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實時熒光定量PCR(qPCR)技術(shù)基本原理介紹
閱讀:101 發(fā)布時間:2025-5-7實時熒光定量PCR(Real-time quantitative PCR, qPCR)是一種在PCR反應(yīng)體系中加入熒光標(biāo)記物,通過實時監(jiān)測每個PCR循環(huán)中的熒光信號變化,實現(xiàn)對起始模板量的定量分析的技術(shù)。這項技術(shù)由美國Applied Biosystems公司在1995年推出,標(biāo)志著PCR技術(shù)從定性分析到定量分析的飛躍。
實時熒光定量PCR(qPCR)的基本原理包括三個主要階段,這些階段反映了PCR擴增過程中的熒光信號變化:
1、基線期:在PCR反應(yīng)開始時,熒光信號幾乎不變,主要是因為背景熒光的存在掩蓋了PCR產(chǎn)物的熒光信號。這一階段的熒光信號變化不大,接近一條直線,用于設(shè)置基線。
2、指數(shù)期:隨著PCR循環(huán)的進(jìn)行,目標(biāo)DNA序列被指數(shù)級擴增,熒光信號隨之增加。這一階段熒光信號呈指數(shù)增長,PCR產(chǎn)物量與起始模板量呈線性關(guān)系,是進(jìn)行定量分析的理想階段。
3、平臺期:當(dāng)PCR反應(yīng)接近完成時,由于DNA聚合酶活性下降、底物耗盡或抑制物積累,擴增效率降低,熒光信號的增加趨于平緩,最終停止。這一階段熒光信號不再顯著增加,PCR產(chǎn)物達(dá)到飽和狀態(tài)。
在指數(shù)期,通過設(shè)定熒光閾值(閾值循環(huán)數(shù),Ct值),可以準(zhǔn)確地對樣品中的初始模板量進(jìn)行定量分析。Ct值越小,說明初始模板量越大。利用標(biāo)準(zhǔn)曲線,可以將Ct值轉(zhuǎn)換為模板的起始拷貝數(shù),實現(xiàn)對目標(biāo)序列的定量檢測。
實時熒光定量PCR技術(shù)中有幾個重要的概念,包括擴增曲線、基線、熒光閾值和域值循環(huán)數(shù)。
1、擴增曲線(amplification curve): 是在實時熒光定量PCR中監(jiān)測到的熒光信號隨著循環(huán)數(shù)變化而繪制的一條曲線。在進(jìn)行PCR反應(yīng)過程中,通過檢測系統(tǒng)對PCR管內(nèi)的樣品進(jìn)行實時檢測,最后將熒光信號值通過成像技術(shù)顯現(xiàn)在計算機上。正常的擴增曲線包括四個階段:基線期、指數(shù)增長期、線性增長期、平臺期。
2、基線(baseline):是背景曲線的一段,在擴增反應(yīng)的最初數(shù)個循環(huán)里熒光信號變化不大,接近一條直線。
3、熒光閾值(threshold):是在熒光擴增曲線指數(shù)增長期設(shè)定的一個熒光強度標(biāo)準(zhǔn)(即PCR擴增產(chǎn)物量的標(biāo)準(zhǔn))。熒光閾值可以設(shè)定在PCR擴增的指數(shù)期。
4、閾值循環(huán)數(shù):表示每個PCR反應(yīng)管內(nèi)熒光信號達(dá)到設(shè)定的熒光閾值所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù),研究表明,各模板的CT值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關(guān)系,即起始拷貝數(shù)越多,CT值越小;起始拷貝數(shù)越少,CT值越大。我們利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可做出以起始拷貝數(shù)的對數(shù)為橫坐標(biāo),CT值為縱坐標(biāo)的一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。只要獲得未知模板的CT值,即從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計算出該模板的起始拷貝數(shù)。