詳細(xì)介紹
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服務(wù)流程:
接受訂單及樣品——RNA提取——RNA質(zhì)量檢測——樣品cDNA合成——定量試驗(yàn)——數(shù)據(jù)分析——結(jié)果交付——售后服務(wù)。
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品規(guī)格 | 貨號(hào) |
轉(zhuǎn)基因品系油菜46A40染料法qPCR試劑盒 | 50T | FS-L63884 |
實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):
1)RT-PCR可以檢測組織、細(xì)胞、血液、細(xì)菌等很多材料,不同的樣本有不同要求,實(shí)驗(yàn)前請充分溝通確認(rèn)實(shí)驗(yàn)方案和樣本情況;
2)客戶盡可能提供實(shí)驗(yàn)的背景信息、物種、基因準(zhǔn)確的名稱和ID號(hào);
3)客戶盡量不要提供DNA或RNA樣品。
4)樣本保存于液氮或干冰,也可以保存于Trizol液中。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測整個(gè)PCR進(jìn)程,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。實(shí)時(shí)熒光定量PCR的化學(xué)原理包括探針類和非探針類兩類,探針類是利用與靶細(xì)胞序列特異性雜交的探針來指示擴(kuò)增產(chǎn)物的增加,非探針類是利用熒光染料或者特異性設(shè)計(jì)的引物來指示擴(kuò)增的增加。運(yùn)用該技術(shù)可以對DNA、RNA樣品進(jìn)行定量(包括定量和相對定量)和定性分析。主要服務(wù):DNA或RNA的定量分析、基因表達(dá)差異分析、基因分型。
實(shí)驗(yàn)過程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計(jì)的引物。可以是DNA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計(jì)。因此,擴(kuò)增不同的基因需要設(shè)計(jì)不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴(kuò)增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測或-20℃長期保存。
4.PCR的電泳檢測:如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進(jìn)行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測。
檢測方法包括以下步驟:
(1)將參照基因與待測目的基因片段等比例連接,克隆到同一個(gè)質(zhì)粒載體上,構(gòu)建一種可同時(shí)用于參照基因以及待測目的基因擴(kuò)增檢測的標(biāo)準(zhǔn)品,并將所得標(biāo)準(zhǔn)品按照濃度梯度稀釋后同時(shí)用于繪制參照基因以及待測目的基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線;
(2)待測樣本與步驟(1)所述標(biāo)準(zhǔn)品經(jīng)同步進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增后,目的基因與參照基因按照各自的標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算各自的拷貝數(shù),計(jì)算待測樣本的目的基因與參照基因拷貝數(shù)比值,即得目的基因的拷貝數(shù)相對定量檢測結(jié)果。
其中步驟(1)為:將參照基因與待測目的基因片段等比例連接,克隆到同一個(gè)質(zhì)粒載體上,構(gòu)建一種可同時(shí)用于參照基因以及待測目的基因擴(kuò)增檢測的標(biāo)準(zhǔn)品,并將所得標(biāo)準(zhǔn)品按照濃度梯度稀釋后同時(shí)用于繪制參照基因以及待測目的基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
其中所述參照基因?yàn)楸绢I(lǐng)域常規(guī)參照基因,較佳地管家基因,優(yōu)選地為RPPH1的擴(kuò)增區(qū)域,其中所述質(zhì)粒載體為本領(lǐng)域常規(guī)質(zhì)粒載體,較佳地為PCR克隆載體,優(yōu)選地為TA cloning載體,所述TA cloning載體較佳地為pMD18-T載體。其中所述標(biāo)準(zhǔn)品的核酸序列如序列表中SEQ ID NO:6所示。所述的等比例較佳地為1:1。由于標(biāo)準(zhǔn)品中待測目的基因與參照基因的比例為1:1,解決了目前相對標(biāo)準(zhǔn)曲線法應(yīng)用中目的基因與參照基因的濃度比例關(guān)系難以控制的問題,提高HER2基因擴(kuò)增檢測的可靠性。
步驟(2)為:待測樣本與步驟(1)所述標(biāo)準(zhǔn)品經(jīng)同步進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增后,目的基因與參照基因按照各自的標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算各自的拷貝數(shù),計(jì)算待測樣本的目的基因與參照基因拷貝數(shù)比值,即得目的基因的拷貝數(shù)相對定量檢測結(jié)果。
其中所述待測目的基因?yàn)楸绢I(lǐng)域常規(guī)待測目的基因,較佳地為腫瘤或者疾病的特異性基因,更佳地為HER2基因的擴(kuò)增區(qū)域,所述熒光定量PCR擴(kuò)增為本領(lǐng)域常規(guī)熒光定量PCR擴(kuò)增方法,所述熒光定量PCR擴(kuò)增方法較佳地為多通道熒光定量PCR擴(kuò)增,更佳地為雙通道熒光定量PCR擴(kuò)增。
儲(chǔ)存條件:
14℃或-20℃樣品收集、處理及保存方法
1. 血清:使用不含熱原和內(nèi)毒素的試管,操作過程中避免任何細(xì)胞刺激,收集血液后,3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘將血清和紅細(xì)胞迅速小心地分離。
2. 血漿:EDTA、檸檬酸鹽或肝素抗凝。3000 轉(zhuǎn)離心30 分鐘取上清。
3. 細(xì)胞上清液:3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘去除顆粒和聚合物。
4. 組織勻漿:將組織加入適量生理鹽水搗碎。3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘取上清。
5. 保存:如果樣本收集后不及時(shí)檢測,請按一次用量分裝,凍存于-20℃,避免反復(fù)凍融,在室溫下解凍并確保樣品均勻地充分解凍。
過氧化氫(hydrogen peroxide;H2O2) KIFC1( Kinesin family member C1) 1 Kit
羥自由基或氫氧基(hydroxyl radical;OH-) KLF6 100 ul
超氧自由基陰離子(superoxide radical;O2-) KIFC3 100 ul
過氧化基(peroxyl radical;ROO-) KLF7 100 ul
氫過氧自由基(hydroperoxyl;HOO) KIN 100 ul
氮氧基(nitric Oxide;NO-) KLF15 20 ul
次氯酸(hypochlorous acid;HOCl) Kindlin 2 100 ul
過氧亞硝基陰離子(peroxynitrite anion;ONOO-) KLF4 20 ul
烷氧自由基(alcoxyl radical) KIF19 100 ul
Alkylperoxyl Radical: ROO. KLF17 100 ul
脂質(zhì)氧化 KIF1C 100 ul
β氧化 KIF22 100 ul
核酸氧化 KIF20A 100 ul
蛋白氧化 KIF1B 20 ul
細(xì)菌氧化應(yīng)激活性氧(ROS)比色法定量(羥自由基) KIF26B 100 ul
超氧化物歧化酶(SOD)活性 KIF2A 1 Kit
轉(zhuǎn)基因品系油菜46A40染料法qPCR試劑盒Streptomyces│sp.分離基物: 沉積物/表層沉積物提供形式: 凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 生物活性微生物:抗菌活性譜:金黃色葡萄球菌 18 枯草芽孢桿菌 20 大腸埃希氏菌 -- 熒光假單胞菌 -- 白假絲酵母 -- 宛氏擬青霉 28培養(yǎng)基: 1002生長條件: 28℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
堪薩斯分枝桿菌種屬: Mycobacterium│Mycobacterium kansasii提供形式: 凍干物安全等級(jí): 3模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 研究生長條件: 37存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥法
Escherichia│coli提供形式: 凍結(jié)物安全等級(jí): 2模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 作為原核表達(dá)系統(tǒng)研究基因表達(dá)的對照菌株。培養(yǎng)基: 33生長條件: 37℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法;定期移植法
Corynebacterium│glutamicum提供形式: 凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 產(chǎn)谷氨酸。培養(yǎng)基: CM0108生長條件: 30℃存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥法
Agrobacterium│tumefaciens提供形式: 凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0032生長條件: 28-30℃存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥法;礦物油法;定期移植法
Citricoccus│alkalitolerans分離基物: 鹽堿土提供形式: 凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: yes應(yīng)用領(lǐng)域: 模式菌株培養(yǎng)基: CM0027+5%NaCl生長條件: 28C存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥
Sphingobacterium│sp.分離基物: 原料乳提供形式: 凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 可導(dǎo)致乳品蛋白變性培養(yǎng)基: CM0827生長條件: 30℃存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥法
Saccharothrix│sp.分離基物: 蘭李莖提供形式: 凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 雙功能酶抑制劑培養(yǎng)基: CM0027生長條件: 28C存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥
Candida│tropicalis分離基物: 生物樣/尖葉鹵蕨根提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 近海酵母培養(yǎng)基: 513生長條件: 28℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法