賽默飛離子阱質(zhì)譜是利用高電場使質(zhì)譜進樣端的毛細管柱流出的液滴帶電，在氮氣氣流的作用下，液滴溶劑蒸發(fā)，表面積縮小，表面電荷密度不斷增加，直至產(chǎn)生的庫侖力與液滴表面張力達到雷利極限，液滴爆裂為帶電的子液滴，這一過程不斷重復(fù)使終的液滴非常細小呈噴霧狀，這時液滴表面的電場非常強大，使分析物離子化并以帶單電荷或多電荷的離子形式進入質(zhì)量分析器。賽默飛離子阱質(zhì)譜從液相中產(chǎn)生離子，一般說來，肽段的混合物經(jīng)過液相色譜分離后，經(jīng)過偶聯(lián)的與在線連接的離子阱質(zhì)譜分析，給出肽片段的的氨基酸序列,但是分析時間一般較長。
 

　　賽默飛離子阱質(zhì)譜在蛋白質(zhì)組學(xué)和小分子應(yīng)用上奠定了新的里程碑。在得到充分證明的高性能平臺上，運用新的離子阱技術(shù)，極大地提高了速度、分辨率、MS/MS效率和定量分析的重復(fù)性，從而達到的高性能。
 

　　1、極短的MS/MS循環(huán)時間，zui大的信息量。

　　2、全新的SMART離子隔離和碎裂技術(shù)。

　　3、ETD性能：靈敏度高、耐性好、可靠性強。

　　4、雙離子漏斗技術(shù)提高的靈敏度。

　　5、當(dāng)今世上分辨率zui高的離子阱質(zhì)譜儀，在全掃描模式下，分辨率高達30, 000。

　　6、賽默飛的RF發(fā)生器確保zui高的質(zhì)量精度。

　　7、高達20 Hz數(shù)據(jù)采集速度，并且實現(xiàn)“零時間延遲”正負模式切換。

　　賽默飛離子阱質(zhì)譜滿足蛋白質(zhì)組學(xué)研究的速度：

　　1、自下而上(Bottom-up)方法，鑒定到更多的低豐度蛋白質(zhì)。

　　2、杰出的ETD/PTR技術(shù)，的翻譯后修飾分析。

　　3、自上而下測序 (Top-Down sequencing; TDS)，zui高序列覆蓋率。