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單細胞RNA測序的技術(shù)流程及應用

時間:2022/7/11閱讀:800
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  單細胞RNA測序是指在單細胞水平上對轉(zhuǎn)錄組進行測序的方法,是目前生物學研究領(lǐng)域的一項熱點技術(shù)。與普通高通量RNA測序相比,單細胞RNA測序可以分辨單個細胞間的生物學差異,識別出易被忽視的罕見細胞群體和細胞亞群。
  
  測序技術(shù)與其他RNA測序的基本原理相似,流程包括細胞制備、文庫構(gòu)建、測序和數(shù)據(jù)分析。其中單細胞制備和單細胞文庫構(gòu)建是重要的環(huán)節(jié),決定了數(shù)據(jù)質(zhì)量、測序通量、精確度、靈敏度和可重復性。單細胞的分離制備技術(shù)目前主要有流式細胞分選術(shù)、免疫磁珠細胞分選技術(shù)、顯微操作法、微流控技術(shù)等。
  
  單細胞RNA測序在皮膚病學研究領(lǐng)域的應用:
  
  目前在皮膚相關(guān)領(lǐng)域使用測序技術(shù)的研究較少。有研究者首先利用這種技術(shù)研究了小鼠正常皮膚表皮的結(jié)構(gòu)和組成,顯示測序技術(shù)在識別皮膚角質(zhì)形成細胞亞群上的強大能力。
  
  利用單細胞RNA測序可發(fā)現(xiàn)固有淋巴樣細胞(ILC)在表皮、真皮和皮下組織這3個部位有特異性的轉(zhuǎn)錄表達譜。表皮ILC可以通過抑制Notch信號通路限制皮脂腺細胞的生長,可能影響皮膚表面具有抗菌活性的游離脂肪酸的分泌,從而限制革蘭陽性菌的共生。
  
  這為研究皮膚稀有的免疫細胞提供了技術(shù)可能,進一步探究了皮膚免疫細胞與皮脂腺、共生菌群的關(guān)系,為皮膚免疫細胞如何調(diào)節(jié)皮膚穩(wěn)態(tài)提供了新的思路。
  
  單細胞RNA測序技術(shù)是研究腫瘤細胞異質(zhì)性和腫瘤微環(huán)境組成的強有力工具,已在乳腺癌、頭頸部鱗狀細胞癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤等疾病中得到了應用。
  
  其對黑素瘤的分型和腫瘤的精準治療具有重要的指導意義,而這些結(jié)果無法通過普通高通量RNA測序得到,證明單細胞RNA測序在研究腫瘤亞群和腫瘤微環(huán)境中具有不能比擬的作用。

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