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分子膠(Molecular Glue)是一類靶向蛋白降解(TPD)的小分子化合物,通過促進E3連接酶與新底物間的相互作用,觸發(fā)泛素-蛋白酶系統(tǒng),精準誘導靶蛋白降解。與蛋白降解靶向嵌合體(PROTAC)技術(shù)相比,分子膠具有分子量小、成藥性高、脫靶效應低等優(yōu)勢[1]。

目前,F(xiàn)DA批準的來那度胺和泊馬度胺等分子膠藥物,在抗腫瘤、免疫調(diào)節(jié)等領域療效顯著,惠及數(shù)百萬患者并創(chuàng)造數(shù)百億美元收入[2]。然而,分子膠研發(fā)仍面臨挑戰(zhàn),如發(fā)現(xiàn)過程缺乏系統(tǒng)性篩選方法,靶點確認和機制研究耗資巨大,限制了其進一步發(fā)展。

圖1. 分子膠作用原理[1]
隨著高通量篩選技術(shù)的不斷發(fā)展,分子膠有望在生物驗證、靶點確認和機制研究領域取得更多突破性進展。HTRF/Lance和Alpha技術(shù)具有均相免洗、操作簡單高效、信號穩(wěn)定、靈敏度高、適用于高通量檢測等優(yōu)勢,已被廣泛用于潛在分子膠靶標和效應蛋白之間親和力的驗證。
Lance及Alpha技術(shù)在分子內(nèi)二價膠親和力測定中的應用
BRD4在多種癌細胞中過表達, 在癌細胞的遷移、代謝和惡性發(fā)展中發(fā)揮重要作用。BRD4作為溴結(jié)構(gòu)域和末端外結(jié)構(gòu)域 (BET) 家族的成員,其特征在于具有兩個串聯(lián)溴結(jié)構(gòu)域(BD1、BD2)。最近的一項描述了一種分子內(nèi)二價膠的降解劑IBG1。IBG1能夠結(jié)合BRD4的兩個串聯(lián)溴結(jié)構(gòu)域,并將BRD4結(jié)合到DCAF16(Cullin RING E3 泛素連接酶)上,從而誘導BRD4的降解。
為了在生化水平驗證IBG1與BRD4和DCAF16的結(jié)合結(jié)構(gòu)域,Oliver等[3]使用Lance Anti-His-Eu、His-BRD4及Cy5標記的DCAF16測定三元復合物的形成,他們發(fā)現(xiàn)IBG1能增強BRD4Tandem*和DCAF16之間的相互作用,而非通過單一BD1或BD2結(jié)構(gòu)域(圖2b,c)。

圖2. IBG1增強BRD4 Tandem結(jié)構(gòu)域和DCAF16之間的相互作用[3]
* Tandem: BRD4包含兩個溴結(jié)構(gòu)域(BD1 和 BD2)的構(gòu)建體
*JQ1: BET 家族溴結(jié)構(gòu)域抑制劑
隨后,他們使用biotinylated-JQ1*, SA-Donor beads, His-BRD4, Nickel Chelate Acceptor beads,構(gòu)建AlphaLISA displacement實驗(圖2e),驗證IBG1競爭性結(jié)合BRD4的能力。
實驗發(fā)現(xiàn)三元復合物BRD4Tandem: IBG1: DCAF16的親和力顯著強于BRD4BD1: IBG1: DCAF16,進一步證實了兩個溴結(jié)構(gòu)域?qū)τ趶秃衔镄纬啥际潜匦璧?。總之,Lance及Alpha的實驗確立了IBG1能夠增強BRD4和DCAF16的親和力,并且需要BRD4兩個溴結(jié)構(gòu)域的存在。

HTRF技術(shù)在分子膠親和力測定中的應用
SMAD4是TGF-β通路的核心介質(zhì),在TGF-β的刺激下,SMAD4與SMAD3等形成復合物,將信號從細胞外傳遞至細胞核,調(diào)控基因表達。SMAD4R361H突變是多種腫瘤中的常見突變,會損害SMAD4和SMAD3之間的相互作用,從而阻斷TGF-β誘導的抗增殖信號傳導。
為了檢測Ro-31-8220和Go-6983對His-SMAD4/SMAD4 R361H和Flag-SMAD3的相互作用的影響,Cong Tang等[4]使用HTRF Anti-FLAG-Tb Donor及Anti-His-d2 Acceptor構(gòu)建了靈敏且可擴展的高通量篩選平臺。Ro-31-8220和Go-6983被鑒定為分子膠,可誘導SMAD4 R361H/SMAD3的相互作用。

圖3. Ro-31-8220和Go-6983被鑒定為分子膠誘導SMAD4 R361H/SMAD3的相互作用[4]

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