù)庫(kù), 可以得到有單鏈生物學(xué)活性的多類(lèi)型測(cè)序數(shù)據(jù),靈敏度高。
4、RIP-seq
RNA免疫共沉淀測(cè)序技術(shù),在體內(nèi)環(huán)境中研究蛋白質(zhì)與RNA相互作用的經(jīng)典實(shí)驗(yàn)方法, 該方法結(jié)合了 RNA 免疫沉淀和高通量測(cè)序,其中相互作用的 RNA 通過(guò)目標(biāo)蛋白的免疫沉淀被捕獲。 對(duì)捕獲的 RNA 進(jìn)行高通量測(cè)序有助于了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)態(tài)過(guò)程。應(yīng)用于RNA結(jié)合蛋白(RBPs), mRNA形成核糖核蛋白(RNPs)復(fù)合物, RNA modification等研究。
5、簡(jiǎn)化甲基化測(cè)序
簡(jiǎn)化甲基化測(cè)序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),是利用限制性內(nèi)切酶對(duì) 基因組進(jìn)行酶切,以富集CpG島以及啟動(dòng)子等區(qū)域,并經(jīng)Bisulfite處理后,進(jìn)行單堿基分辨率的甲基化測(cè)序技術(shù)。 因其可顯著提高CpG區(qū)域的測(cè)序深度,在啟動(dòng)子區(qū)域、CpG島和增強(qiáng)子元件區(qū)域可以獲得高精度的分辨率,在臨床樣本 的大規(guī)模研究中具有廣泛應(yīng)用。
6、全轉(zhuǎn)錄組
全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是特定物種、組織或細(xì)胞在特定狀態(tài)下所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物集合,包括mRNA和非編碼RNA。 目前全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序主要檢測(cè)了mRNA、lncRNA、circRNA和miRNA。通過(guò)聯(lián)合分析,解析RNA間的相互作用及共表達(dá) 調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并且進(jìn)行競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(ceRNA)分析,從而更加全面解析特定的生物學(xué)過(guò)程
7、10X Genomics /GEXSCOPE/ SeekOne單細(xì)胞RNA-Seq
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Single cell RNA sequencing)是在單個(gè)細(xì)胞水平對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序的一項(xiàng)新技術(shù), 針對(duì)單個(gè)細(xì)胞研究其整體水平的基因表達(dá)情況,成功解決細(xì)胞分子機(jī)制研究中常見(jiàn)的細(xì)胞異質(zhì)性、 細(xì)胞量少而無(wú)法進(jìn)行常規(guī)高通量測(cè)序等難題。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)具有檢測(cè)細(xì)胞之間異質(zhì)性的優(yōu)勢(shì), 并且能夠識(shí)別數(shù)量很少的細(xì)胞群。
8、全蛋白組
通過(guò)新的質(zhì)譜技術(shù)Data independent acquisition (DIA,數(shù)據(jù)非依賴性采集),我們對(duì)樣本中的全部蛋白 質(zhì)進(jìn)行所有碎片離子的全景式掃描,得到高準(zhǔn)確性,少缺失值的蛋白鑒定及相對(duì)定量結(jié)果,為生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn), 疾病精準(zhǔn)分型,生理病理分析,溯源致病基因等研究提供有力支持。
9、Olink蛋白
Olink基于磚利的鄰位延伸分析技術(shù)PEA( proximity extension assay),借助蛋白特異性原理, 核苷酸序列探針及高通量測(cè)序平臺(tái),實(shí)現(xiàn)對(duì)特定疾病相關(guān)蛋白的精確定量。因其極少的樣本需求量, 適應(yīng)各類(lèi)疾病的多種panel,精確的蛋白定量結(jié)果受到廣泛應(yīng)用,聚焦人類(lèi)疾病靶點(diǎn)蛋白,為臨床大隊(duì)列篩選、 生物標(biāo)志物的復(fù)核等研究提供有力數(shù)據(jù)支撐。
10、非靶代謝/非靶脂質(zhì)代謝
代謝組學(xué)是研究生命體對(duì)外界刺激、病理生理變化以及本身基因突變而引起的分子質(zhì)量小于 1500Da 以內(nèi)的內(nèi)源性代謝產(chǎn)物種類(lèi)、數(shù)量及其變化規(guī)律的組學(xué),有助于生物標(biāo)志物的篩選,研究代謝通路,發(fā)現(xiàn)調(diào)節(jié)酶, 揭示生命活動(dòng)機(jī)制等研究。在疾病診斷、藥靶篩選、營(yíng)養(yǎng)與健康管理、個(gè)性化藥物治療等領(lǐng)域廣泛使用。
11、微生物組
微生物組學(xué)以動(dòng)植物體或環(huán)境中的所有微生物為研究對(duì)象,通過(guò)對(duì)微生物基因組進(jìn)行高通量測(cè)序, 以獲得樣本中微生物群落結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系以及特定環(huán)境的微生物基因功能等。 該技術(shù)突破了傳統(tǒng)微生物不可培養(yǎng)的缺點(diǎn),在疾病治療、動(dòng)物健康、環(huán)境治理、農(nóng)業(yè)發(fā)展等領(lǐng)域廣泛使用。
12、計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)
借助于APExBIO多年的實(shí)驗(yàn)平臺(tái),寶貴的實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)與海量數(shù)據(jù)可以更好地為計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)提供驗(yàn)證。 新興的人工智能技術(shù)與成熟的模擬計(jì)算可以更好地指導(dǎo)實(shí)驗(yàn)的進(jìn)行,打破單向干濕結(jié)合的壁壘, 實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)與計(jì)算的相互融合。隨著APExBIO與工業(yè)界的積極合作,從收集到的工藝數(shù)據(jù)中探索出一套優(yōu)化底層研發(fā)的方式, 并提供小分子藥物設(shè)計(jì)服務(wù)、抗體藥物設(shè)計(jì)服務(wù)以及疫苗設(shè)計(jì)服務(wù)。
艾美捷科技是APExBIO的中國(guó)代理商,為科研工作者提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品與服務(wù)。
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