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NGS工作流程可以分為這三步

閱讀：3108 發(fā)布時間：2021-11-18
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　　NGS工作流程通常從樣品制備步驟開始，其成功與否對確?？煽康臏y序結(jié)果至關(guān)重要。為了獲得足夠數(shù)量和質(zhì)量的核酸，需要對樣品進(jìn)行有效和均勻的研磨。機(jī)械裂解，更具體地說是珠磨式技術(shù)，被認(rèn)為是樣品研磨均勻化的黃金標(biāo)準(zhǔn)。

　　NGS工作流程可以分為這三步：
　　文庫制備：為了節(jié)省資源，可以將多個文庫混合在一起，在同一運(yùn)行中進(jìn)行測序——該過程稱為多重分析。接頭連接過程中，標(biāo)簽序列（或說“條形碼”）會添加到每個文庫。這些條形碼可以在數(shù)據(jù)分析過程中區(qū)分文庫。這步是為獲取足夠量的/目的的/前期適合上機(jī)測序而標(biāo)準(zhǔn)處理DNA。其程序主要有：片段化，連接，擴(kuò)增。
　　測序：在邊合成邊測序（SBS）過程中，化學(xué)修飾的核苷酸會通過天然的互補(bǔ)性與DNA模板鏈結(jié)合。每個核苷酸都有一個熒光標(biāo)記和一個可逆終止子，后者可以阻止下一個堿基的摻入。熒光信號可以指示出加入的核苷酸種類，終止子被切割后，下一個堿基才可以繼續(xù)結(jié)合。其實(shí)就是把把采集到的樣品分離提純成需要的基因組DNA，再把這些DNA打成小片段，然后再在這些DNA小片段兩頭接上識別標(biāo)記和測序接頭，最后再通過基因捕獲技術(shù)篩選出目的DNA，根據(jù)需求PCR擴(kuò)增。然后，就可以上機(jī)測序了。上機(jī)測序的過程就是讀取這些。
　　數(shù)據(jù)分析：可以使用直觀的數(shù)據(jù)分析應(yīng)用程序來分析NGS數(shù)據(jù)，無需進(jìn)行生物信息學(xué)培訓(xùn)或另外雇傭?qū)嶒?yàn)室人員。這些工具可以進(jìn)行序列比對、變異檢出、數(shù)據(jù)可視化或解讀。

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