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在體內(nèi)富集組蛋白或轉(zhuǎn)錄因子(TF)復(fù)合DNA,然后進(jìn)行qPCR和/或下一代測(cè)序,為研究全基因組蛋白質(zhì)-DNA相互作用提供了有利的工具。通常用于實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)的主要方法是染色質(zhì)免疫沉淀,然后進(jìn)行測(cè)序(ChIP-seq)。該方法包括高度特異的ChIP-exo和ChIP-nexus。這兩種分析提供了高分辨率的繪圖。然而,這些檢測(cè)的主要局限性在于,它們需要大量的輸入材料、細(xì)胞或組織才能在背景噪聲中產(chǎn)生足夠強(qiáng)的信號(hào)。CUT&RUN(靶下切割和核酸酶下釋放)是為繪制蛋白質(zhì)與DNA與有限生物材料的相互作用而開(kāi)發(fā)的,這需要更少的樣品量,也顯著提高了繪制分辨率。然而,該測(cè)定的一個(gè)相當(dāng)大的缺點(diǎn)是抗體未偶聯(lián)的pAG-MNase的非特異性切割,顯著限制了CUT和RUN對(duì)不同物種和細(xì)胞/組織類型中大多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子的特異性。此外,原始的CUT&RUN步驟復(fù)雜,需要優(yōu)化測(cè)定條件,這仍然很耗時(shí)。
艾美捷EpiNext CUT&LUNCH檢測(cè)試劑盒:
貨號(hào):P-2035-24
輸入類型:細(xì)胞、組織
研究領(lǐng)域:染色質(zhì)與轉(zhuǎn)錄
目標(biāo)應(yīng)用:蛋白質(zhì)-DNA富集
容器格式:管
保證:6個(gè)月
EpiNext CUT&LUNCH檢測(cè)試劑盒組成:
*使用前將溶液旋轉(zhuǎn)到底部。
EpiNext CUT&LUNCH檢測(cè)試劑盒檢測(cè)原理:
EpiNext™ CUT&LUNCH(目標(biāo)下切割并均勻釋放D特核酸復(fù)合物)試劑盒提供了一種快速高效的方法來(lái)研究體內(nèi)DNA-蛋白質(zhì)相互作用。它整合了ChIP和CUT&RUN的所有優(yōu)勢(shì),同時(shí)有效解決了它們的局限性。
EpiNext CUT&LUNCH檢測(cè)試劑盒具有以下優(yōu)點(diǎn)和特點(diǎn):
極快速的三步協(xié)議:直接從完整的細(xì)胞開(kāi)始,無(wú)需ConA固定。程序可以在1小時(shí)50分鐘內(nèi)完成,最小化核損傷和染色質(zhì)損失,同時(shí)保持天然染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。
增強(qiáng)的特異性和最小化的背景:D特的核酸切割酶通過(guò)選擇性地在目標(biāo)蛋白/DNA復(fù)合物兩端切割DNA,確保低序列偏差,不影響與蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA。非特異性蛋白-DNA復(fù)合物被選擇性消除,實(shí)現(xiàn)目標(biāo)蛋白富集區(qū)域的高分辨率映射。
低輸入材料:在最短時(shí)間內(nèi)完成強(qiáng)大的未結(jié)合DNA切割和免疫捕獲。這種方法同時(shí)使用細(xì)胞和組織,同時(shí)提供目標(biāo)蛋白的最大降解保護(hù)和最小樣本損失。因此,輸入的細(xì)胞數(shù)量可以少至500個(gè)細(xì)胞。
廣泛的適用性:適用于各種物種的培養(yǎng)細(xì)胞以及新鮮或冷凍組織,與組蛋白和轉(zhuǎn)錄因子兼容,同時(shí)保持檢測(cè)的特異性和靈敏度。
高度便捷:試劑盒包含所有必要的組分,使EpiNext™ CUT&LUNCH檢測(cè)試劑盒既方便又經(jīng)濟(jì)。
與現(xiàn)有流程的無(wú)縫集成:用于NGS的富集DNA可以與現(xiàn)有的、經(jīng)過(guò)時(shí)間考驗(yàn)的ChIP-seq生物信息學(xué)軟件和工具一起分析。
EpiNext CUT&LUNCH檢測(cè)試劑盒保存建議:
該試劑盒分兩部分運(yùn)輸:第一部分在室溫下,第二部分在4°C的冷凍冰袋上。
收到后,根據(jù)上表中的溫度避光儲(chǔ)存組件。
注:使用前檢查WB(清洗緩沖液)和PB(透化緩沖液)是否含有鹽沉淀。 如果是這樣,請(qǐng)?jiān)谑覝鼗?/span>37°C下短暫加熱并搖晃,直至鹽重新溶解。
試劑盒的所有組分在適當(dāng)儲(chǔ)存的情況下,自裝運(yùn)之日起可穩(wěn)定儲(chǔ)存6個(gè)月
請(qǐng)輸入賬號(hào)
請(qǐng)輸入密碼
請(qǐng)輸驗(yàn)證碼
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