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逆轉(zhuǎn)錄RT-PCR具體操作步驟
閱讀:15028 發(fā)布時(shí)間:2021-12-27逆轉(zhuǎn)錄RT-PCR原理:
提取組織或細(xì)胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機(jī)引物利用逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成cDNA。再以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,而獲得目的基因或檢測(cè)基因表達(dá)。RT-PCR使RNA檢測(cè)的靈敏性提高了幾個(gè)數(shù)量級(jí),使一些極為微量RNA樣品分析成為可能。
逆轉(zhuǎn)錄RT-PCR操作步驟:
一、RNA逆轉(zhuǎn)錄cDNA(反應(yīng)體系要20ul)依次加入
1、Oligo(dT)加入1ul。
2、RNA(體積即上一步驟計(jì)算出來(lái)的)
3、剩下的用無(wú)Rnase水補(bǔ)齊共12ul 65℃水浴5min。
二、加入逆轉(zhuǎn)錄試劑
1、5×Reaction Buffer 4ul
2、Ribolock RNase Inhibiter 1ul
3、10mM Dntp mix 2ul
4、RevertAid m-mul URT 1ul
三、設(shè)置儀器,按照說(shuō)明書設(shè)置
1、oligodT:42℃ 60min
2、逆轉(zhuǎn)錄:70℃ 5min
3、終止:4℃
附加:cDNA可以跑電泳看一下,取cDNA 1ul加load buffer(看這個(gè)是幾乘的)混勻,跑電泳,marker用2000的取6ul左右膠板的制作,后面有說(shuō)明。
四、PCR cDNA擴(kuò)增目的基因(反應(yīng)體系是20ul,不夠用無(wú)菌水補(bǔ)齊)
下面的實(shí)驗(yàn)用高壓過(guò)的槍頭和普通高壓過(guò)的水即可。(所用以下配比物品都要在冰箱中凍存,使用之前離心,甩下來(lái)即可。量大的話可以先加樣配比,即把所需要的試劑總量計(jì)算出后,取出放在ep管中。)
1、加樣:①M(fèi)ix 10ul ②引物 1ul ③cDNA和水總計(jì)9ul
2、混勻:小離心機(jī)甩一下即可
3、放入PCR儀:PCR儀事先設(shè)定條件,反應(yīng)條件根據(jù)mix說(shuō)明書來(lái)設(shè)定
4、PCR產(chǎn)物保存:一般在4℃冰箱保存,長(zhǎng)時(shí)間不用可-20℃凍存。
五、配膠和跑膠:
1、配膠: (水平膠;瓊脂糖凝膠)要帶手套,TAE有毒。
小膠板8孔的 TAE 25ml 瓊脂糖 0.25~0.30g
中膠板25孔的 TAE 50ml 瓊脂糖 0.50~0.55g
步驟:稱取BIOWEST AGAROSE(瓊脂糖)放入配膠專用燒瓶→用配膠專用量筒量1×TAE倒入燒瓶→酒精燈加熱(以看到冒泡為準(zhǔn))→將沸騰的液體轉(zhuǎn)移到EB污染區(qū)的燒瓶中→加入EB或EB替代(觀察顏色不是很深即可,一般小膠板3滴左右)→插梳子→倒入電泳槽(倒膠從一個(gè)角倒入防止產(chǎn)生氣泡)→待膠凝固30分鐘左右拔出梳子進(jìn)行跑膠(如不馬上跑將膠放4℃冰箱保存,防止膠變干)。
2、跑膠:
(1)電泳緩沖液用1×TAE,一般跑5-8次膠后就要重新?lián)Q電泳緩沖液。
(2)要讓緩沖液沒(méi)過(guò)膠。
(3)Marker標(biāo)記染色體上一個(gè)可以被識(shí)別的區(qū)域,我們用的是2000的(保存在4℃冰箱中):3-6ul單格加入。
步驟:取PCR產(chǎn)物(cDNA)8ul,加入單格上,接通電源,跑膠。(注意:跑膠方向是從負(fù)極到正極),當(dāng)loading Buffer跑到2/3時(shí)停止跑膠(大約40分鐘),帶手套取膠放在照相臺(tái)上。
六、照相