氫氣由于熱導率高，當用熱導檢測器時，氫氣和氦氣是的載氣。
當使用FID檢測器時，選擇氮氣作載氣或氦氣作載氣，用氫氣作為檢測用的燃燒氣，但如果用氫氣作載氣，會造成信號基線偏高并且燃燒量過大，檢測器易積水。
另外，由于氫氣分子量小，擴散速度快，當色譜柱較長且溫度高時，組分峰容易擴展變寬，造成分離度下降，所以選擇分子量大的氮氣和氬氣就會好得多。

載氣系統(tǒng)：  

載氣系統(tǒng)包括氣源、氣體凈化、氣體流速控制和流量。其作用是提供穩(wěn)定而可調(diào)節(jié)的氣體流以氣相色譜儀的正常運轉(zhuǎn)。  

(1)    載氣選擇：  

載氣是氣相色譜儀分析中的流動相。載氣的性質(zhì)、凈化程度及流速對氣象色譜柱的分離效能、檢測器的靈敏度、操作條件的穩(wěn)定性均有很大的影響?？勺鳛檩d氣的氣體很多，原則上沒有腐蝕性且不與被分析組分發(fā)生化學反應(yīng)的氣體均可作為載氣，常用的是氦氣、氫氣、氬氣、氮氣。  

(2)    載氣凈化：  

載氣凈化的目的是基線的穩(wěn)定性及提高儀器的靈敏度。凈化程度主要取決于使用的檢測器及分析要求(常量或者微量分析)，對一般檢測器，進化是使用一根裝有硅膠、份子篩、活性炭的凈化管，載氣經(jīng)過時可以除去微量的水分及油等。  

(3)    流速的控制與測定：  

在氣相色譜中對流速的控制要求很高，主要是操作條件的穩(wěn)定性。由穩(wěn)壓閥、針閥、穩(wěn)流閥相互配合以完成流速的控制。柱前流速由轉(zhuǎn)子流量計指示、柱后流速用皂膜流量計測量。