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豬傳染性胃腸炎/豬流行性腹瀉病毒/豬A組輪狀病毒PCR試劑盒
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上海晅科生物科技有限公司
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資料類型
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【產(chǎn)品名稱】
商品名稱:豬傳染性胃腸炎/豬流行性腹瀉病毒/豬 A 組輪狀病毒(TGEV/PEDV/PRV-A)核酸檢測(cè)試劑盒(三重?zé)晒?PCR 法)
Name: Transmissible Gastroenteritis Virus , Porcine Epidemic Diarrhea Virus and Porcine Rotavirus Type A Detection Kit(Real-Time PCR Method)
【包裝規(guī)格】25T/盒、50T/盒
【預(yù)期用途】
豬傳染性胃腸炎(TGEV)、豬流行性腹瀉(PEDV)及豬 A 組輪狀病毒(PRV)感染,是豬場(chǎng)常見的病毒性腹瀉,此三種病毒性腹瀉造成了豬場(chǎng)飼料報(bào)酬降低、藥物和人力增加等重大損失,是危害豬場(chǎng)最嚴(yán)重的 疾病之一。三者均為高度接觸性腸道疾病,具有相似的臨床表現(xiàn)及傳染途徑,其鑒別診斷通常需要借助實(shí)驗(yàn) 室診斷技術(shù)。PCR 技術(shù)具有特異性強(qiáng),敏感度高,可進(jìn)行活體診斷等特點(diǎn),在實(shí)驗(yàn)室診斷中具有較突出的優(yōu)勢(shì)。本試劑盒適用于檢測(cè)標(biāo)本中的豬傳染性胃腸炎、豬流行性腹瀉病毒和豬 A 組輪狀病毒,適用于豬傳染性胃腸炎、豬流行性腹瀉病毒、豬 A 組輪狀病毒感染的輔助診斷及流行病學(xué)調(diào)查。
【檢驗(yàn)原理】
本試劑盒用豬傳染性胃腸炎、豬流行性腹瀉病毒、豬 A 組輪狀病毒的特異性引物和探針,用一步法熒光RT-PCR 技術(shù)對(duì)豬傳染性胃腸炎、豬流行性腹瀉病毒、豬輪狀病毒 RNA 進(jìn)行體外擴(kuò)增檢測(cè),用于科研實(shí)驗(yàn)中對(duì)可疑感染者的病原學(xué)檢測(cè)。
【試劑組成】
包裝規(guī)格25T/盒50T/盒
TGEV/PEDV/PRV-A 反應(yīng)液500μL×1 管500μL×2 管
酶液25μL×1 管50μL×1 管
TGEV/PEDV/PRV-A 陽(yáng)性質(zhì)控品50μL ×1 管50μL ×1 管
陰性質(zhì)控品250μL ×1 管250μL ×1 管
說(shuō)明:不同批號(hào)的試劑盒組分不可交互使用。
【儲(chǔ)存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運(yùn)輸、反復(fù)凍融次數(shù)不超過(guò) 5,有效期 9 個(gè)月。
【適用儀器】
ABI 7300 、7500 、ABI Stepone/Stepone Plus 、安捷倫 MX3000P/3005P 、Roche Gene 6000 、Roche LC480 、
Bio-RadCFX96 等熒光定量 PCR 檢測(cè)儀。
【標(biāo)本采集】
剖檢豬取腸內(nèi)容物和腸系膜淋巴結(jié);待檢活豬,取排泄物,于離心管中。
【保存和運(yùn)輸】
上述標(biāo)本短期內(nèi)可保存于-20℃,長(zhǎng)期保存可置-70℃,但不能超過(guò) 6 個(gè)月,標(biāo)本運(yùn)送應(yīng)采用 2~8℃冰袋運(yùn)輸,嚴(yán)禁反復(fù)凍融。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
組織:分別從腸系膜淋巴結(jié)的 3 個(gè)不同位置取樣,稱取樣品約 1g,用手術(shù)剪剪碎混勻,再稱取 0.5g 于研磨器中研磨,加入 1.5mL 生理鹽水繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至 1.5mL 滅菌離心管中,8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中;排泄物:取 0.5g 于 1.5mL 滅菌離心管中,加入 1mL 生理鹽水渦旋振蕩, 8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中。
1.2核酸提取
推薦采用公司生產(chǎn)的核酸提取或純化試劑(磁珠法或離心柱法)進(jìn)行核酸提取,請(qǐng)按 照試劑說(shuō)明書進(jìn)行操作。
2.試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
根據(jù)待檢測(cè)樣本總數(shù),設(shè)所需要的 PCR 反應(yīng)管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對(duì)照+1 管陽(yáng)性對(duì)照;反應(yīng)管數(shù)每滿 10 份,多配制 1 份),每測(cè)試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑TGEV/PEDV/PRV-A 反應(yīng)液酶液
用量20μL1μL
將混合好的測(cè)試反應(yīng)液分裝到 PCR 反應(yīng)管中,21μL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的核酸、陽(yáng)性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取 4μL,分別加入相應(yīng)的反應(yīng)管中,蓋好管蓋,混勻, 短暫離心。
4.PCR 擴(kuò)增(核酸擴(kuò)增區(qū))
4.1將待檢測(cè)反應(yīng)管置于熒光定量 PCR 儀反應(yīng)槽內(nèi);
4.2設(shè)置好通道、樣品信息,反應(yīng)體系設(shè)置為 25μL;熒光通道選擇: 檢測(cè)通道(Reporter Dye)FAM、TEXAS RED、CY5, 淬滅通道(Quencher Dye)ABI 系列儀器請(qǐng)勿選擇 ROX 參比熒光,選擇 None 即可。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置:
步驟循環(huán)數(shù)溫度時(shí)間收集熒光信號(hào)
11cycle42℃20min否
21 cycle95℃10min否
340 cycle94℃15sec否
55℃30sec是
5.結(jié)果分析判定
5.1結(jié)果分析條件設(shè)定
設(shè)置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機(jī)器自動(dòng)分析的結(jié)果分析,當(dāng)曲線出現(xiàn)整體傾斜時(shí),根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié) Baseline 的 start 值(一般可在 3~15 范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、stop 值(一般可在 5~20 范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動(dòng)閾值線至高于陰性對(duì)照),重新分析結(jié)果。
5.2結(jié)果判斷
FAM 通道為豬流行性腹瀉病毒檢測(cè)結(jié)果,CY5 通道為豬傳染性胃腸炎病毒檢測(cè)結(jié)果,TEXAS RED 通道為豬 A 組輪狀病毒檢測(cè)結(jié)果
陽(yáng)性:檢測(cè)通道 Ct 值≤35,且曲線有明顯的指數(shù)增長(zhǎng)曲線;
可疑:檢測(cè)通道 35<Ct 值≤38,建議重復(fù)檢測(cè),如果檢測(cè)通道仍為 35<Ct 值≤38,且曲線有明顯的增長(zhǎng)曲線,判定為陽(yáng)性,否則為陰性;
陰性:樣本檢測(cè)結(jié)果 Ct 值>38 或無(wú) Ct 值。
6.質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
陰性質(zhì)控品:Ct>38 或無(wú) Ct 值顯示;
陽(yáng)性質(zhì)控品:擴(kuò)增曲線有明顯指數(shù)生長(zhǎng)期,且 Ct 值≤32; 以上條件應(yīng)同時(shí)滿足,否則實(shí)驗(yàn)視為無(wú)效。
7.檢測(cè)方法的局限性
1.樣本檢測(cè)結(jié)果與樣本收集、處理、運(yùn)送以及保存質(zhì)量有關(guān);
2.樣本提取過(guò)程中沒有控制好交叉污染,會(huì)出現(xiàn)假陽(yáng)性結(jié)果;
3.陽(yáng)性對(duì)照、擴(kuò)增產(chǎn)物泄漏,會(huì)導(dǎo)致假陽(yáng)性結(jié)果;
4.病原體在流行過(guò)程中基因突變、重組,會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
5.不同的提取方法存在提取效率差異,會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
6.試劑運(yùn)輸,保存不當(dāng)或試劑配制不準(zhǔn)確引起的試劑檢測(cè)效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測(cè)不準(zhǔn)確的結(jié)果;
7.本檢測(cè)結(jié)果僅供參考,如須確診請(qǐng)結(jié)合臨床癥狀以及其他檢測(cè)手段。
【注意事項(xiàng)】
1.所有操作嚴(yán)格按照說(shuō)明書進(jìn)行;
2.試劑盒內(nèi)各種組分使用前應(yīng)自然融化,完-全混勻并短暫離心;
3.反應(yīng)液應(yīng)避光保存;
4.反應(yīng)中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)專用工作服;
6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進(jìn)行,以免交叉污染;
7.實(shí)驗(yàn)完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺(tái)和移液器;
8.試劑盒里所有物品應(yīng)視為污染物對(duì)待,并按照《微生物生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全通則》進(jìn)行處理。