摘要:CSHL植物遺傳學(xué)家Rob Martienssen與結(jié)構(gòu)生物學(xué)家Leemor john - tor合作,確定了控制植物表觀遺傳的確切機制。
當(dāng)生物體將其基因傳遞給后代時,它們包含的不僅僅是DNA中闡明的代碼。有些還會傳遞化學(xué)標(biāo)記,指導(dǎo)細(xì)胞如何使用該密碼。這些標(biāo)記傳遞給后代被稱為表觀遺傳。這在植物中尤其常見。因此,這里的重大發(fā)現(xiàn)可能會對農(nóng)業(yè)、食品供應(yīng)和環(huán)境產(chǎn)生影響。
冷泉港實驗室(CSHL)教授和HHMI調(diào)查員Rob Martienssen和Leemor Joshua-Tor一直在研究植物如何傳遞使轉(zhuǎn)座子不活躍的標(biāo)記。轉(zhuǎn)座子也被稱為跳躍基因。當(dāng)它們被激活時,它們可以四處移動并破壞其他基因。為了使它們沉默并保護(hù)基因組,細(xì)胞在特定的DNA位點上添加了調(diào)節(jié)標(biāo)記。這個過程被稱為甲基化。
Martienssen和Joshua-Tor現(xiàn)在已經(jīng)展示了蛋白質(zhì)DDM1如何為在新DNA鏈上放置這些標(biāo)記的酶讓路。植物細(xì)胞需要DDM1,因為它們的DNA被緊密包裝。為了保持基因組緊密有序,細(xì)胞將DNA包裹在一種叫做組蛋白的蛋白質(zhì)上?!暗@阻礙了各種重要酶接近DNA,"Martienssen解釋說。在甲基化發(fā)生之前,“你必須移除或滑動組蛋白。"
Martienssen和前CSHL同事Eric Richards在30年前首(空)次發(fā)現(xiàn)了DDM1。從那時起,研究人員已經(jīng)了解到它沿著包裝蛋白滑動DNA以暴露需要甲基化的位點。Martienssen將這種運動比作沿著繩子滑行的溜溜球。他解釋說,組蛋白“可以在DNA上上下移動,一次暴露部分DNA,但永遠(yuǎn)不會脫落。"
通過遺傳和生化實驗,Martienssen精確地確定了DDM1取代的組蛋白。Joshua-Tor使用低溫電子顯微鏡捕捉了這種酶與DNA和相關(guān)包裝蛋白相互作用的詳細(xì)圖像。他們能夠看到DDM1如何抓住特定的組蛋白來重塑包裝的DNA。Joshua-Tor說:“將DDM1聯(lián)系在一起的一個意想不到的紐帶,與多年前發(fā)現(xiàn)的第一個突變相對應(yīng)。"
實驗還揭示了DDM1對某些組蛋白的親和力如何在幾代之間保持表觀遺傳控制。研究小組發(fā)現(xiàn),只有在花粉中發(fā)現(xiàn)的一種組蛋白對DDM1具有抗性,并在細(xì)胞分裂過程中充當(dāng)占位符。Martienssen說:“它會記住植物發(fā)育過程中組蛋白的位置,并將這種記憶保留到下一代。"
這里可能不只有植物。人類也依賴DDM1樣蛋白來維持DNA甲基化。這項新發(fā)現(xiàn)可能有助于解釋這些蛋白質(zhì)如何保持我們基因組的功能和完整性。