詳細(xì)介紹
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服務(wù)流程:
接受訂單及樣品——RNA提取——RNA質(zhì)量檢測(cè)——樣品cDNA合成——定量試驗(yàn)——數(shù)據(jù)分析——結(jié)果交付——售后服務(wù)。
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品規(guī)格 | 貨號(hào) |
轉(zhuǎn)基因品系玉米676探針?lè)╭PCR試劑盒 | 50T | FS-L63979 |
實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):
1)RT-PCR可以檢測(cè)組織、細(xì)胞、血液、細(xì)菌等很多材料,不同的樣本有不同要求,實(shí)驗(yàn)前請(qǐng)充分溝通確認(rèn)實(shí)驗(yàn)方案和樣本情況;
2)客戶盡可能提供實(shí)驗(yàn)的背景信息、物種、基因準(zhǔn)確的名稱和ID號(hào);
3)客戶盡量不要提供DNA或RNA樣品。
4)樣本保存于液氮或干冰,也可以保存于Trizol液中。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。實(shí)時(shí)熒光定量PCR的化學(xué)原理包括探針類和非探針類兩類,探針類是利用與靶細(xì)胞序列特異性雜交的探針來(lái)指示擴(kuò)增產(chǎn)物的增加,非探針類是利用熒光染料或者特異性設(shè)計(jì)的引物來(lái)指示擴(kuò)增的增加。運(yùn)用該技術(shù)可以對(duì)DNA、RNA樣品進(jìn)行定量(包括定量和相對(duì)定量)和定性分析。主要服務(wù):DNA或RNA的定量分析、基因表達(dá)差異分析、基因分型。
實(shí)驗(yàn)過(guò)程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對(duì)應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無(wú)到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計(jì)的引物??梢允荄NA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計(jì)。因此,擴(kuò)增不同的基因需要設(shè)計(jì)不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o(wú)菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無(wú)熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴(kuò)增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測(cè)或-20℃長(zhǎng)期保存。
4.PCR的電泳檢測(cè):如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進(jìn)行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測(cè)。
檢測(cè)方法包括以下步驟:
(1)將參照基因與待測(cè)目的基因片段等比例連接,克隆到同一個(gè)質(zhì)粒載體上,構(gòu)建一種可同時(shí)用于參照基因以及待測(cè)目的基因擴(kuò)增檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)品,并將所得標(biāo)準(zhǔn)品按照濃度梯度稀釋后同時(shí)用于繪制參照基因以及待測(cè)目的基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線;
(2)待測(cè)樣本與步驟(1)所述標(biāo)準(zhǔn)品經(jīng)同步進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增后,目的基因與參照基因按照各自的標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算各自的拷貝數(shù),計(jì)算待測(cè)樣本的目的基因與參照基因拷貝數(shù)比值,即得目的基因的拷貝數(shù)相對(duì)定量檢測(cè)結(jié)果。
其中步驟(1)為:將參照基因與待測(cè)目的基因片段等比例連接,克隆到同一個(gè)質(zhì)粒載體上,構(gòu)建一種可同時(shí)用于參照基因以及待測(cè)目的基因擴(kuò)增檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)品,并將所得標(biāo)準(zhǔn)品按照濃度梯度稀釋后同時(shí)用于繪制參照基因以及待測(cè)目的基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
其中所述參照基因?yàn)楸绢I(lǐng)域常規(guī)參照基因,較佳地管家基因,優(yōu)選地為RPPH1的擴(kuò)增區(qū)域,其中所述質(zhì)粒載體為本領(lǐng)域常規(guī)質(zhì)粒載體,較佳地為PCR克隆載體,優(yōu)選地為TA cloning載體,所述TA cloning載體較佳地為pMD18-T載體。其中所述標(biāo)準(zhǔn)品的核酸序列如序列表中SEQ ID NO:6所示。所述的等比例較佳地為1:1。由于標(biāo)準(zhǔn)品中待測(cè)目的基因與參照基因的比例為1:1,解決了目前相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)曲線法應(yīng)用中目的基因與參照基因的濃度比例關(guān)系難以控制的問(wèn)題,提高HER2基因擴(kuò)增檢測(cè)的可靠性。
步驟(2)為:待測(cè)樣本與步驟(1)所述標(biāo)準(zhǔn)品經(jīng)同步進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增后,目的基因與參照基因按照各自的標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算各自的拷貝數(shù),計(jì)算待測(cè)樣本的目的基因與參照基因拷貝數(shù)比值,即得目的基因的拷貝數(shù)相對(duì)定量檢測(cè)結(jié)果。
其中所述待測(cè)目的基因?yàn)楸绢I(lǐng)域常規(guī)待測(cè)目的基因,較佳地為腫瘤或者疾病的特異性基因,更佳地為HER2基因的擴(kuò)增區(qū)域,所述熒光定量PCR擴(kuò)增為本領(lǐng)域常規(guī)熒光定量PCR擴(kuò)增方法,所述熒光定量PCR擴(kuò)增方法較佳地為多通道熒光定量PCR擴(kuò)增,更佳地為雙通道熒光定量PCR擴(kuò)增。
儲(chǔ)存條件:
14℃或-20℃樣品收集、處理及保存方法
1. 血清:使用不含熱原和內(nèi)毒素的試管,操作過(guò)程中避免任何細(xì)胞刺激,收集血液后,3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘將血清和紅細(xì)胞迅速小心地分離。
2. 血漿:EDTA、檸檬酸鹽或肝素抗凝。3000 轉(zhuǎn)離心30 分鐘取上清。
3. 細(xì)胞上清液:3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘去除顆粒和聚合物。
4. 組織勻漿:將組織加入適量生理鹽水搗碎。3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘取上清。
5. 保存:如果樣本收集后不及時(shí)檢測(cè),請(qǐng)按一次用量分裝,凍存于-20℃,避免反復(fù)凍融,在室溫下解凍并確保樣品均勻地充分解凍。
純化RNA樣品儲(chǔ)存液 anti-EPO antibody(anti-Erythropoietin antibody) 20 ul
mRNA純化樹脂再生 fFN(fetal Fibronectin) 100 ul
RNA比色法定量 LIPE(Hormone-sensitive lipase) 100 ul
RNA熒光(RiboGreen)定量 2, 5-OAS(2, 5-oligoadenylate synthetase) 100 ul
兩步法RT-PCR MDA(Malonyldehyde) 20 ul
一步法RT-PCR IL-12RB1(Interleukin-12 receptor subunit beta-1 78) 10 mg
直接細(xì)胞克隆兩步法逆轉(zhuǎn)錄PCR NPTN(Neuroplastin) 100 ul
兩步法RT-PCR熒光定量 AP12(Apelin 12) 100 ul
逆轉(zhuǎn)錄RT HGS(Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substRate) 100 ul
體外RNA轉(zhuǎn)錄合成 calprotectin 1 mg
體外加帽RNA轉(zhuǎn)錄合成 Thrombin 100 ul
RNasin(核糖核酸酶抑制劑) LPS IgG(lipopolysaccharide IgG) 100 ul
MMLV(H點(diǎn)突變) SCRG1(Scrapie responsive protein 1) 20 ul
Oligo(dT)18(500納克/微升) HGS(Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substRate) 100 ul
Hexamer(隨機(jī)引物)(200納克/微升) AP12(Apelin 12) 20 ul
SOCS calprotectin 100 ul
轉(zhuǎn)基因品系玉米676探針?lè)╭PCR試劑盒蘇云金芽胞桿菌種屬: Bacillus│thuringiensis分離基物: 1-5cm土壤提供形式: 凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 科研研究培養(yǎng)基: 0002生長(zhǎng)條件: 30℃存儲(chǔ)條件: -80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法;礦物油法
Termitomyces│albuminosus提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級(jí): 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0014生長(zhǎng)條件: 25℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;礦物油法;定期移植法
淺紫灰鏈霉菌種屬: Streptomyces│lavendulae分離基物: 窖泥提供形式: 凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0012生長(zhǎng)條件: 28-30℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
Alternaria│sp.分離基物: 柏樹枝的韌皮部提供形式: 斜面培養(yǎng)物;凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 分類學(xué)及植物內(nèi)共生真菌的研究培養(yǎng)基: 14生長(zhǎng)條件: 28℃存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥法;礦物油法;定期移植法
黃曲霉柱頭變種種屬: Aspergillus│flavus var. columnaris提供形式: 凍干物安全等級(jí): 2模式菌株: no培養(yǎng)基: 0015生長(zhǎng)條件: 25-28℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
Flammulina│vutipes提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 食用培養(yǎng)基: 0014生長(zhǎng)條件: 25℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;礦物油法;定期移植法
Schizophyllum│commune Fr.分離基物: 基質(zhì)提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級(jí): 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 14生長(zhǎng)條件: 25存儲(chǔ)條件: 定期移植法
Acidithiobacillus ferrooxidans (Temple and Colmer 1951) Kly and Wood 2000模式菌株: 未知
Aspergillus│fumigatus var. lipticus分離基物: 土壤提供形式: 凍干物安全等級(jí): 2模式菌株: no培養(yǎng)基: 0015生長(zhǎng)條件: 25-28℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法